seq1 = pF1KB7737.tfa, 1308 bp
seq2 = pF1KB7737/gi568815582r_29986228.tfa (gi568815582r:29986228_30191193), 204966 bp

>pF1KB7737 1308
>gi568815582r:29986228_30191193 (Chr16)

(complement)

1-118  (100001-100118)   100% ->
119-353  (100202-100436)   100% ->
354-621  (101984-102251)   100% ->
622-768  (102355-102501)   100% ->
769-839  (102579-102649)   100% ->
840-913  (104343-104416)   100% ->
914-1097  (104499-104682)   100% ->
1098-1308  (104756-104966)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTACCATCCACGAGAATTGTACCCGTCCCTGGGGGCCGGCTACCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTACCATCCACGAGAATTGTACCCGTCCCTGGGGGCCGGCTACCGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGGCCCGCCCAACCTGGGGCCGACTCCAGCTTCCCACCCGCCCTAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGGCCCGCCCAACCTGGGGCCGACTCCAGCTTCCCACCCGCCCTAGCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGGCTACCGCTACCCCG         AACTGGACACCCCTAAACTGGAT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGCTACCGCTACCCCGGTG...CAGAACTGGACACCCCTAAACTGGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TGCTTCCTCTCCGGGATGGAGGCTGCTCCCCGCACCCTGGCCGCGCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100225 TGCTTCCTCTCCGGGATGGAGGCTGCTCCCCGCACCCTGGCCGCGCACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACCTCTGCCCCTTCTGCCCCCTGCCATGGGCACTGAGCCGGCCCCATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100275 ACCTCTGCCCCTTCTGCCCCCTGCCATGGGCACTGAGCCGGCCCCATCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCCAGAGGCCCTCCATTCCCTCCCGGGGGTCAGCCTGAGCCTGGAGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100325 CTCCAGAGGCCCTCCATTCCCTCCCGGGGGTCAGCCTGAGCCTGGAGAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGGGAGCTATGGAAGGAGTTCAGCTCTGTGGGAACAGAAATGATCATCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100375 CGGGAGCTATGGAAGGAGTTCAGCTCTGTGGGAACAGAAATGATCATCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAAGCTGGGAG         GCGCATGTTCCCTGCCTGCCGAGTGTCAG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100425 CAAAGCTGGGAGGTG...CAGGCGCATGTTCCCTGCCTGCCGAGTGTCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCACTGGCCTGGACCCCGAGGCCCGCTACTTGTTTCTTCTGGATGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102013 TCACTGGCCTGGACCCCGAGGCCCGCTACTTGTTTCTTCTGGATGTGATT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCGGTGGATGGGGCTCGCTACCGCTGGCAGGGCCGGCGCTGGGAGCCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102063 CCGGTGGATGGGGCTCGCTACCGCTGGCAGGGCCGGCGCTGGGAGCCCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CGGCAAGGCAGAGCCCCGCCTGCCTGACCGTGTCTACATTCACCCCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102113 CGGCAAGGCAGAGCCCCGCCTGCCTGACCGTGTCTACATTCACCCCGACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CTCCTGCCACTGGTGCACATTGGATGCGGCAGCCTGTGTCTTTCCATCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102163 CTCCTGCCACTGGTGCACATTGGATGCGGCAGCCTGTGTCTTTCCATCGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GTCAAGCTCACCAACAGCACGCTGGACCCCCACGGCCAC         CT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 102213 GTCAAGCTCACCAACAGCACGCTGGACCCCCACGGCCACGTG...CAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATCCTGCACTCCATGCACAAGTACCAACCCCGCATACACCTAGTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102357 GATCCTGCACTCCATGCACAAGTACCAACCCCGCATACACCTAGTTCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CAGCCCAGCTCTGCAGCCAGCACTGGGGGGGCATGGCCTCCTTCCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102407 CAGCCCAGCTCTGCAGCCAGCACTGGGGGGGCATGGCCTCCTTCCGCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 CCCGAGACCACATTCATCTCCGTGACAGCCTACCAGAACCCACAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 102457 CCCGAGACCACATTCATCTCCGTGACAGCCTACCAGAACCCACAGGTG..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    769     ATCACACAACTGAAGATTGCAGCCAATCCCTTTGCCAAAGGCTTCC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102507 .CAGATCACACAACTGAAGATTGCAGCCAATCCCTTTGCCAAAGGCTTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 GGGAGAACGGCAGAAACTGTAAGAG         GGAGCGAGACGCCCGT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 102625 GGGAGAACGGCAGAAACTGTAAGAGGTG...CAGGGAGCGAGACGCCCGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 GTGAAGAGGAAACTGCGGGGCCCAGAGCCAGCAGCCACAGAGGCCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104359 GTGAAGAGGAAACTGCGGGGCCCAGAGCCAGCAGCCACAGAGGCCTATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GAGCGGAG         ACACACCAGGTGGTCCCTGCGACTCCACCCTGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 104409 GAGCGGAGGTG...CAGACACACCAGGTGGTCCCTGCGACTCCACCCTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 GTGGAGACATTCGTGAATCAGATCCAGAACAGGCCCCAGCCCCCGGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104532 GTGGAGACATTCGTGAATCAGATCCAGAACAGGCCCCAGCCCCCGGGGAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 GCCACCGCTGCCCCGGCACCTCTGTGTGGTGGCCCCAGTGCTGAGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104582 GCCACCGCTGCCCCGGCACCTCTGTGTGGTGGCCCCAGTGCTGAGGCCTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCTCCTGCACCCTGCGGCTTTCCATGGGGCCCCCAGTCACCTTCCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104632 CCTCCTGCACCCTGCGGCTTTCCATGGGGCCCCCAGTCACCTTCCCACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 G         GAGCCCCAGCTTCCCGGAGGCTCCAGACTCCGGGCGCTCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104682 GGTG...CAGGAGCCCCAGCTTCCCGGAGGCTCCAGACTCCGGGCGCTCA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GCCCCCTACTCGGCTGCATTTCTGGAGCTGCCGCACGGGTCAGGGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104796 GCCCCCTACTCGGCTGCATTTCTGGAGCTGCCGCACGGGTCAGGGGGCTC

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CGGGTACCCAGCGGCTCCACCGGCGGTACCCTTTGCCCCACACTTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
 104846 CGGGTACCCAGCGGCTCCACCGGCGGTACCCTTTGCCCCGCACTTTCTCC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 AAGGGGGCCCCTTCCCTCTACCATACACCGCGCCTGGGGGCTATCTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104896 AAGGGGGCCCCTTCCCTCTACCATACACCGCGCCTGGGGGCTATCTGGAT

   1350     .    :    .    :
   1288 GTGGGCTCCAAACCCATGTAC
        |||||||||||||||||||||
 104946 GTGGGCTCCAAACCCATGTAC