seq1 = pF1KB7667.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KB7667/gi568815575r_75279155.tfa (gi568815575r:75279155_75623024), 343870 bp

>pF1KB7667 1011
>gi568815575r:75279155_75623024 (ChrX)

(complement)

1-136  (100001-100136)   100% ->
137-163  (117178-117204)   100% ->
164-258  (144040-144134)   100% ->
259-379  (172103-172223)   100% ->
380-449  (191505-191574)   100% ->
450-482  (193045-193077)   100% ->
483-603  (193827-193947)   100% ->
604-736  (198241-198373)   100% ->
737-863  (201035-201161)   100% ->
864-967  (205835-205938)   100% ->
968-1011  (243827-243870)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGGCGAGGCTGGAAGATGGCTCTGTCTGGGGGGCTGCGGTGCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGGCGAGGCTGGAAGATGGCTCTGTCTGGGGGGCTGCGGTGCTGCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCGGGTACTGTCCTGGGTGCCAGTGCTCGTTATTGTCCTCGTCGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCGGGTACTGTCCTGGGTGCCAGTGCTCGTTATTGTCCTCGTCGTGCTCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGTCCTACTATGCCTACGTCTTTGAACTCTGCCTGG         TGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100101 GGTCCTACTATGCCTACGTCTTTGAACTCTGCCTGGGTA...CAGTGACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTTTGAGCCCAGCAGAAAAAG         TTATTTACCTCATACTCTA
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 117183 GTTTTGAGCCCAGCAGAAAAAGGTA...CAGTTATTTACCTCATACTCTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCATGCCATCTTTGTGTTCTTTACCTGGACCTACTGGAAGTCTATCTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144059 CCATGCCATCTTTGTGTTCTTTACCTGGACCTACTGGAAGTCTATCTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CACTCCCACAGCAGCCAAACCAGAAG         TTCCACTTGTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 144109 CACTCCCACAGCAGCCAAACCAGAAGGTA...CAGTTCCACTTGTCCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACAGACAAGGAGCGCTATGAAAATGAAGAAAGACCTGAGGTCCAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172118 ACAGACAAGGAGCGCTATGAAAATGAAGAAAGACCTGAGGTCCAGAAGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GATGCTTGTTGATATGGCCAAAAAGCTACCGGTTTACACAAGAACTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172168 GATGCTTGTTGATATGGCCAAAAAGCTACCGGTTTACACAAGAACTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GTGGAG         CTGTACGATTCTGTGACCGGTGTCATCTGATCAAG
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172218 GTGGAGGTC...TAGCTGTACGATTCTGTGACCGGTGTCATCTGATCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCAGACCGCTGCCACCACTGCTCTGTCTGTGCTAT         GTGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 191540 CCAGACCGCTGCCACCACTGCTCTGTCTGTGCTATGTA...TAGGTGTGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 GTTAAAAATGGATCATCACTGCCCTTG         GGTTAATAACTGCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 193051 GTTAAAAATGGATCATCACTGCCCTTGGTA...TAGGGTTAATAACTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 TTGGATTTTCCAACTACAAATTCTTCCTTCAATTCTTAGCTTACTCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193841 TTGGATTTTCCAACTACAAATTCTTCCTTCAATTCTTAGCTTACTCTGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 CTCTACTGCCTGTACATTGCTACGACAGTCTTCAGCTATTTCATCAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193891 CTCTACTGCCTGTACATTGCTACGACAGTCTTCAGCTATTTCATCAAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTGGAGA         GGGGAATTACCCAGTGTTCGCTCTAAGTTCCATG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 193941 CTGGAGAGTA...TAGGGGGAATTACCCAGTGTTCGCTCTAAGTTCCATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TCCTTTTTCTTCTCTTTGTGGCCTGCATGTTTTTTGTCAGCCTTGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198275 TCCTTTTTCTTCTCTTTGTGGCCTGCATGTTTTTTGTCAGCCTTGTGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CTCTTTGGTTACCATTGTTGGCTTGTCAGCAGAAACAAAACCACCTTAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 198325 CTCTTTGGTTACCATTGTTGGCTTGTCAGCAGAAACAAAACCACCTTAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    737         AGGCCTTCTGCACTCCAGTGTTTACAAGTGGCCCAGAGAAAA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 198375 TA...TAGAGGCCTTCTGCACTCCAGTGTTTACAAGTGGCCCAGAGAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    779 ATGGGTTCAACCTTGGCTTCATCAAGAATATCCAGCAGGTGTTTGGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201077 ATGGGTTCAACCTTGGCTTCATCAAGAATATCCAGCAGGTGTTTGGAGAT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAGAAGAAGTTCTGGTTAATACCTATTGGTTCCAG         CCCTGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 201127 AAGAAGAAGTTCTGGTTAATACCTATTGGTTCCAGGTG...CAGCCCTGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    870 TGATGGACACTCCTTCCCTATGAGGTCTATGAATGAGTCACAGAACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205841 TGATGGACACTCCTTCCCTATGAGGTCTATGAATGAGTCACAGAACCCAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    920 TGCTAGCAAATGAAGAAACCTGGGAAGACAACGAGGATGACAACCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 205891 TGCTAGCAAATGAAGAAACCTGGGAAGACAACGAGGATGACAACCAAGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    968        ATTATCCAGAAGGCTCATCATCTCTTGCTGTGGAAACGGAAAC
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 205941 A...CAGATTATCCAGAAGGCTCATCATCTCTTGCTGTGGAAACGGAAAC

   1100 
   1011 A
        |
 243870 A