seq1 = pF1KB7536.tfa, 771 bp
seq2 = pF1KB7536/gi568815584r_94668494.tfa (gi568815584r:94668494_94870015), 201522 bp

>pF1KB7536 771
>gi568815584r:94668494_94870015 (Chr14)

(complement)

1-355  (100001-100355)   100% ->
356-615  (100799-101058)   100% ->
616-771  (101367-101522)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCGCCAGCATGTTCAGCATCGACAACATCCTAGCCGCCCGGCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCGCCAGCATGTTCAGCATCGACAACATCCTAGCCGCCCGGCCGCG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCAAGGACTCGGTGTTGCCGGTGGCGCACAGCGCGGCGGCTCCCGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCAAGGACTCGGTGTTGCCGGTGGCGCACAGCGCGGCGGCTCCCGTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCTTCCCGGCCCTGCACGGGGACTCGCTCTACGGCGCCAGCGGCGGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCTTCCCGGCCCTGCACGGGGACTCGCTCTACGGCGCCAGCGGCGGCGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCTCGGACTATGGCGCCTTCTACCCGCGCCCCGTGGCCCCCGGCGGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCTCGGACTATGGCGCCTTCTACCCGCGCCCCGTGGCCCCCGGCGGCGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGGCCTCCCGGCCGCGGTCAGCGGCTCCCGCCTCGGCTACAACAACTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGGCCTCCCGGCCGCGGTCAGCGGCTCCCGCCTCGGCTACAACAACTACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTACGGGCAGCTGCACGTGCAGGCGGCGCCCGTGGGCCCGGCCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTACGGGCAGCTGCACGTGCAGGCGGCGCCCGTGGGCCCGGCCTGCTGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GGGGCCGTGCCGCCGCTGGGCGCCCAGCAGTGCTCCTGCGTCCCGACGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GGGGCCGTGCCGCCGCTGGGCGCCCAGCAGTGCTCCTGCGTCCCGACGCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCCAG         GCTACGAGGGCCCCGGTTCGGTGCTGGTGTCCCCGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CCCAGGTA...CAGGCTACGAGGGCCCCGGTTCGGTGCTGGTGTCCCCGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TACCGCACCAGATGCTGCCCTACATGAACGTGGGCACGCTGTCGCGCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100835 TACCGCACCAGATGCTGCCCTACATGAACGTGGGCACGCTGTCGCGCACC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GAGCTGCAGCTTCTCAACCAGCTGCACTGTCGGCGGAAGCGGCGGCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100885 GAGCTGCAGCTTCTCAACCAGCTGCACTGTCGGCGGAAGCGGCGGCACCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCATCTTCACTGACGAGCAGCTCGAAGCTCTCGAGAACCTCTTCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100935 CACCATCTTCACTGACGAGCAGCTCGAAGCTCTCGAGAACCTCTTCCAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 AGACCAAGTACCCGGACGTGGGCACGCGCGAGCAGCTGGCCCGGAAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100985 AGACCAAGTACCCGGACGTGGGCACGCGCGAGCAGCTGGCCCGGAAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 CACCTCCGCGAGGAGAAAGTGGAG         GTCTGGTTTAAGAACCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 101035 CACCTCCGCGAGGAGAAAGTGGAGGTA...CAGGTCTGGTTTAAGAACCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCGCGCCAAATGGAGGCGGCAGAAGCGGTCCTCATCAGAGGAGTCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101384 CCGCGCCAAATGGAGGCGGCAGAAGCGGTCCTCATCAGAGGAGTCGGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGCGGAGAAGTGGAACAAGACGTCGTCGTCGAAGGCGTCACCGGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101434 ACGCGGAGAAGTGGAACAAGACGTCGTCGTCGAAGGCGTCACCGGAGAAG

    750     .    :    .    :    .    :    .
    733 AGGGAAGAGGAAGGTAAAAGCGATTTGGACTCGGACAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101484 AGGGAAGAGGAAGGTAAAAGCGATTTGGACTCGGACAGC