seq1 = pF1KB7754.tfa, 1488 bp
seq2 = pF1KB7754/gi568815579r_56121578.tfa (gi568815579r:56121578_56325046), 203469 bp

>pF1KB7754 1488
>gi568815579r:56121578_56325046 (Chr19)

(complement)

1-384  (100001-100384)   100% ->
385-588  (101213-101416)   100% ->
589-739  (102306-102456)   100% ->
740-1488  (102721-103469)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGCAAATTGCACATCCTCATGGAGTCTAGGAGAATCCTGCAACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGCAAATTGCACATCCTCATGGAGTCTAGGAGAATCCTGCAACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACCTGGGTTGGAGCTGCCACGGTCTATGGCATCCTCAGAAACTCAACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACCTGGGTTGGAGCTGCCACGGTCTATGGCATCCTCAGAAACTCAACTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAAATCACGACGTGGACCCTGAGATTTCTCACGTGAACTTCAGGATGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GAAATCACGACGTGGACCCTGAGATTTCTCACGTGAACTTCAGGATGTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTGCCCGAAGGAGTCGGACCCCATCCAGGCTCTGAGGAAACTCACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTGCCCGAAGGAGTCGGACCCCATCCAGGCTCTGAGGAAACTCACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGTGCCATCTGTGGCTGAGGCCCGACCTCCACACCAAAGAGCAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGTGCCATCTGTGGCTGAGGCCCGACCTCCACACCAAAGAGCAGATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGACATGCTGGTGATGGAGCAGTTCATGATCTCCATGCCCCAGGAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGACATGCTGGTGATGGAGCAGTTCATGATCTCCATGCCCCAGGAGCTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGTCTTAGTCATGATGAACGGTGTGCAGAGCTGCAAAGACCTGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGTCTTAGTCATGATGAACGGTGTGCAGAGCTGCAAAGACCTGGAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGCTACGAAATAACAGAAGACCCAAGAAATGG         TCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100351 CCTGCTACGAAATAACAGAAGACCCAAGAAATGGGTG...CAGTCTGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TCACCTTCCACGGAAAGGAATATATTGTGCAGGACTCAGATATCGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101220 TCACCTTCCACGGAAAGGAATATATTGTGCAGGACTCAGATATCGAGATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTGAAGCCCCCTCCAGTGTCAGAGATGATCTGAAAGACGTGTCCAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101270 GCTGAAGCCCCCTCCAGTGTCAGAGATGATCTGAAAGACGTGTCCAGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 ACGGGCCTCCTCGGTGAACCAGATGCGTCCAGGGGAAGGCCAGGCCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101320 ACGGGCCTCCTCGGTGAACCAGATGCGTCCAGGGGAAGGCCAGGCCCACC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GAGAGCTGCAGATCCTGCCCAGGGTCCCTGCATTGTCCAGGAGGCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 101370 GAGAGCTGCAGATCCTGCCCAGGGTCCCTGCATTGTCCAGGAGGCAGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    589       GGAGAGGACTTTCTGCTACACAAGAGTATTGACGTAACAGGTGA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101420 ...CAGGGAGAGGACTTTCTGCTACACAAGAGTATTGACGTAACAGGTGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCCAAAGTCTCTGAGACCCAAGCAGACCTTGGAGAAGGATCTGAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102350 CCCAAAGTCTCTGAGACCCAAGCAGACCTTGGAGAAGGATCTGAAGGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACAGGGAAGAGAACCCAGGACTGACATCCCCAGAGCCTCAGCTTCCAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102400 ACAGGGAAGAGAACCCAGGACTGACATCCCCAGAGCCTCAGCTTCCAAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGTCCCA         CAGATCTGGTGAGAGCAAAGGAGGGGAAGGACCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102450 AGTCCCAGTG...CAGCAGATCTGGTGAGAGCAAAGGAGGGGAAGGACCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 CCCAAAAATAGCCTCTGTGGAAAATGTGGATGCTGACACACCTTCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102755 CCCAAAAATAGCCTCTGTGGAAAATGTGGATGCTGACACACCTTCTGCCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCGTTGTGGAGAGAGAAGCTTCGACTCACAGCGGGAACAGAGGAGACGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102805 GCGTTGTGGAGAGAGAAGCTTCGACTCACAGCGGGAACAGAGGAGACGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTGAATCTGAGCAGTCCCAAAAGAAGCAAACCAGATGCCTCCTCCATTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102855 CTGAATCTGAGCAGTCCCAAAAGAAGCAAACCAGATGCCTCCTCCATTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CCAAGAAGAGCCTCAAGGAGAAGCCACACCTGTGGGCAACAGAGAATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102905 CCAAGAAGAGCCTCAAGGAGAAGCCACACCTGTGGGCAACAGAGAATCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CGGGACAAGCTGGGATGAATTCAATTCATTCCCCAGGCCCTGCGAGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102955 CGGGACAAGCTGGGATGAATTCAATTCATTCCCCAGGCCCTGCGAGCCCA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GTCAGTCACCCGGATGGCCAAGAAGCCAAGGCACTGCCGCCCTTTGCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103005 GTCAGTCACCCGGATGGCCAAGAAGCCAAGGCACTGCCGCCCTTTGCATG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGACGTGTGCGAGAAGAGGTTTACGTGTAATTCCAAGCTAGTCATCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103055 TGACGTGTGCGAGAAGAGGTTTACGTGTAATTCCAAGCTAGTCATCCACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 AGAGATCACACACAGGCGAGAGACTCTTTCAATGTAATCTCTGTGGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103105 AGAGATCACACACAGGCGAGAGACTCTTTCAATGTAATCTCTGTGGGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CGCTTCATGCAGCTTATTAGCCTCCAATTTCACCAGCGAACCCACACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103155 CGCTTCATGCAGCTTATTAGCCTCCAATTTCACCAGCGAACCCACACTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CGAGAGGCCCTACACGTGTGACGTCTGCCAGAAGCAGTTCACCCAGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103205 CGAGAGGCCCTACACGTGTGACGTCTGCCAGAAGCAGTTCACCCAGAAGT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 CCTACTTGAAGTGTCACAAGAGAAGCCACACAGGGGAGAAGCCCTTCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103255 CCTACTTGAAGTGTCACAAGAGAAGCCACACAGGGGAGAAGCCCTTCGAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TGTAAAGACTGCAAGAAAGTTTTCACCTACAGGGGGAGCCTGAAGGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103305 TGTAAAGACTGCAAGAAAGTTTTCACCTACAGGGGGAGCCTGAAGGAGCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CCAGCGCATCCACTCCGGAGAGAAACCCTACAAATGTTCCAAGTGTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103355 CCAGCGCATCCACTCCGGAGAGAAACCCTACAAATGTTCCAAGTGTCCAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 GAGCCTTCAGTCGGCTGAAATTGTTAAGACGCCACCAGAAAACACATCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103405 GAGCCTTCAGTCGGCTGAAATTGTTAAGACGCCACCAGAAAACACATCCA

   1500     .    :    .
   1474 GAAGCTACTTCTCAG
        |||||||||||||||
 103455 GAAGCTACTTCTCAG