seq1 = pF1KB7701.tfa, 1242 bp
seq2 = pF1KB7701/gi568815584f_100139245.tfa (gi568815584f:100139245_100377597), 238353 bp

>pF1KB7701 1242
>gi568815584f:100139245_100377597 (Chr14)

1-679  (100001-100679)   100% ->
680-842  (123060-123222)   100% ->
843-903  (135454-135514)   100% ->
904-1062  (137246-137404)   100% ->
1063-1242  (138174-138353)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTCGGGCGACACCCTCTACATCGCCACGGACGGCTCGGAGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTCGGGCGACACCCTCTACATCGCCACGGACGGCTCGGAGATGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGAGATCGTGGAGCTGCACGAGATCGAGGTGGAGACCATCCCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGAGATCGTGGAGCTGCACGAGATCGAGGTGGAGACCATCCCGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGACCATCGAGACCACAGTGGTGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGACGACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGACCATCGAGACCACAGTGGTGGGCGAGGAGGAGGAGGAGGACGACGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGAGGACGGCGGCGGTGGCGACCACGGCGGCGGGGGCGGCCACGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACGAGGACGGCGGCGGTGGCGACCACGGCGGCGGGGGCGGCCACGGGCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGCCGGCCACCACCACCACCACCATCACCACCACCACCACCCGCCCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CGCCGGCCACCACCACCACCACCATCACCACCACCACCACCCGCCCATGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGCTCTGCAGCCGCTGGTCACCGACGACCCGACCCAGGTGCACCACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGCTCTGCAGCCGCTGGTCACCGACGACCCGACCCAGGTGCACCACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGAGGTGATCCTGGTGCAGACGCGCGAGGAGGTGGTGGGCGGCGACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGAGGTGATCCTGGTGCAGACGCGCGAGGAGGTGGTGGGCGGCGACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTCGGACGGGCTGCGCGCCGAGGACGGCTTCGAGGATCAGATTCTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTCGGACGGGCTGCGCGCCGAGGACGGCTTCGAGGATCAGATTCTCATCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CGGTGCCCGCGCCGGCCGGCGGCGACGACGACTACATTGAACAAACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CGGTGCCCGCGCCGGCCGGCGGCGACGACGACTACATTGAACAAACGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GTCACCGTGGCGGCGGCCGGCAAGAGCGGCGGCGGCGGCTCGTCGTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GTCACCGTGGCGGCGGCCGGCAAGAGCGGCGGCGGCGGCTCGTCGTCGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GGGAGGCGGCCGCGTCAAGAAGGGCGGCGGCAAGAAGAGCGGCAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGGAGGCGGCCGCGTCAAGAAGGGCGGCGGCAAGAAGAGCGGCAAGAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GTTACCTCAGCGGCGGGGCCGGCGCGGCGGGCGGCGGCGGCGCCGACCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTTACCTCAGCGGCGGGGCCGGCGCGGCGGGCGGCGGCGGCGCCGACCCG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCAACAAGAAGTGGGAGCAGAAGCAGGTGCAGATCAAGACCCTGGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCAACAAGAAGTGGGAGCAGAAGCAGGTGCAGATCAAGACCCTGGAGGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CGAGTTCTCGGTCACCATGTGGTCCTCAG         ATGAAAAAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100651 CGAGTTCTCGGTCACCATGTGGTCCTCAGGTG...CAGATGAAAAAAAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 ATATTGACCATGAGACAGTGGTTGAAGAACAGATCATTGGAGAGAACTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123072 ATATTGACCATGAGACAGTGGTTGAAGAACAGATCATTGGAGAGAACTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTCCTGATTATTCAGAATATATGACAGGAAAGAAACTTCCTCCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123122 CCTCCTGATTATTCAGAATATATGACAGGAAAGAAACTTCCTCCTGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AATACCTGGCATTGACCTCTCAGATCCCAAACAACTGGCAGAATTTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123172 AATACCTGGCATTGACCTCTCAGATCCCAAACAACTGGCAGAATTTGCTA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 G         AATGAAGCCAAGAAAAATTAAAGAAGATGATGCTCCAAGA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123222 GGTA...AAGAATGAAGCCAAGAAAAATTAAAGAAGATGATGCTCCAAGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ACAATAGCTTGCCCTCATAAA         GGCTGCACAAAGATGTTCAG
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 135494 ACAATAGCTTGCCCTCATAAAGTA...AAGGGCTGCACAAAGATGTTCAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 GGATAACTCGGCCATGAGAAAACATCTGCACACCCACGGTCCCAGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137266 GGATAACTCGGCCATGAGAAAACATCTGCACACCCACGGTCCCAGAGTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ACGTCTGTGCAGAATGTGGCAAAGCTTTTGTTGAGAGTTCAAAACTAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137316 ACGTCTGTGCAGAATGTGGCAAAGCTTTTGTTGAGAGTTCAAAACTAAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CGACACCAACTGGTTCATACTGGAGAGAAGCCCTTTCAG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 137366 CGACACCAACTGGTTCATACTGGAGAGAAGCCCTTTCAGGTA...CAGTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 CACGTTCGAAGGCTGTGGGAAACGCTTTTCACTGGACTTCAATTTGCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138176 CACGTTCGAAGGCTGTGGGAAACGCTTTTCACTGGACTTCAATTTGCGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 CACATGTGCGAATCCATACCGGAGACAGGCCCTATGTGTGCCCCTTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138226 CACATGTGCGAATCCATACCGGAGACAGGCCCTATGTGTGCCCCTTCGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GGTTGTAATAAGAAGTTTGCTCAGTCAACTAACCTGAAATCTCACATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138276 GGTTGTAATAAGAAGTTTGCTCAGTCAACTAACCTGAAATCTCACATCTT

   1250     .    :    .    :    .
   1215 AACACATGCTAAGGCCAAAAACAACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 138326 AACACATGCTAAGGCCAAAAACAACCAG