seq1 = pF1KB7561.tfa, 621 bp
seq2 = pF1KB7561/gi568815586r_104020400.tfa (gi568815586r:104020400_104228517), 208118 bp

>pF1KB7561 621
>gi568815586r:104020400_104228517 (Chr12)

(complement)

1-100  (99997-100094)   97% ->
101-231  (102274-102404)   100% ->
232-429  (105095-105292)   100% ->
430-511  (107197-107278)   100% ->
512-591  (108039-108118)   100% ->
592-621  (108749-108778)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAATGGATGGTGACAGTTCTACAACAGATGCTTCTCAACTAGGAAT
        ||-| |-|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99997 AT AGA TGGATGGTGACAGTTCTACAACAGATGCTTCTCAACTAGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTCTGCAGACTATATTGGAGGAAGTCATTATGTTATACAGCCTCATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100045 CTCTGCAGACTATATTGGAGGAAGTCATTATGTTATACAGCCTCATGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101          ATACTGAGGACAGCATGAATGATCATGAAGACACAAATGGT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100095 GTA...TAGATACTGAGGACAGCATGAATGATCATGAAGACACAAATGGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCAAAAGAAAGTTTCAGAGAACAAGATATATATCTTCCAATAGCAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102315 TCAAAAGAAAGTTTCAGAGAACAAGATATATATCTTCCAATAGCAAACGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGCTAGGATAATGAAAAATGCCATACCTCAAACGGGAAAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 102365 GGCTAGGATAATGAAAAATGCCATACCTCAAACGGGAAAGGTA...CAGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTGCAAAAGATGCCAAAGAATGTGTTCAAGAATGTGTAAGTGAGTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105096 TTGCAAAAGATGCCAAAGAATGTGTTCAAGAATGTGTAAGTGAGTTCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGTTTTATAACATCTGAAGCAAGTGAAAGGTGCCATCAAGAGAAACGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105146 AGTTTTATAACATCTGAAGCAAGTGAAAGGTGCCATCAAGAGAAACGGAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AACAATCAATGGAGAAGATATTCTCTTTGCTATGTCTACTTTAGGCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105196 AACAATCAATGGAGAAGATATTCTCTTTGCTATGTCTACTTTAGGCTTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 ACAGTTATGTGGAACCTCTGAAATTATACCTTCAGAAATTCAGAGAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 105246 ACAGTTATGTGGAACCTCTGAAATTATACCTTCAGAAATTCAGAGAGGTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    430       GCTATGAAAGGAGAAAAGGGAATTGGTGGAGCAGTCACAGCTAC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105296 ...CAGGCTATGAAAGGAGAAAAGGGAATTGGTGGAGCAGTCACAGCTAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGATGGACTAAGTGAAGAGCTTACAGAGGAGGCATTTA         CTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 107241 AGATGGACTAAGTGAAGAGCTTACAGAGGAGGCATTTAGTA...TAGCTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACCAGTTACCAGCTGGCTTAATAACCACAGACGGTCAACAACAAAATGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108042 ACCAGTTACCAGCTGGCTTAATAACCACAGACGGTCAACAACAAAATGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 ATGGTTTACACAACATCATATCAACAG         ATTTCTGGTGTTCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 108092 ATGGTTTACACAACATCATATCAACAGGTA...TAGATTTCTGGTGTTCA

    650     .    :    .
    606 GCAAATTCAGTTTTCA
        ||||||||||||||||
 108763 GCAAATTCAGTTTTCA