seq1 = pF1KB7562.tfa, 822 bp
seq2 = pF1KB7562/gi568815587r_64889132.tfa (gi568815587r:64889132_65096914), 207783 bp

>pF1KB7562 822
>gi568815587r:64889132_65096914 (Chr11)

(complement)

1-39  (100001-100039)   100% ->
40-141  (102366-102467)   100% ->
142-822  (107103-107783)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCACCTCTGTGGGGGCAATGGGCTGCTGACCCAGACA         GA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100001 ATGCACCTCTGTGGGGGCAATGGGCTGCTGACCCAGACAGTG...CAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCCCAAGGAGCAACAAAGGCAGCTGAAGAAGCAGAAGAACCGGGCAGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102368 CCCCAAGGAGCAACAAAGGCAGCTGAAGAAGCAGAAGAACCGGGCAGCCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCAGCGAAGCCGGCAGAAGCACACAGACAAGGCAGACGCCCTGCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102418 CCCAGCGAAGCCGGCAGAAGCACACAGACAAGGCAGACGCCCTGCACCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142          CAGCACGAGTCTCTGGAAAAAGACAACCTCGCCCTGCGGAA
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102468 GTG...CAGCAGCACGAGTCTCTGGAAAAAGACAACCTCGCCCTGCGGAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GGAGATCCAGTCCCTGCAGGCCGAGCTGGCGTGGTGGAGCCGGACCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107144 GGAGATCCAGTCCCTGCAGGCCGAGCTGGCGTGGTGGAGCCGGACCCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACGTGCATGAGCGCCTGTGCCCCATGGATTGTGCCTCCTGCTCAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107194 ACGTGCATGAGCGCCTGTGCCCCATGGATTGTGCCTCCTGCTCAGCTCCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GGGCTCCTGGGCTGCTGGGACCAGGCTGAGGGGCTCCTGGGCCCTGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107244 GGGCTCCTGGGCTGCTGGGACCAGGCTGAGGGGCTCCTGGGCCCTGGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 ACAGGGACAACATGGCTGCCGGGAGCAGCTGGAGCTGTTCCAGACCCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107294 ACAGGGACAACATGGCTGCCGGGAGCAGCTGGAGCTGTTCCAGACCCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTTCCTGTTACCCAGCTCAGCCGCTCTCTCCAGGTCCACAGCCTCATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107344 GTTCCTGTTACCCAGCTCAGCCGCTCTCTCCAGGTCCACAGCCTCATGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TCTCCCAGCCTCCTCCAGTGCCCCCTGCCCTCACTGTCCCTTGGCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107394 TCTCCCAGCCTCCTCCAGTGCCCCCTGCCCTCACTGTCCCTTGGCCCCGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 TGTGGTTGCTGAACCTCCTGTCCAGCTGTCCCCCAGCCCTCTCCTGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107444 TGTGGTTGCTGAACCTCCTGTCCAGCTGTCCCCCAGCCCTCTCCTGTTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 CCTCGCACACTGGTTCCAGCCTGCAGGGGTCTTCCTCTAAGCTCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107494 CCTCGCACACTGGTTCCAGCCTGCAGGGGTCTTCCTCTAAGCTCAGTGCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTCCAGCCCAGCCTCACGGCCCAAACTGCCCCTCCACAGCCCCTCGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107544 CTCCAGCCCAGCCTCACGGCCCAAACTGCCCCTCCACAGCCCCTCGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGAGCATCCCACCAGAGGGAAGCTGGGGTCCTCTCCCGACAACCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107594 GGAGCATCCCACCAGAGGGAAGCTGGGGTCCTCTCCCGACAACCCTTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTGCCCTGGGGCTTGCACGTCTGCAGAGCAGGGAGCACAAACCTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107644 CTGCCCTGGGGCTTGCACGTCTGCAGAGCAGGGAGCACAAACCTGCTCTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TCAGCAGCCACTTGGCAAGGGCTGGTTGTGGATCCCAGCCCTCACCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107694 TCAGCAGCCACTTGGCAAGGGCTGGTTGTGGATCCCAGCCCTCACCCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCTGGCCTTTCCTCTGCTCTCCTCTGCTCAAGTCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107744 CCTGGCCTTTCCTCTGCTCTCCTCTGCTCAAGTCCACTTC