seq1 = pF1KB7614.tfa, 1080 bp
seq2 = pF1KB7614/gi568815592r_31064604.tfa (gi568815592r:31064604_31270620), 206017 bp

>pF1KB7614 1080
>gi568815592r:31064604_31270620 (Chr6)

(complement)

1-405  (100001-100405)   100% ->
406-526  (104574-104694)   100% ->
527-657  (104920-105050)   100% ->
658-816  (105335-105493)   100% ->
817-1080  (105754-106017)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGGACACCTGGCTTCGGATTTCGCCTTCTCGCCCCCTCCAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGGACACCTGGCTTCGGATTTCGCCTTCTCGCCCCCTCCAGGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGGTGATGGGCCAGGGGGGCCGGAGCCGGGCTGGGTTGATCCTCGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGGTGATGGGCCAGGGGGGCCGGAGCCGGGCTGGGTTGATCCTCGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTGGCTAAGCTTCCAAGGCCCTCCTGGAGGGCCAGGAATCGGGCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTGGCTAAGCTTCCAAGGCCCTCCTGGAGGGCCAGGAATCGGGCCGGGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GTTGGGCCAGGCTCTGAGGTGTGGGGGATTCCCCCATGCCCCCCGCCGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GTTGGGCCAGGCTCTGAGGTGTGGGGGATTCCCCCATGCCCCCCGCCGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGAGTTCTGTGGGGGGATGGCGTACTGTGGGCCCCAGGTTGGAGTGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGAGTTCTGTGGGGGGATGGCGTACTGTGGGCCCCAGGTTGGAGTGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TAGTGCCCCAAGGCGGCTTGGAGACCTCTCAGCCTGAGGGCGAAGCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TAGTGCCCCAAGGCGGCTTGGAGACCTCTCAGCCTGAGGGCGAAGCAGGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTCGGGGTGGAGAGCAACTCCGATGGGGCCTCCCCGGAGCCCTGCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTCGGGGTGGAGAGCAACTCCGATGGGGCCTCCCCGGAGCCCTGCACCGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CACCCCTGGTGCCGTGAAGCTGGAGAAGGAGAAGCTGGAGCAAAACCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CACCCCTGGTGCCGTGAAGCTGGAGAAGGAGAAGCTGGAGCAAAACCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGAG         TCCCAGGACATCAAAGCTCTGCAGAAAGAACTCGAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGAGGCA...CAGTCCCAGGACATCAAAGCTCTGCAGAAAGAACTCGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAATTTGCCAAGCTCCTGAAGCAGAAGAGGATCACCCTGGGATATACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104610 CAATTTGCCAAGCTCCTGAAGCAGAAGAGGATCACCCTGGGATATACACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GGCCGATGTGGGGCTCACCCTGGGGGTTCTATTTG         GGAAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 104660 GGCCGATGTGGGGCTCACCCTGGGGGTTCTATTTGGTG...CAGGGAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TATTCAGCCAAACGACCATCTGCCGCTTTGAGGCTCTGCAGCTTAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104926 TATTCAGCCAAACGACCATCTGCCGCTTTGAGGCTCTGCAGCTTAGCTTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAGAACATGTGTAAGCTGCGGCCCTTGCTGCAGAAGTGGGTGGAGGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104976 AAGAACATGTGTAAGCTGCGGCCCTTGCTGCAGAAGTGGGTGGAGGAAGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 TGACAACAATGAAAATCTTCAGGAG         ATATGCAAAGCAGAAA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 105026 TGACAACAATGAAAATCTTCAGGAGGTA...CAGATATGCAAAGCAGAAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 CCCTCGTGCAGGCCCGAAAGAGAAAGCGAACCAGTATCGAGAACCGAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105351 CCCTCGTGCAGGCCCGAAAGAGAAAGCGAACCAGTATCGAGAACCGAGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 AGAGGCAACCTGGAGAATTTGTTCCTGCAGTGCCCGAAACCCACACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105401 AGAGGCAACCTGGAGAATTTGTTCCTGCAGTGCCCGAAACCCACACTGCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GCAGATCAGCCACATCGCCCAGCAGCTTGGGCTCGAGAAGGAT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 105451 GCAGATCAGCCACATCGCCCAGCAGCTTGGGCTCGAGAAGGATGTG...C

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    817   GTGGTCCGAGTGTGGTTCTGTAACCGGCGCCAGAAGGGCAAGCGATCA
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105752 AGGTGGTCCGAGTGTGGTTCTGTAACCGGCGCCAGAAGGGCAAGCGATCA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 AGCAGCGACTATGCACAACGAGAGGATTTTGAGGCTGCTGGGTCTCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105802 AGCAGCGACTATGCACAACGAGAGGATTTTGAGGCTGCTGGGTCTCCTTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 CTCAGGGGGACCAGTGTCCTTTCCTCTGGCCCCAGGGCCCCATTTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105852 CTCAGGGGGACCAGTGTCCTTTCCTCTGGCCCCAGGGCCCCATTTTGGTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    965 CCCCAGGCTATGGGAGCCCTCACTTCACTGCACTGTACTCCTCGGTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105902 CCCCAGGCTATGGGAGCCCTCACTTCACTGCACTGTACTCCTCGGTCCCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1015 TTCCCTGAGGGGGAAGCCTTTCCCCCTGTCTCCGTCACCACTCTGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105952 TTCCCTGAGGGGGAAGCCTTTCCCCCTGTCTCCGTCACCACTCTGGGCTC

   1100     .    :    .
   1065 TCCCATGCATTCAAAC
        ||||||||||||||||
 106002 TCCCATGCATTCAAAC