seq1 = pF1KB7549.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB7549/gi568815582r_58014810.tfa (gi568815582r:58014810_58229115), 214306 bp

>pF1KB7549 579
>gi568815582r:58014810_58229115 (Chr16)

(complement)

1-84  (100001-100084)   100% ->
85-164  (112165-112244)   100% ->
165-276  (112964-113075)   100% ->
277-465  (113659-113847)   100% ->
466-579  (114196-114309)   98%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTCAAAAACACGTTCCAGAGCGGCTTCCTCTCCATCCTCTACAGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTCAAAAACACGTTCCAGAGCGGCTTCCTCTCCATCCTCTACAGCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCAGCAAGCCTCTGCAAATCTGGGACAAAAAG         GTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100051 CGGCAGCAAGCCTCTGCAAATCTGGGACAAAAAGGTC...TAGGTACGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATGGCCACATCAAAAGAATCACTGATAATGACATCCAGTCCCTGGTGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112172 ATGGCCACATCAAAAGAATCACTGATAATGACATCCAGTCCCTGGTGCTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGATTGAAGGGACAAATGTAAG         CACCACATATATCACATG
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 112222 GAGATTGAAGGGACAAATGTAAGGTA...CAGCACCACATATATCACATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CCCTGCAGACCCCAAGAAGACGCTGGGAATTAAACTTCCTTTCCTTGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112982 CCCTGCAGACCCCAAGAAGACGCTGGGAATTAAACTTCCTTTCCTTGTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGATTATCAAAAACCTGAAGAAGTATTTTACCTTCGAAGTGCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 113032 TGATTATCAAAAACCTGAAGAAGTATTTTACCTTCGAAGTGCAGGTA...

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    277    GTACTAGATGACAAGAATGTGCGTCGTCGCTTTCGGGCAAGTAACTA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113656 CAGGTACTAGATGACAAGAATGTGCGTCGTCGCTTTCGGGCAAGTAACTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CCAGAGCACCACCCGGGTCAAACCCTTCATCTGCACCATGCCCATGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113706 CCAGAGCACCACCCGGGTCAAACCCTTCATCTGCACCATGCCCATGCGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TGGATGACGGCTGGAACCAGATTCAGTTCAACTTGCTAGACTTCACACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113756 TGGATGACGGCTGGAACCAGATTCAGTTCAACTTGCTAGACTTCACACGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 CGAGCATACGGCACCAATTACATCGAGACCCTCAGAGTGCAG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 113806 CGAGCATACGGCACCAATTACATCGAGACCCTCAGAGTGCAGGTA...CA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    466  ATCCATGCAAATTGTCGCATCCGACGGGTTTACTTCTCAGACAGACTCT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114195 GATCCATGCAAATTGTCGCATCCGACGGGTTTACTTCTCAGACAGACTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 ACTCAGAAGATGAGCTGCCGGCAGAGTTCAAACTGTATCTCCCAGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114245 ACTCAGAAGATGAGCTGCCGGCAGAGTTCAAACTGTATCTCCCAGTTCAG

    600     .    :    .
    565 AACAAGGCAAAGCAA
        ||||||||||||  |
 114295 AACAAGGCAAAGGTA