seq1 = pF1KB7658.tfa, 1182 bp
seq2 = pF1KB7658/gi568815582r_3123895.tfa (gi568815582r:3123895_3333755), 209861 bp

>pF1KB7658 1182
>gi568815582r:3123895_3333755 (Chr16)

(complement)

1-250  (100001-100250)   100% ->
251-339  (100835-100923)   100% ->
340-466  (101209-101335)   100% ->
467-1182  (109146-109861)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGGCTGCAAAAGTGGTTCCTATGCCCCCAAAGCCAAAGCAGTCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGGCTGCAAAAGTGGTTCCTATGCCCCCAAAGCCAAAGCAGTCCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TATACTGAGAGTTCCGCCAGACTCCAAGCTGGGCCAAGACCTACTTCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TATACTGAGAGTTCCGCCAGACTCCAAGCTGGGCCAAGACCTACTTCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGCCACTAACGGGCCCAAGACCATCCACCAGCTAGTGCTGGAGCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGCCACTAACGGGCCCAAGACCATCCACCAGCTAGTGCTGGAGCACTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTCACCTTCTTGCCCAAGCCAAGCCTGGTCCAGCCCAGTCAGAAAGTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTCACCTTCTTGCCCAAGCCAAGCCTGGTCCAGCCCAGTCAGAAAGTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGACCTTGGTTATTATGAAAGATGTGAGCTCAAGCCTTCAGAACAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGACCTTGGTTATTATGAAAGATGTGAGCTCAAGCCTTCAGAACAGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251          TGCATCCTCGTCCCTTGGTGAAGCTTCTGCCCAAAGGAGTC
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTG...CAGTGCATCCTCGTCCCTTGGTGAAGCTTCTGCCCAAAGGAGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAAAAGGAACAAGAGACAGTGTCTCTGTATTTGAAAGCTAACCCTGAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 100876 CAAAAGGAACAAGAGACAGTGTCTCTGTATTTGAAAGCTAACCCTGAGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    340        GAGCTGGTGGTCTTTGAGGATTTGAATGTATTTCACTGCCAGG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100926 G...CAGGAGCTGGTGGTCTTTGAGGATTTGAATGTATTTCACTGCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AAGAATGTGTGAGCTTGGATCCTACTCAACAACTCACGTCAGAGAAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101252 AAGAATGTGTGAGCTTGGATCCTACTCAACAACTCACGTCAGAGAAGGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GATGACAGCAGTGTCGGGGAAATGATGTTACTGG         TCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 101302 GATGACAGCAGTGTCGGGGAAATGATGTTACTGGGTA...CAGTCAATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAGTAATCCTGAAGGTGAAGATCCTGAGAGGGAACCTGTAGAAAATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109153 CAGTAATCCTGAAGGTGAAGATCCTGAGAGGGAACCTGTAGAAAATGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 ATTATAGAGAAAAGTCTTCAGATGATGATGAAATGGATTCTTCCTTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109203 ATTATAGAGAAAAGTCTTCAGATGATGATGAAATGGATTCTTCCTTGGTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 TCTCAGCAGCCTCCCGATAACCAGGAAAAGGAACGACTAAATACATCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109253 TCTCAGCAGCCTCCCGATAACCAGGAAAAGGAACGACTAAATACATCCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 TCCACAAAAAAGGAAAATGAGAAATCTGTTAGTTACCATTGAGAATGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109303 TCCACAAAAAAGGAAAATGAGAAATCTGTTAGTTACCATTGAGAATGATA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CTCCTCTAGAGGAACTCTCAAAATATGTAGACATCAGTATTATTGCCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109353 CTCCTCTAGAGGAACTCTCAAAATATGTAGACATCAGTATTATTGCCCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 ACTCGAAATCGGAGGACAAGGAGATGGTACACTTGTCCACTGTGTGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109403 ACTCGAAATCGGAGGACAAGGAGATGGTACACTTGTCCACTGTGTGGGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 ACAGTTTAATGAAAGTTCTTACCTCATTTCCCACCAGAGGACCCACACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109453 ACAGTTTAATGAAAGTTCTTACCTCATTTCCCACCAGAGGACCCACACTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GAGAAAAACCCTATGACTGTAATCACTGTGGGAAAAGCTTCAATCATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109503 GAGAAAAACCCTATGACTGTAATCACTGTGGGAAAAGCTTCAATCATAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 ACAAACCTCAATAAACATGAGCGAATTCATACAGGAGAGAAACCTTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109553 ACAAACCTCAATAAACATGAGCGAATTCATACAGGAGAGAAACCTTATTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 CTGTTCTCAGTGTGGAAAAAACTTCCGTCAGAATTCTCATCGGAGTCGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109603 CTGTTCTCAGTGTGGAAAAAACTTCCGTCAGAATTCTCATCGGAGTCGTC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 ATGAAGGAATCCATATAAGGGAGAAGATATTTAAGTGTCCAGAATGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109653 ATGAAGGAATCCATATAAGGGAGAAGATATTTAAGTGTCCAGAATGTGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AAAACCTTCCCAAAGAATGAGGAGTTTGTGCTTCATCTGCAGAGTCATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109703 AAAACCTTCCCAAAGAATGAGGAGTTTGTGCTTCATCTGCAGAGTCATGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 GGCTGAGAGACCATATGGTTGCAAAAAATGTGGGAGAAGATTTGGTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109753 GGCTGAGAGACCATATGGTTGCAAAAAATGTGGGAGAAGATTTGGTCGGC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGTCAAACTGTACCCGGCATGAGAAAACCCACTCAGCCTGTAAGACCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109803 TGTCAAACTGTACCCGGCATGAGAAAACCCACTCAGCCTGTAAGACCCGA

   1200     .
   1174 AAGCAGAAG
        |||||||||
 109853 AAGCAGAAG