seq1 = pF1KB7559.tfa, 618 bp
seq2 = pF1KB7559/gi568815590r_71742664.tfa (gi568815590r:71742664_71944178), 201515 bp

>pF1KB7559 618
>gi568815590r:71742664_71944178 (Chr8)

(complement)

1-534  (100001-100534)   100% ->
535-618  (101432-101515)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCACGGGCTCGGTGAGTGATCCGGAGGAGATGGAGCTTCGGGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCACGGGCTCGGTGAGTGATCCGGAGGAGATGGAGCTTCGGGGGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCAGCGGGAGTACCCGGTCCCCGCCTCCAAGAGGCCGCCCCTCCGCGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCAGCGGGAGTACCCGGTCCCCGCCTCCAAGAGGCCGCCCCTCCGCGGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAGAGCGCAGCTACGCCTCGCCCAGTGACAACTCGTCGGCAGAGGAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAGAGCGCAGCTACGCCTCGCCCAGTGACAACTCGTCGGCAGAGGAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACCCCGACGGCGAGGAGGAGCGCTGCGCTCTGGGCACAGCCGGCAGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GACCCCGACGGCGAGGAGGAGCGCTGCGCTCTGGGCACAGCCGGCAGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAAGGCTGCAAGAGGAAGCGGCCCCGTGTGGCTGGGGGCGGCGGCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAAGGCTGCAAGAGGAAGCGGCCCCGTGTGGCTGGGGGCGGCGGCGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTGGTAGCGCGGGCGGTGGTGGCAAGAAGCCCCTCCCGGCCAAGGGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTGGTAGCGCGGGCGGTGGTGGCAAGAAGCCCCTCCCGGCCAAGGGCTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GCCGCAGAGTGCAAGCAGTCGCAGCGGAACGCGGCCAACGCCCGTGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GCCGCAGAGTGCAAGCAGTCGCAGCGGAACGCGGCCAACGCCCGTGAGCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCCCGGATGCGCGTGCTGAGCAAAGCCTTCTCCAGGCTCAAGACCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCCCGGATGCGCGTGCTGAGCAAAGCCTTCTCCAGGCTCAAGACCAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCCCTGGGTGCCCCCCGACACTAAGCTCTCCAAGCTGGACACGCTCCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCCCTGGGTGCCCCCCGACACTAAGCTCTCCAAGCTGGACACGCTCCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CTGGCTTCCAGTTACATCGCTCACCTGCGGCAGCTGTTGCAGGAGGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CTGGCTTCCAGTTACATCGCTCACCTGCGGCAGCTGTTGCAGGAGGACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTATGAGAACGGCTACGTGCACCCAGTGAACCTG         ACATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100501 CTATGAGAACGGCTACGTGCACCCAGTGAACCTGGTA...CAGACATGGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CATTCGTGGTCTCGGGAAGACCGGACTCTGACACCAAAGAAGTTTCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101439 CATTCGTGGTCTCGGGAAGACCGGACTCTGACACCAAAGAAGTTTCCGCA

    600     .    :    .    :    .
    592 GCCAACAGACTATGTGGAACCACCGCT
        |||||||||||||||||||||||||||
 101489 GCCAACAGACTATGTGGAACCACCGCT