seq1 = pF1KB7595.tfa, 699 bp
seq2 = pF1KB7595/gi568815592f_31475742.tfa (gi568815592f:31475742_31677534), 201793 bp

>pF1KB7595 699
>gi568815592f:31475742_31677534 (Chr6)

1-186  (100001-100186)   100% ->
187-232  (100793-100838)   100% ->
233-280  (101026-101073)   100% ->
281-699  (101375-101793)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCACTGAAAGCATGATCCGGGACGTGGAGCTGGCCGAGGAGGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCACTGAAAGCATGATCCGGGACGTGGAGCTGGCCGAGGAGGCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCAAGAAGACAGGGGGGCCCCAGGGCTCCAGGCGGTGCTTGTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCAAGAAGACAGGGGGGCCCCAGGGCTCCAGGCGGTGCTTGTTCCTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCTTCTCCTTCCTGATCGTGGCAGGCGCCACCACGCTCTTCTGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTCTTCTCCTTCCTGATCGTGGCAGGCGCCACCACGCTCTTCTGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCACTTTGGAGTGATCGGCCCCCAGAGGGAAGAG         TTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100151 CTGCACTTTGGAGTGATCGGCCCCCAGAGGGAAGAGGTG...CAGTTCCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAGGGACCTCTCTCTAATCAGCCCTCTGGCCCAGGCAGTCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100798 CAGGGACCTCTCTCTAATCAGCCCTCTGGCCCAGGCAGTCAGTA...CAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GATCATCTTCTCGAACCCCGAGTGACAAGCCTGTAGCCCATGTTGTAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 101026 GATCATCTTCTCGAACCCCGAGTGACAAGCCTGTAGCCCATGTTGTAGGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281        CAAACCCTCAAGCTGAGGGGCAGCTCCAGTGGCTGAACCGCCG
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101076 A...CAGCAAACCCTCAAGCTGAGGGGCAGCTCCAGTGGCTGAACCGCCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGCCAATGCCCTCCTGGCCAATGGCGTGGAGCTGAGAGATAACCAGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101418 GGCCAATGCCCTCCTGGCCAATGGCGTGGAGCTGAGAGATAACCAGCTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGTGCCATCAGAGGGCCTGTACCTCATCTACTCCCAGGTCCTCTTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101468 TGGTGCCATCAGAGGGCCTGTACCTCATCTACTCCCAGGTCCTCTTCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCCAAGGCTGCCCCTCCACCCATGTGCTCCTCACCCACACCATCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101518 GGCCAAGGCTGCCCCTCCACCCATGTGCTCCTCACCCACACCATCAGCCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CATCGCCGTCTCCTACCAGACCAAGGTCAACCTCCTCTCTGCCATCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101568 CATCGCCGTCTCCTACCAGACCAAGGTCAACCTCCTCTCTGCCATCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCCCCTGCCAGAGGGAGACCCCAGAGGGGGCTGAGGCCAAGCCCTGGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101618 GCCCCTGCCAGAGGGAGACCCCAGAGGGGGCTGAGGCCAAGCCCTGGTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAGCCCATCTATCTGGGAGGGGTCTTCCAGCTGGAGAAGGGTGACCGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101668 GAGCCCATCTATCTGGGAGGGGTCTTCCAGCTGGAGAAGGGTGACCGACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CAGCGCTGAGATCAATCGGCCCGACTATCTCGACTTTGCCGAGTCTGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101718 CAGCGCTGAGATCAATCGGCCCGACTATCTCGACTTTGCCGAGTCTGGGC

    700     .    :    .    :    .
    674 AGGTCTACTTTGGGATCATTGCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||
 101768 AGGTCTACTTTGGGATCATTGCCCTG