seq1 = pF1KB7808.tfa, 1785 bp
seq2 = pF1KB7808/gi568815579f_11730282.tfa (gi568815579f:11730282_11932961), 202680 bp

>pF1KB7808 1785
>gi568815579f:11730282_11932961 (Chr19)

1-130  (100000-100128)   98% ->
131-191  (100336-100396)   100% ->
192-1785  (101087-102680)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGA
        |-||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100000 A GGACCCAGTGGCTTTTAAGGATGTGGCTGTGAACTTCACCCAGGAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100049 GTGGGCTTTGCTGGATATTTCCCAGAGGAAACTCTACAGGGAAGTGATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTATAG         GAAAAAGGTGG
        |||||||||||||||||||||||||| |||>>>...>>>|||||||||||
 100099 TGGAAACTTTCAGGAACCTGACCTCTTTAGGTA...TAGGAAAAAGGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100347 AAAGACCAGAACATTGAATATGAGCACCAAAACCCCAGGAGAAACTTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192          GAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100397 GTA...CAGGAGTCTCATAGAAGAAAAAGTCAATGAAATTAAAGATGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101128 GTCATTGTGGAGAAACTTTTACCCCAGTTCCAGATGACAGACTGAACTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101178 CAGGAGAAGAAAGCTTCTCCTGAAGTAAAATCATGTGAAAGCTTTGTGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAGCATCAGAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
 101228 TGGAGAAGTTGGCCTAGGTAACTCATCTTTTAATATGAACATCAGAGGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101278 ACATTGGACACAAGGCATATGAGTATCAGGAATATGGACCAAAGCCATGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101328 AAGTGTCAACAACCTAAAAAAGCCTTCAGATACCGCCCCTCCTTTAGAAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 ACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101378 ACAAGAAAGGGATCACACTGGAGAGAAACCCAATGCTTGTAAAGTATGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 GAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101428 GAAAAACCTTTATTTCCCATTCAAGTGTTCGAAGACACATGGTAATGCAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCCTTCCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 101478 AGTGGGGATGGACCTTATAAATGTAAGTTTTGTGGGAAAGCATTCCATTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101528 TCTCAGATTATATCTTATCCATGAAAGAATTCACACTGGAGAGAAACCAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 GTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101578 GTGAATGTAAACAGTGTGGTAAATCCTTTAGTTATTCTGCTACCCATCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 101628 ATACATAAAAGAACTCACACTGGAGAAAAGCCTTATGAATATCAGGAGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 TGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGGATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101678 TGGGAAAGCATTTCATAGTCCCAGATCCTATCGTAGACATGAAAGGATTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101728 ACATGGGAGAAAAGGCTTATCAATGTAAGGAATGTGGAAAAGCATTCACG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 TGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101778 TGTCCCCGTTATGTTCGTATACATGAAAGGACCCACTCTAGGAAAAATCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101828 CTATGAATGTAAGCAGTGTGGGAAAGCATTATCCTCTCTTACAAGTTTTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101878 AAACACACGTAAGATTGCACTCTGGAGAAAGACCTTATGAATGTAAGATA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 TGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101928 TGTGGAAAAGACTTTTGTTCTGTGAATTCATTTCAAAGACATGAAAAAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 TCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101978 TCACAGTGGAGAGAAACCCTATAAATGTAAGCAGTGTGGTAAAGCCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102028 CTCATTCCAGTTCCCTTCGATATCATGAAAGGACTCACACTGGAGAGAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 CCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102078 CCCTATGAGTGTAAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGATCTGCCTCACACCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 TCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102128 TCGAGTGCATGGTAGGACTCACACTGGAGAGAAACCGTATGAATGTAAGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102178 AATGTGGGAAAGCCTTCAGATATGTGAATAACCTTCAAAGTCATGAAAGG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 ACACAAACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102228 ACACAAACACACATAAGAATACACTCTGGAGAAAGACGTTATAAATGTAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1383 GATATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTTCAAAGACATGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102278 GATATGTGGGAAAGGCTTTTATTGTCCCAAATCATTTCAAAGACATGAAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1433 AAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCAGTAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102328 AAACTCACACTGGAGAGAAACTCTATGAATGCAAGCAACGTTCAGTAGTT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1483 CCTTCAGTAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102378 CCTTCAGTAGTTCCAGTTCCTTTTGATATCATGAAAGGACTCACACTGGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1533 GAGAAGCCCTATAAATGCGAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAGCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102428 GAGAAGCCCTATAAATGCGAGCAATGTGGGAAAGCCTTCAGAGCTGTGTC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1583 AATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAAACCCTATGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102478 AATCCTTTGAATGCATGGTAGGACTCACCCTGAAGAGAAACCCTATGAGT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1633 GTGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102528 GTGAGCAATGACGGAAAGCCTTCAGATCTGCCCCACACCTTTGAATACGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1683 GGTAGGACACACAATGGAGAGAAACCCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 102578 GGTAGGACACACAATGGAGAGAAGCCCTATGCATGTAAGGAATGTGGGAA

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1733 ACCCTTCGGATCTGCCCAGAACCTTCGAATTCATGAAAGGACACAAACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102628 ACCCTTCGGATCTGCCCAGAACCTTCGAATTCATGAAAGGACACAAACAC

   1800 
   1783 ACA
        |||
 102678 ACA