seq1 = pF1KB7811.tfa, 1587 bp
seq2 = pF1KB7811/gi568815590f_144191758.tfa (gi568815590f:144191758_144414327), 222570 bp

>pF1KB7811 1587
>gi568815590f:144191758_144414327 (Chr8)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-226  (117149-117257)   100% ->
227-363  (117698-117834)   100% ->
364-488  (118015-118139)   100% ->
489-564  (119417-119492)   100% ->
565-626  (119564-119625)   100% ->
627-723  (119748-119844)   100% ->
724-860  (119943-120079)   100% ->
861-1142  (120206-120487)   100% ->
1143-1248  (121754-121859)   100% ->
1249-1314  (122089-122154)   100% ->
1315-1384  (122228-122297)   100% ->
1385-1587  (122368-122570)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATCTGCCCGTGGGCCCCGGCGCGGCGGGGCCCAGCAACGTCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATCTGCCCGTGGGCCCCGGCGCGGCGGGGCCCAGCAACGTCCCGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCTGACCAAGCTGTGGACCCTCGTGAGCGACCCGGACACCGACGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCTGACCAAGCTGTGGACCCTCGTGAGCGACCCGGACACCGACGCGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCATCTGCTGGAGCCCG         AGCGGGAACAGCTTCCACGTGTTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 TCATCTGCTGGAGCCCGGTG...CAGAGCGGGAACAGCTTCCACGTGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCAGGGCCAGTTTGCCAAGGAGGTGCTGCCCAAGTACTTCAAGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117173 GACCAGGGCCAGTTTGCCAAGGAGGTGCTGCCCAAGTACTTCAAGCACAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAACATGGCCAGCTTCGTGCGGCAGCTCAACATGT         ATGGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 117223 CAACATGGCCAGCTTCGTGCGGCAGCTCAACATGTGTG...CAGATGGCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCCGGAAAGTGGTCCACATCGAGCAGGGCGGCCTGGTCAAGCCAGAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117704 TCCGGAAAGTGGTCCACATCGAGCAGGGCGGCCTGGTCAAGCCAGAGAGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GACGACACGGAGTTCCAGCACCCATGCTTCCTGCGTGGCCAGGAGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117754 GACGACACGGAGTTCCAGCACCCATGCTTCCTGCGTGGCCAGGAGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTTGAGAACATCAAGAGGAAAGTGACCAGT         GTGTCCACCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 117804 CCTTGAGAACATCAAGAGGAAAGTGACCAGTGTG...CAGGTGTCCACCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGAAGAGTGAAGACATAAAGATCCGCCAGGACAGCGTCACCAAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118025 TGAAGAGTGAAGACATAAAGATCCGCCAGGACAGCGTCACCAAGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACGGACGTGCAGCTGATGAAGGGGAAGCAGGAGTGCATGGACTCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118075 ACGGACGTGCAGCTGATGAAGGGGAAGCAGGAGTGCATGGACTCCAAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CCTGGCCATGAAGCA         TGAGAATGAGGCTCTGTGGCGGGAGG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 118125 CCTGGCCATGAAGCAGTA...CAGTGAGAATGAGGCTCTGTGGCGGGAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGGCCAGCCTTCGGCAGAAGCATGCCCAGCAACAGAAAGTCGTCAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119443 TGGCCAGCCTTCGGCAGAAGCATGCCCAGCAACAGAAAGTCGTCAACAAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565          CTCATTCAGTTCCTGATCTCACTGGTGCAGTCAAACCGGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119493 GTG...CAGCTCATTCAGTTCCTGATCTCACTGGTGCAGTCAAACCGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCTGGGGGTGAAGAGAAAGAT         CCCCCTGATGCTGAACGACA
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 119605 CCTGGGGGTGAAGAGAAAGATGTG...CAGCCCCCTGATGCTGAACGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GTGGCTCAGCACATTCCATGCCCAAGTATAGCCGGCAGTTCTCCCTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119768 GTGGCTCAGCACATTCCATGCCCAAGTATAGCCGGCAGTTCTCCCTGGAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CACGTCCACGGCTCGGGCCCCTACTCG         GCCCCCTCCCCAGC
