seq1 = pF1KB7775.tfa, 1359 bp
seq2 = pF1KB7775/gi568815584r_34985593.tfa (gi568815584r:34985593_35221959), 236367 bp

>pF1KB7775 1359
>gi568815584r:34985593_35221959 (Chr14)

(complement)

1-58  (100001-100058)   100% ->
59-186  (105223-105350)   100% ->
187-291  (111331-111435)   100% ->
292-404  (112029-112141)   100% ->
405-502  (113724-113821)   100% ->
503-573  (114586-114656)   100% ->
574-706  (122576-122708)   100% ->
707-762  (125196-125251)   100% ->
763-838  (125327-125402)   100% ->
839-975  (126776-126912)   100% ->
976-1113  (130753-130890)   100% ->
1114-1173  (133950-134009)   100% ->
1174-1359  (136182-136367)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACTGGAAAGAAGTTCTTCGTCGGCGCCTAGCGACGCCCAACACCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCCAAACA         AAAAAAAAAGTGAACAAGAATTAAAAGATGAAG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCCAAACAGTG...CAGAAAAAAAAAGTGAACAAGAATTAAAAGATGAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105256 AAATGGATTTATTTACAAAATATTACTCCGAATGGAAAGGAGGTAGAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACACAAATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 105306 AACACAAATGAATTCTATAAGACCATTCCCCGGTTTTATTATAGGGTA..

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187     CTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTAAGAGAGGAAT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105356 .CAGCTGCCTGCTGAAGATGAAGTCTTACTACAGAAATTAAGAGAGGAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111377 CAAGAGCTGTCTTTCTACAAAGAAAAAGCAGAGAACTGTTAGATAATGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAATTACAG         AACTTATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGAC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 111427 GAATTACAGGTA...AAGAACTTATGGTTTTTGCTGGACAAACACCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112061 ACCACCTATGATTGGAGAGGAAGCGATGATCAATTACGAAAACTTTTTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAA         GCAATTTTTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 112111 AGGTTGGTGAAAAGGCTGGAGCAAAGTGCAAGTA...TAGGCAATTTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCATACAGATTCATATGGAAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113734 ACAGCAAAAGTCTTTGCTAAACTCCTTCATACAGATTCATATGGAAGAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAG         TTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 113784 TTCCATCATGCAGTTCTTTAATTATGTCATGAGAAAAGGTG...CAGTTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GGCTTCATCAAACAAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114589 GGCTTCATCAAACAAGAATAGGACTCAGTTTATATGATGTCGCTGGGCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGTACCTTCGGGAATCT         GATTTAGAAAACTACATATTGGA
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 114639 GGGTACCTTCGGGAATCTGTA...CAGGATTTAGAAAACTACATATTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122599 ACTTATCCCTACGTTGCCACAATTAGATGGTCTGGAAAAATCTTTCTACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CCTTTTATGTTTGTACAGCAGTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122649 CCTTTTATGTTTGTACAGCAGTTAGGAAGTTCTTCTTCTTTTTAGATCCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TTAAGAACAG         GAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 122699 TTAAGAACAGGTA...AAGGAAAGATAAAAATTCAAGATATTTTAGCATG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 CAGCTTCCTAGATGATTTATTGGAG         CTAAGGGATGAGGAAC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 125227 CAGCTTCCTAGATGATTTATTGGAGGTA...TAGCTAAGGGATGAGGAAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 TGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTGCTCCTTCTGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125343 TGTCCAAGGAGAGTCAAGAAACAAATTGGTTTTCTGCTCCTTCTGCCCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AGAGTTTATG         GCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 125393 AGAGTTTATGGTA...AAGGCCAGTACTTGAATCTTGATAAAGATCACAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGGCATGCTCAGTAAAGAAGAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126807 TGGCATGCTCAGTAAAGAAGAACTCTCACGCTATGGAACAGCTACCATGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 CCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTATGATGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126857 CCAATGTCTTCTTAGACCGTGTTTTCCAGGAGTGTCTCACTTATGATGGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAAATG         GACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126907 GAAATGGTA...TAGGACTATAAGACCTACTTGGACTTTGTCCTTGCATT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1011 AGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTCTACAATATATTTTCAAACTGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130788 AGAAAACAGAAAGGAACCTGCAGCTCTACAATATATTTTCAAACTGCTTG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1061 ATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130838 ATATTGAGAACAAAGGATACCTGAATGTCTTTTCACTTAATTATTTCTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 AGG         GCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130888 AGGGTA...CAGGCCATACAGGAACTAATGAAAATCCATGGACAAGATCC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1152 TGTTTCATTTCAAGATGTCAAG         GATGAAATCTTTGACATGG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 133988 TGTTTCATTTCAAGATGTCAAGGTT...CAGGATGAAATCTTTGACATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1193 TAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136201 TAAAACCAAAGGATCCTTTGAAAATCTCTCTTCAGGATTTAATCAACAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1243 AATCAAGGAGACACAGTAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136251 AATCAAGGAGACACAGTAACCACCATTCTAATCGATTTGAATGGCTTCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1293 GACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGTGAAAACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136301 GACTTACGAGAACAGAGAGGCTCTTGTTGCAAATGACAGTGAAAACTCTG

   1450     .    :    .
   1343 CAGACCTTGATGATACA
        |||||||||||||||||
 136351 CAGACCTTGATGATACA