seq1 = pF1KB7636.tfa, 1131 bp
seq2 = pF1KB7636/gi568815575r_72251732.tfa (gi568815575r:72251732_72672761), 421030 bp

>pF1KB7636 1131
>gi568815575r:72251732_72672761 (ChrX)

(complement)

1-111  (100001-100111)   100% ->
112-164  (100653-100705)   100% ->
165-295  (103878-104008)   100% ->
296-437  (104732-104873)   100% ->
438-550  (177494-177606)   100% ->
551-634  (181756-181837)   96% ->
635-737  (183727-183829)   100% ->
738-910  (208031-208203)   100% ->
911-1005  (210664-210758)   100% ->
1006-1112  (320924-321030)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGAGCCGGAGGAACCGGCGGACAGTGGGCAGTCGCTGGTCCCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGAGCCGGAGGAACCGGCGGACAGTGGGCAGTCGCTGGTCCCGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTATATCTATAGTCCCGAGTATGTCAGTATGTGTGACTCCCTGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTATATCTATAGTCCCGAGTATGTCAGTATGTGTGACTCCCTGGCCAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCCCAAACGG         GCCAGTATGGTGCATTCTTTGATTGAAGCA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCCCAAACGGGTA...TAGGCCAGTATGGTGCATTCTTTGATTGAAGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TATGCACTGCATAAGCAGATGAG         GATAGTTAAGCCTAAAGT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 100683 TATGCACTGCATAAGCAGATGAGGTA...TAGGATAGTTAAGCCTAAAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGCCTCCATGGAGGAGATGGCCACCTTCCACACTGATGCTTATCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103896 GGCCTCCATGGAGGAGATGGCCACCTTCCACACTGATGCTTATCTGCAGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATCTCCAGAAGGTCAGCCAAGAGGGCGATGATGATCATCCGGACTCCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103946 ATCTCCAGAAGGTCAGCCAAGAGGGCGATGATGATCATCCGGACTCCATA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAATATGGGCTAG         GTTATGACTGCCCAGCCACTGAAGGGAT
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103996 GAATATGGGCTAGGTA...AAGGTTATGACTGCCCAGCCACTGAAGGGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ATTTGACTATGCAGCAGCTATAGGAGGGGCTACGATCACAGCTGCCCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104760 ATTTGACTATGCAGCAGCTATAGGAGGGGCTACGATCACAGCTGCCCAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 GCCTGATTGACGGAATGTGCAAAGTAGCAATTAACTGGTCTGGAGGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104810 GCCTGATTGACGGAATGTGCAAAGTAGCAATTAACTGGTCTGGAGGGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CATCATGCAAAGAA         AGATGAAGCATCTGGTTTTTGTTATCT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 104860 CATCATGCAAAGAAGTA...CAGAGATGAAGCATCTGGTTTTTGTTATCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAATGATGCTGTCCTGGGAATATTACGATTGCGACGGAAATTTGAGCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177521 CAATGATGCTGTCCTGGGAATATTACGATTGCGACGGAAATTTGAGCGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TTCTCTACGTGGATTTGGATCTGCACCATGGAGATG         GTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 177571 TTCTCTACGTGGATTTGGATCTGCACCATGGAGATGGTA...TAGGTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GAAGACGCATTCAGTTTCACCTCCAAAGTCATGACCGTGTCCCTGCACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 181761 GAAGACGCATTCAGTTTCACCTCCAAAGTCATGACCGTGTCCCTGCACAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ATTCTCCCCAGGATTTTTCCCAGGAACAG         GTGACGTGTCTG
        |||||||||||||||||||||||| |-|->>>...>>>||||||||||||
 181811 ATTCTCCCCAGGATTTTTCCCAGGCA A GTG...CAGGTGACGTGTCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATGTTGGCCTAGGGAAGGGACGGTACTACAGTGTAAATGTGCCCATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 183739 ATGTTGGCCTAGGGAAGGGACGGTACTACAGTGTAAATGTGCCCATTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GATGGCATACAAGATGAAAAATATTACCAGATCTGTGAAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 183789 GATGGCATACAAGATGAAAAATATTACCAGATCTGTGAAAGGTA...TAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 TGTACTAAAGGAAGTATACCAAGCCTTTAATCCCAAAGCAGTGGTCTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208031 TGTACTAAAGGAAGTATACCAAGCCTTTAATCCCAAAGCAGTGGTCTTAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AGCTGGGAGCTGACACAATAGCTGGGGATCCCATGTGCTCCTTTAACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208081 AGCTGGGAGCTGACACAATAGCTGGGGATCCCATGTGCTCCTTTAACATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 ACTCCAGTGGGAATTGGCAAGTGTCTTAAGTACATCCTTCAATGGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 208131 ACTCCAGTGGGAATTGGCAAGTGTCTTAAGTACATCCTTCAATGGCAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGCAACACTCATTTTGGGAGGAG         GAGGCTATAACCTTGCCA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 208181 GGCAACACTCATTTTGGGAGGAGGTG...CAGGAGGCTATAACCTTGCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 ACACGGCTCGATGCTGGACATACTTGACCGGGGTCATCCTAGGGAAAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210682 ACACGGCTCGATGCTGGACATACTTGACCGGGGTCATCCTAGGGAAAACA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 CTATCCTCTGAGATCCCAGATCATGAG         TTTTTCACAGCATA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 210732 CTATCCTCTGAGATCCCAGATCATGAGGTA...CAGTTTTTCACAGCATA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 TGGTCCTGATTATGTGCTGGAAATCACGCCAAGCTGCCGGCCAGACCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320938 TGGTCCTGATTATGTGCTGGAAATCACGCCAAGCTGCCGGCCAGACCGCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 ATGAGCCCCACCGAATCCAACAAATCCTCAACTACATCAAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 320988 ATGAGCCCCACCGAATCCAACAAATCCTCAACTACATCAAAGG