seq1 = pF1KB7650.tfa, 1176 bp
seq2 = pF1KB7650/gi568815586r_50030548.tfa (gi568815586r:50030548_50267297), 236750 bp

>pF1KB7650 1176
>gi568815586r:50030548_50267297 (Chr12)

(complement)

1-197  (100001-100197)   100% ->
198-303  (123241-123346)   99% ->
304-434  (124094-124224)   100% ->
435-492  (125188-125245)   100% ->
493-543  (128681-128731)   100% ->
544-636  (129478-129570)   100% ->
637-765  (131229-131357)   100% ->
766-872  (131460-131566)   100% ->
873-1029  (132596-132752)   100% ->
1030-1176  (136604-136750)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGACAGCAGCGCAGGGACCCCTAAGCTTGCTGTGGGGCTGGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGACAGCAGCGCAGGGACCCCTAAGCTTGCTGTGGGGCTGGCTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GAGCGAGCGCTTCTGGCTACCCGAGAACGTGAGCTGGGCTGATCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GAGCGAGCGCTTCTGGCTACCCGAGAACGTGAGCTGGGCTGATCTGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCGGCCGACGGCTACGGTTACCCCCGCGGCCGGCACATCCTCTCGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCGGCCGACGGCTACGGTTACCCCCGCGGCCGGCACATCCTCTCGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCCGCTGGCGGCGGGCATCTTCTTCGTGAGGCTGCTCTTCGAGCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100151 TTCCCGCTGGCGGCGGGCATCTTCTTCGTGAGGCTGCTCTTCGAGCGGTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    198       ATTTATTGCCAAACCCTGTGCACTCCGTATTGGCATCGAGGACA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
 100201 ...CAGATTTATTGCCAAACCCTGTGCACTCTGTATTGGCATCGAGGACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GTGGTCCTTATCAGGCCCAACCCAATGCCATCCTTGAAAAGGTGTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123285 GTGGTCCTTATCAGGCCCAACCCAATGCCATCCTTGAAAAGGTGTTCATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTATTACCAAG         TATCCTGATAAGAAAAGGCTGGAGGGCCT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 123335 TCTATTACCAAGGTA...CAGTATCCTGATAAGAAAAGGCTGGAGGGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCAAAGCAGCTGGATTGGAATGTCCGAAAAATCCAATGCTGGTTTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124123 GTCAAAGCAGCTGGATTGGAATGTCCGAAAAATCCAATGCTGGTTTCGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ATCGGAGGAATCAGGACAAGCCCCCAACGCTTACTAAATTCTGTGAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124173 ATCGGAGGAATCAGGACAAGCCCCCAACGCTTACTAAATTCTGTGAAAGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AT         GTGGAGATTCACATTTTATTTATGTATATTCTGCTATGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124223 ATGTA...CAGGTGGAGATTCACATTTTATTTATGTATATTCTGCTATGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AATTAGATTTCTCTGGTCG         TCACCTTGGTTCTGGGACATCC
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 125227 AATTAGATTTCTCTGGTCGGTG...TAGTCACCTTGGTTCTGGGACATCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 GACAGTGCTGGCATAACTATCCATTTCAG         CCTCTTTCAAGT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 128703 GACAGTGCTGGCATAACTATCCATTTCAGGTA...CAGCCTCTTTCAAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GGGCTTTATCACTATTATATCATGGAATTGGCCTTCTATTGGTCCCTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129490 GGGCTTTATCACTATTATATCATGGAATTGGCCTTCTATTGGTCCCTTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTTTTCTCAGTTTACAGACATTAAAAGAAAG         GACTTCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 129540 GTTTTCTCAGTTTACAGACATTAAAAGAAAGGTA...TAGGACTTCCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCATGTTTGTGCATCACTTGGTCACCATTGGGCTTATCTCCTTCTCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131239 TCATGTTTGTGCATCACTTGGTCACCATTGGGCTTATCTCCTTCTCCTAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCAACAATATGGTTCGAGTGGGAACTCTGATCATGTGTCTACATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131289 ATCAACAATATGGTTCGAGTGGGAACTCTGATCATGTGTCTACATGATGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 CTCAGACTTCTTGCTGGAG         GCAGCCAAACTGGCCAATTATG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 131339 CTCAGACTTCTTGCTGGAGGTA...CAGGCAGCCAAACTGGCCAATTATG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CCAAGTATCAGCGGCTCTGTGACACCCTTTTTGTGATCTTCAGTGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131482 CCAAGTATCAGCGGCTCTGTGACACCCTTTTTGTGATCTTCAGTGCTGTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 TTTATGGTTACACGACTAGGAATCTATCCATTCTG         GATTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 131532 TTTATGGTTACACGACTAGGAATCTATCCATTCTGGTA...TAGGATTCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GAACACGACCCTCTTTGAGAGTTGGGAGATAATCGGGCCTTATGCTTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132602 GAACACGACCCTCTTTGAGAGTTGGGAGATAATCGGGCCTTATGCTTCAT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GGTGGCTCCTCAATGGCCTGCTGCTGACCCTACAGCTTCTGCATGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132652 GGTGGCTCCTCAATGGCCTGCTGCTGACCCTACAGCTTCTGCATGTCATC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGGTCCTACCTAATTGCACGGATTGCTTTGAAAGCCTTGATCAGGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132702 TGGTCCTACCTAATTGCACGGATTGCTTTGAAAGCCTTGATCAGGGGAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 G         GTATCGAAGGATGATCGCAGTGATGTGGAGAGCAGCTCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132752 GGTG...CAGGTATCGAAGGATGATCGCAGTGATGTGGAGAGCAGCTCAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGGAAGAAGATGTGACCACCTGCACAAAAAGTCCCTGTGACAGTAGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136644 AGGAAGAAGATGTGACCACCTGCACAAAAAGTCCCTGTGACAGTAGCTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AGCAATGGTGCCAATCGGGTGAATGGTCACATGGGAGGCAGCTACTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136694 AGCAATGGTGCCAATCGGGTGAATGGTCACATGGGAGGCAGCTACTGGGC

   1250     .
   1170 TGAAGAG
        |||||||
 136744 TGAAGAG