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 119818 CACGTCCACGGCTCGGGCCCCTACTCGGTG...CAGGCCCCCTCCCCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CTACAGCAGCTCCAGCCTCTACGCCCCTGATGCTGTGGCCAGCTCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119957 CTACAGCAGCTCCAGCCTCTACGCCCCTGATGCTGTGGCCAGCTCTGGAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCATCATCTCCGACATCACCGAGCTGGCTCCTGCCAGCCCCATGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120007 CCATCATCTCCGACATCACCGAGCTGGCTCCTGCCAGCCCCATGGCCTCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCCGGCGGGAGCATAGACGAGAG         GCCCCTATCCAGCAGCCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 120057 CCCGGCGGGAGCATAGACGAGAGGTG...CAGGCCCCTATCCAGCAGCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 CCTGGTGCGTGTCAAGGAGGAGCCCCCCAGCCCGCCTCAGAGCCCCCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120224 CCTGGTGCGTGTCAAGGAGGAGCCCCCCAGCCCGCCTCAGAGCCCCCGGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TAGAGGAGGCGAGTCCCGGGCGCCCATCTTCCGTGGACACCCTCTTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120274 TAGAGGAGGCGAGTCCCGGGCGCCCATCTTCCGTGGACACCCTCTTGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CCGACCGCCCTCATTGACTCCATCCTGCGGGAGAGTGAACCTGCCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120324 CCGACCGCCCTCATTGACTCCATCCTGCGGGAGAGTGAACCTGCCCCCGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 CTCCGTCACAGCCCTCACGGACGCCAGGGGCCACACGGACACCGAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120374 CTCCGTCACAGCCCTCACGGACGCCAGGGGCCACACGGACACCGAGGGCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 GGCCTCCCTCCCCCCCGCCCACCTCCACCCCTGAAAAGTGCCTCAGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120424 GGCCTCCCTCCCCCCCGCCCACCTCCACCCCTGAAAAGTGCCTCAGCGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GCCTGCCTGGACAA         GAATGAGCTCAGTGACCACTTGGATGC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 120474 GCCTGCCTGGACAAGTG...CAGGAATGAGCTCAGTGACCACTTGGATGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TATGGACTCCAACCTGGATAACCTGCAGACCATGCTGAGCAGCCACGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121781 TATGGACTCCAACCTGGATAACCTGCAGACCATGCTGAGCAGCCACGGCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCAGCGTGGACACCAGTGCCCTGCTGGAC         CTGTTCAGCCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 121831 TCAGCGTGGACACCAGTGCCCTGCTGGACGTG...CAGCTGTTCAGCCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 TCGGTGACCGTGCCCGACATGAGCCTGCCTGACCTTGACAGCAGCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122101 TCGGTGACCGTGCCCGACATGAGCCTGCCTGACCTTGACAGCAGCCTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAGT         ATCCAAGAGCTCCTGTCTCCCCAGGAGCCCCCCAGGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122151 CAGTGTG...CAGATCCAAGAGCTCCTGTCTCCCCAGGAGCCCCCCAGGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CTCCCGAGGCAGAGAACAGCAGCCCGGATTCAG         GGAAGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 122265 CTCCCGAGGCAGAGAACAGCAGCCCGGATTCAGGTG...CAGGGAAGCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393 CTGGTGCACTACACAGCGCAGCCGCTGTTCCTGCTGGACCCCGGCTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122376 CTGGTGCACTACACAGCGCAGCCGCTGTTCCTGCTGGACCCCGGCTCCGT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1443 GGACACCGGGAGCAACGACCTGCCGGTGCTGTTTGAGCTGGGAGAGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122426 GGACACCGGGAGCAACGACCTGCCGGTGCTGTTTGAGCTGGGAGAGGGCT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCTACTTCTCCGAAGGGGACGGCTTCGCCGAGGACCCCACCATCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122476 CCTACTTCTCCGAAGGGGACGGCTTCGCCGAGGACCCCACCATCTCCCTG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1543 CTGACAGGCTCGGAGCCTCCCAAAGCCAAGGACCCCACTGTCTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122526 CTGACAGGCTCGGAGCCTCCCAAAGCCAAGGACCCCACTGTCTCC