seq1 = pF1KB7541.tfa, 534 bp
seq2 = pF1KB7541/gi568815590f_117420877.tfa (gi568815590f:117420877_117639975), 219099 bp

>pF1KB7541 534
>gi568815590f:117420877_117639975 (Chr8)

1-177  (100001-100177)   100% ->
178-336  (107775-107933)   100% ->
337-441  (109847-109951)   100% ->
442-534  (119007-119099)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCACCCCTCCGTTGGCCGCGTCGGGGATGGCGCCCGGGCCCTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCACCCCTCCGTTGGCCGCGTCGGGGATGGCGCCCGGGCCCTTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGGCCCCAGGCTCAGCAGGCCGCCCGGGAAGTCAACACGGCGTCGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGGCCCCAGGCTCAGCAGGCCGCCCGGGAAGTCAACACGGCGTCGCTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCGCATCGGGCAGGAGACAGTGCAGGACATCGTGTACCGCACCATGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCGCATCGGGCAGGAGACAGTGCAGGACATCGTGTACCGCACCATGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ATCTTCCAGCTCCTGAGGAACATGCAG         CTGCCAAATGGTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100151 ATCTTCCAGCTCCTGAGGAACATGCAGGTA...AAGCTGCCAAATGGTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACTTACCACACTGGAACATATCAAGACCGGTTAACAAAGCTACAGGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107789 CACTTACCACACTGGAACATATCAAGACCGGTTAACAAAGCTACAGGATA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCTTCGCCAACTTTCAGTTCTCTTCAGGAAGCTGAGATTGGTATATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107839 ATCTTCGCCAACTTTCAGTTCTCTTCAGGAAGCTGAGATTGGTATATGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAATGCAATGAAAACTGTGGTGGGATGGATCCCATTCCAGTCGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 107889 AAATGCAATGAAAACTGTGGTGGGATGGATCCCATTCCAGTCGAGGTA..

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337     CAACTTATTCCATATGTGGAAGAAGATGGCTCAAAGAATGATGATC
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107939 .CAGCAACTTATTCCATATGTGGAAGAAGATGGCTCAAAGAATGATGATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GGGCTGGCCCACCTCGTTTTGCTAGTGAAGAGAGGCGAGAAATTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109893 GGGCTGGCCCACCTCGTTTTGCTAGTGAAGAGAGGCGAGAAATTGCTGAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GTAAATAAA         AAACTCAAACAGAAGAATCAACAGCTGAAACA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 109943 GTAAATAAAGTG...CAGAAACTCAAACAGAAGAATCAACAGCTGAAACA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AATTATGGATCAATTACGAAATCTCATCTGGGATATAAATGCCATGTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119039 AATTATGGATCAATTACGAAATCTCATCTGGGATATAAATGCCATGTTGG

    550     .    :
    524 CAATGAGGAAC
        |||||||||||
 119089 CAATGAGGAAC