seq1 = pF1KB7810.tfa, 1785 bp
seq2 = pF1KB7810/gi568815592f_151707913.tfa (gi568815592f:151707913_152198963), 491051 bp

>pF1KB7810 1785
>gi568815592f:151707913_152198963 (Chr6)

1-452  (100001-100452)   99% ->
453-643  (134685-134875)   100% ->
644-760  (172743-172859)   99% ->
761-1096  (236261-236596)   100% ->
1097-1235  (303744-303882)   100% ->
1236-1369  (353079-353212)   100% ->
1370-1553  (386473-386656)   100% ->
1554-1785  (390820-391051)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCATGACCCTCCACACCAAAGCATCCGGGATGGCCCTACTGCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCATGACCCTCCACACCAAAGCATCTGGGATGGCCCTACTGCATCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GATCCAAGGGAACGAGCTGGAGCCCCTGAACCGTCCGCAGCTCAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GATCCAAGGGAACGAGCTGGAGCCCCTGAACCGTCCGCAGCTCAAGATCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTGGAGCGGCCCCTGGGCGAGGTGTACCTGGACAGCAGCAAGCCCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTGGAGCGGCCCCTGGGCGAGGTGTACCTGGACAGCAGCAAGCCCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTGTACAACTACCCCGAGGGCGCCGCCTACGAGTTCAACGCCGCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTGTACAACTACCCCGAGGGCGCCGCCTACGAGTTCAACGCCGCGGCCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCAACGCGCAGGTCTACGGTCAGACCGGCCTCCCCTACGGCCCCGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCAACGCGCAGGTCTACGGTCAGACCGGCCTCCCCTACGGCCCCGGGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CTGAGGCTGCGGCGTTCGGCTCCAACGGCCTGGGGGGTTTCCCCCCACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CTGAGGCTGCGGCGTTCGGCTCCAACGGCCTGGGGGGTTTCCCCCCACTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AACAGCGTGTCTCCGAGCCCGCTGATGCTACTGCACCCGCCGCCGCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AACAGCGTGTCTCCGAGCCCGCTGATGCTACTGCACCCGCCGCCGCAGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTCGCCTTTCCTGCAGCCCCACGGCCAGCAGGTGCCCTACTACCTGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTCGCCTTTCCTGCAGCCCCACGGCCAGCAGGTGCCCTACTACCTGGAGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGAGCCCAGCGGCTACACGGTGCGCGAGGCCGGCCCGCCGGCATTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGAGCCCAGCGGCTACACGGTGCGCGAGGCCGGCCCGCCGGCATTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AG         GCCAAATTCAGATAATCGACGCCAGGGTGGCAGAGAAAG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AGGTA...CAGGCCAAATTCAGATAATCGACGCCAGGGTGGCAGAGAAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ATTGGCCAGTACCAATGACAAGGGAAGTATGGCTATGGAATCTGCCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134724 ATTGGCCAGTACCAATGACAAGGGAAGTATGGCTATGGAATCTGCCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGACTCGCTACTGTGCAGTGTGCAATGACTATGCTTCAGGCTACCATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134774 AGACTCGCTACTGTGCAGTGTGCAATGACTATGCTTCAGGCTACCATTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GGAGTCTGGTCCTGTGAGGGCTGCAAGGCCTTCTTCAAGAGAAGTATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134824 GGAGTCTGGTCCTGTGAGGGCTGCAAGGCCTTCTTCAAGAGAAGTATTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 AG         GACATAACGACTATATGTGTCCAGCCACCAACCAGTGCA
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134874 AGGTA...TAGGACATAACGACTATATGTGTCCAGCCACCAACCAGTGCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CCATTGATAAAAACAGGAGGAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGGCTCCGCAAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 172782 CCATTGATAAAAACAGGAGGAAGAGCTGCCAGGCCTGCCGGCTCCGTAAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TGCTACGAAGTGGGAATGATGAAAGGTG         GGATACGAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 172832 TGCTACGAAGTGGGAATGATGAAAGGTGGTA...CAGGGATACGAAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCGAAGAGGAGGGAGAATGTTGAAACACAAGCGCCAGAGAGATGATGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236274 CCGAAGAGGAGGGAGAATGTTGAAACACAAGCGCCAGAGAGATGATGGGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 AGGGCAGGGGTGAAGTGGGGTCTGCTGGAGACATGAGAGCTGCCAACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236324 