seq1 = pF1KB7777.tfa, 1359 bp
seq2 = pF1KB7777/gi568815591r_21802978.tfa (gi568815591r:21802978_22016897), 213920 bp

>pF1KB7777 1359
>gi568815591r:21802978_22016897 (Chr7)

(complement)

1-24  (71094-71117)   100% ->
25-165  (100004-100144)   99% ->
166-300  (105147-105281)   100% ->
301-678  (108391-108768)   100% ->
679-750  (110259-110330)   100% ->
751-918  (110442-110609)   100% ->
919-1044  (111267-111392)   100% ->
1045-1194  (112639-112788)   100% ->
1195-1331  (113784-113920)   100% ->
1332-1359  (114546-114573)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGTTGGCGACTCGCTACCAG         ATCCCTAAAGAAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
  71094 ATGGAGTTGGCGACTCGCTACCAGGTG...CAGATCCCTAAAGAAGTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGACATCTTTAACGCCCCCAGTGATGATGAAGAGTTTGTTGGCTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100021 TGACATCTTTAACGCCCCCAGTGATGATGAAGAGTTTGTTGGCTTCCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGATGTTCCCATGGAAACCCTCTCGTCAGAGGAGAGCTGTGATAGTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 100071 ATGATGTTCCCATGGAAACCCTCTCGTCAGAGGAGAGCTGCGATAGTTTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACTCACTAGAGTCAGGGAAACAG         GATGTGCGCTTTCATTC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100121 GACTCACTAGAGTCAGGGAAACAGGTA...CAGGATGTGCGCTTTCATTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CAAATACTTCACAGAAGAGCTAAGAAGAATTTTTATAGAGGACACTGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105164 CAAATACTTCACAGAAGAGCTAAGAAGAATTTTTATAGAGGACACTGACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGAGACTGAGGATTTTGCAGGATTTACGCAGAGTGATCTGAATGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105214 CAGAGACTGAGGATTTTGCAGGATTTACGCAGAGTGATCTGAATGGAAAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ACTAACCCAGAAGTAATG         GTCGTGGAGTCAGATTTGAGTGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 105264 ACTAACCCAGAAGTAATGGTA...TAGGTCGTGGAGTCAGATTTGAGTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TGATGGCAAAGCATCTTTGGTGAGCGAGGAAGAGGAAGATGAAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108414 TGATGGCAAAGCATCTTTGGTGAGCGAGGAAGAGGAAGATGAAGAAGAAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATAAGGCTACCCCTAGAAGAAGCAGGTCTAGAAGAAGTAGTATTGGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108464 ATAAGGCTACCCCTAGAAGAAGCAGGTCTAGAAGAAGTAGTATTGGTCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGAGTAGCCTTTCAGTTCCCCACCAAGAAGCTGGCCAACAAACCAGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108514 CGAGTAGCCTTTCAGTTCCCCACCAAGAAGCTGGCCAACAAACCAGATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AAACAGTTCTTCCGAGCAGTTGTTTTCTAGCGCACGCTTACAGAATGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108564 AAACAGTTCTTCCGAGCAGTTGTTTTCTAGCGCACGCTTACAGAATGAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AAAAAACAATTCTTGAAAGAAAGAAAGACTGTAGACAGGTGATACAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108614 AAAAAACAATTCTTGAAAGAAAGAAAGACTGTAGACAGGTGATACAAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGATTCTACCTCTGAGTCTGAGGATGACTCTCGGGATGAGAGCCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108664 GAAGATTCTACCTCTGAGTCTGAGGATGACTCTCGGGATGAGAGCCAGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GAGTTCAGATGCTTTGCTGAAAAGGACCATGAACATCAAGGAGAACAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108714 GAGTTCAGATGCTTTGCTGAAAAGGACCATGAACATCAAGGAGAACAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCATG         CTTGCCCAGTTATTGGCGGAATTGAACTCGATGCCA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108764 CCATGGTG...CAGCTTGCCCAGTTATTGGCGGAATTGAACTCGATGCCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GATTTCTTCCCAGTACGAACCCCAACCTCAGCTTCT         AGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 110295 GATTTCTTCCCAGTACGAACCCCAACCTCAGCTTCTGTA...CAGAGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GAAGACAGTGAGGCGGGCCTTCTCGGAGGGACAGATCACGCGGCGTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110447 GAAGACAGTGAGGCGGGCCTTCTCGGAGGGACAGATCACGCGGCGTATGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 ACCCAACCCGGAGTGCGCGGCCTCCTGAGAAGTTTGCTCTAGAGAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110497 ACCCAACCCGGAGTGCGCGGCCTCCTGAGAAGTTTGCTCTAGAGAACTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACTGTCTCAGCCGCTAAATTTGCGGAAGAGTTTTACAGCTTCCGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110547 ACTGTCTCAGCCGCTAAATTTGCGGAAGAGTTTTACAGCTTCCGAAGAAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAAGACAATTGGG         GGGAAATGCCGGGAGTACAGACGACGTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 110597 GAAGACAATTGGGGTA...CAGGGGAAATGCCGGGAGTACAGACGACGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 ACCGTATATCTTCTTTTCGGCCAGTGGAGGATATCACCGAAGAGGACTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111295 ACCGTATATCTTCTTTTCGGCCAGTGGAGGATATCACCGAAGAGGACTTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GAAAATGTTGCCATAACTGTTCGAGATAAAATCTATGATAAAGTTCTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 111345 GAAAATGTTGCCATAACTGTTCGAGATAAAATCTATGATAAAGTTCTGGT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1045        GGTAACACGTGCCATCAGTGTCGACAAAAGACCATCGACACCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111395 A...TAGGGTAACACGTGCCATCAGTGTCGACAAAAGACCATCGACACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1088 AGACAGTGTGTCGGAACCAGGGTTGCTGTGGTGTGCGAGGACAGTTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112682 AGACAGTGTGTCGGAACCAGGGTTGCTGTGGTGTGCGAGGACAGTTCTGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGACCATGCCTGCGGAACCGCTATGGGGAGGATGTCAGATCGGCATTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112732 GGACCATGCCTGCGGAACCGCTATGGGGAGGATGTCAGATCGGCATTGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGACCCG         GATTGGGTGTGTCCCCCCTGTCGTGGGATCTGCA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112782 GGACCCGGTA...TAGGATTGGGTGTGTCCCCCCTGTCGTGGGATCTGCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATTGCAGCTACTGTCGGAAGCGTGACGGCCGCTGTGCCACAGGAATCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113818 ATTGCAGCTACTGTCGGAAGCGTGACGGCCGCTGTGCCACAGGAATCCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATTCATCTGGCCAAGTTTTATGGTTATGACAATGTTAAGGAATATCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113868 ATTCATCTGGCCAAGTTTTATGGTTATGACAATGTTAAGGAATATCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 GAG         CTTACAAAAGGAGCTGGTAGAAGACAAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 113918 GAGGTA...CAGCTTACAAAAGGAGCTGGTAGAAGACAAT