seq1 = pF1KB7554.tfa, 810 bp
seq2 = pF1KB7554/gi568815588f_92589987.tfa (gi568815588f:92589987_92794765), 204779 bp

>pF1KB7554 810
>gi568815588f:92589987_92794765 (Chr10)

1-361  (100001-100361)   100% ->
362-540  (102382-102560)   100% ->
541-591  (102716-102766)   100% ->
592-810  (104561-104779)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTACCCGCACCCCGGGCCGGCGGCGGGCGCCGTGGGGGTGCCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTACCCGCACCCCGGGCCGGCGGCGGGCGCCGTGGGGGTGCCGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTACGCGCCCACGCCGCTGCTGCAACCCGCACACCCGACGCCCTTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTACGCGCCCACGCCGCTGCTGCAACCCGCACACCCGACGCCCTTTTACA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGAGGACATCCTGGGCCGCGGGCCCGCCGCGCCCACGCCCGCCCCCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGAGGACATCCTGGGCCGCGGGCCCGCCGCGCCCACGCCCGCCCCCACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCCGTCCCCCAACTCCTCCTTCACCAGCCTCGTGTCCCCCTACCGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCCGTCCCCCAACTCCTCCTTCACCAGCCTCGTGTCCCCCTACCGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCGGTGTACGAGCCCACGCCGATCCATCCAGCCTTCTCGCACCACTCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCGGTGTACGAGCCCACGCCGATCCATCCAGCCTTCTCGCACCACTCCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCGCCGCGCTGGCCGCTGCCTACGGACCCGGCGGCTTCGGGGGCCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCGCCGCGCTGGCCGCTGCCTACGGACCCGGCGGCTTCGGGGGCCCTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TACCCCTTCCCGCGGACGGTGAACGACTACACGCACGCCCTGCTCCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TACCCCTTCCCGCGGACGGTGAACGACTACACGCACGCCCTGCTCCGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CGACCCCCTGG         GCAAACCTCTACTCTGGAGCCCCTTCTTGC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CGACCCCCTGGGTA...CAGGCAAACCTCTACTCTGGAGCCCCTTCTTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAGGCCTCTGCATAAAAGGAAAGGCGGCCAGGTGAGATTCTCCAACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102412 AGAGGCCTCTGCATAAAAGGAAAGGCGGCCAGGTGAGATTCTCCAACGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGACCATCGAGCTGGAGAAGAAATTCGAGACGCAGAAATATCTCTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102462 CAGACCATCGAGCTGGAGAAGAAATTCGAGACGCAGAAATATCTCTCTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCCCGAGAGGAAGCGTCTGGCCAAGATGCTGCAGCTCAGCGAGAGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 102512 GCCCGAGAGGAAGCGTCTGGCCAAGATGCTGCAGCTCAGCGAGAGACAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    541         GTCAAAACCTGGTTTCAGAATCGACGCGCTAAATGGAGGAGA
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102562 TG...TAGGTCAAAACCTGGTTTCAGAATCGACGCGCTAAATGGAGGAGA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CTAAAACAG         GAGAACCCTCAAAGCAATAAAAAAGAAGAACT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102758 CTAAAACAGGTA...CAGGAGAACCCTCAAAGCAATAAAAAAGAAGAACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAAAGTTTGGACAGTTCCTGTGATCAGAGGCAAGATTTGCCCAGTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104593 GGAAAGTTTGGACAGTTCCTGTGATCAGAGGCAAGATTTGCCCAGTGAAC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AGAATAAAGGTGCTTCTTTGGATAGCTCTCAATGTTCGCCCTCCCCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104643 AGAATAAAGGTGCTTCTTTGGATAGCTCTCAATGTTCGCCCTCCCCTGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TCCCAGGAAGACCTTGAATCAGAGATTTCAGAGGATTCTGATCAGGAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104693 TCCCAGGAAGACCTTGAATCAGAGATTTCAGAGGATTCTGATCAGGAAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .
    774 GGACATTGAGGGCGATAAAAGCTATTTTAATGCTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104743 GGACATTGAGGGCGATAAAAGCTATTTTAATGCTGGA