seq1 = pF1KB7539.tfa, 531 bp
seq2 = pF1KB7539/gi568815595r_129070456.tfa (gi568815595r:129070456_129271757), 201302 bp

>pF1KB7539 531
>gi568815595r:129070456_129271757 (Chr3)

(complement)

1-124  (100001-100124)   100% ->
125-217  (100220-100312)   98% ->
218-416  (100481-100679)   100% ->
417-531  (101188-101302)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCAGCAATGAGTGCTTCAAGTGTGGACGATCTGGCCACTGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCAGCAATGAGTGCTTCAAGTGTGGACGATCTGGCCACTGGGCCCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAATGTCCTACTGGTGGAGGCCGTGGTCGTGGAATGAGAAGCCGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAATGTCCTACTGGTGGAGGCCGTGGTCGTGGAATGAGAAGCCGTGGCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GAGGTGGTTTTACCTCGGATAGAG         GTTTCCAGTTTGTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 100101 GAGGTGGTTTTACCTCGGATAGAGGTA...CAGGTTTCCAGTTTGTTTCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TCGTCTCTTCCAGATATTTGTTATCGCTGTGGTGAGTCTGGTCATCTTGC
        |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100237 TCGTCTCTTCCAGACATTTGTTATCGCTGTGGTGAGTCTGGTCATCTTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CAAGGATTGTGATCTTCAGGAGGATG         CCTGCTATAACTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100287 CAAGGATTGTGATCTTCAGGAGGATGGTA...AAGCCTGCTATAACTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GTAGAGGTGGCCACATTGCCAAGGACTGCAAGGAGCCCAAGAGAGAGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100496 GTAGAGGTGGCCACATTGCCAAGGACTGCAAGGAGCCCAAGAGAGAGCGA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGCAATGCTGCTACAACTGTGGCAAACCAGGCCATCTGGCTCGTGACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100546 GAGCAATGCTGCTACAACTGTGGCAAACCAGGCCATCTGGCTCGTGACTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CGACCATGCAGATGAGCAGAAATGCTATTCTTGTGGAGAATTCGGACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100596 CGACCATGCAGATGAGCAGAAATGCTATTCTTGTGGAGAATTCGGACACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTCAAAAAGACTGCACCAAAGTGAAGTGCTATAG         GTGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100646 TTCAAAAAGACTGCACCAAAGTGAAGTGCTATAGGTA...TAGGTGTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GAAACTGGTCATGTAGCCATCAACTGCAGCAAGACAAGTGAAGTCAACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101195 GAAACTGGTCATGTAGCCATCAACTGCAGCAAGACAAGTGAAGTCAACTG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TTACCGCTGTGGCGAGTCAGGGCACCTTGCACGGGAATGCACAATTGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101245 TTACCGCTGTGGCGAGTCAGGGCACCTTGCACGGGAATGCACAATTGAGG

    550     .
    524 CTACAGCC
        ||||||||
 101295 CTACAGCC