AGGGCAGGGGTGAAGTGGGGTCTGCTGGAGACATGAGAGCTGCCAACCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 TGGCCAAGCCCGCTCATGATCAAACGCTCTAAGAAGAACAGCCTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236374 TGGCCAAGCCCGCTCATGATCAAACGCTCTAAGAAGAACAGCCTGGCCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GTCCCTGACGGCCGACCAGATGGTCAGTGCCTTGTTGGATGCTGAGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236424 GTCCCTGACGGCCGACCAGATGGTCAGTGCCTTGTTGGATGCTGAGCCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CGATACTCTATTCCGAGTATGATCCTACCAGACCCTTCAGTGAAGCTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236474 CGATACTCTATTCCGAGTATGATCCTACCAGACCCTTCAGTGAAGCTTCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 ATGATGGGCTTACTGACCAACCTGGCAGACAGGGAGCTGGTTCACATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 236524 ATGATGGGCTTACTGACCAACCTGGCAGACAGGGAGCTGGTTCACATGAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 CAACTGGGCGAAGAGGGTGCCAG         GCTTTGTGGATTTGACCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 236574 CAACTGGGCGAAGAGGGTGCCAGGTA...CAGGCTTTGTGGATTTGACCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 TCCATGATCAGGTCCACCTTCTAGAATGTGCCTGGCTAGAGATCCTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 303762 TCCATGATCAGGTCCACCTTCTAGAATGTGCCTGGCTAGAGATCCTGATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 ATTGGTCTCGTCTGGCGCTCCATGGAGCACCCAGGGAAGCTACTGTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 303812 ATTGGTCTCGTCTGGCGCTCCATGGAGCACCCAGGGAAGCTACTGTTTGC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 TCCTAACTTGCTCTTGGACAG         GAACCAGGGAAAATGTGTAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 303862 TCCTAACTTGCTCTTGGACAGGTA...TAGGAACCAGGGAAAATGTGTAG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 AGGGCATGGTGGAGATCTTCGACATGCTGCTGGCTACATCATCTCGGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 353099 AGGGCATGGTGGAGATCTTCGACATGCTGCTGGCTACATCATCTCGGTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 CGCATGATGAATCTGCAGGGAGAGGAGTTTGTGTGCCTCAAATCTATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 353149 CGCATGATGAATCTGCAGGGAGAGGAGTTTGTGTGCCTCAAATCTATTAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 TTTGCTTAATTCTG         GAGTGTACACATTTCTGTCCAGCACCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 353199 TTTGCTTAATTCTGGTG...CAGGAGTGTACACATTTCTGTCCAGCACCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1397 TGAAGTCTCTGGAAGAGAAGGACCATATCCACCGAGTCCTGGACAAGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386500 TGAAGTCTCTGGAAGAGAAGGACCATATCCACCGAGTCCTGGACAAGATC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 ACAGACACTTTGATCCACCTGATGGCCAAGGCAGGCCTGACCCTGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386550 ACAGACACTTTGATCCACCTGATGGCCAAGGCAGGCCTGACCCTGCAGCA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 GCAGCACCAGCGGCTGGCCCAGCTCCTCCTCATCCTCTCCCACATCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386600 GCAGCACCAGCGGCTGGCCCAGCTCCTCCTCATCCTCTCCCACATCAGGC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 ACATGAG         TAACAAAGGCATGGAGCATCTGTACAGCATGAAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 386650 ACATGAGGTG...CAGTAACAAAGGCATGGAGCATCTGTACAGCATGAAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 TGCAAGAACGTGGTGCCCCTCTATGACCTGCTGCTGGAGATGCTGGACGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390854 TGCAAGAACGTGGTGCCCCTCTATGACCTGCTGCTGGAGATGCTGGACGC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 CCACCGCCTACATGCGCCCACTAGCCGTGGAGGGGCATCCGTGGAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390904 CCACCGCCTACATGCGCCCACTAGCCGTGGAGGGGCATCCGTGGAGGAGA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 CGGACCAAAGCCACTTGGCCACTGCGGGCTCTACTTCATCGCATTCCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 390954 CGGACCAAAGCCACTTGGCCACTGCGGGCTCTACTTCATCGCATTCCTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1738 CAAAAGTATTACATCACGGGGGAGGCAGAGGGTTTCCCTGCCACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 391004 CAAAAGTATTACATCACGGGGGAGGCAGAGGGTTTCCCTGCCACGGTC