seq1 = pF1KB7530.tfa, 765 bp
seq2 = pF1KB7530/gi568815586f_80617064.tfa (gi568815586f:80617064_80819048), 201985 bp

>pF1KB7530 765
>gi568815586f:80617064_80819048 (Chr12)

1-501  (100001-100501)   100% ->
502-577  (101295-101370)   100% ->
578-765  (101798-101985)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACGTGATGGATGGCTGCCAGTTCTCACCTTCTGAGTACTTCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACGTGATGGATGGCTGCCAGTTCTCACCTTCTGAGTACTTCTACGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCTCCTGCATACCGTCCCCCGAGGGTGAATTTGGGGACGAGTTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGGCTCCTGCATACCGTCCCCCGAGGGTGAATTTGGGGACGAGTTTGTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCGAGTGGCTGCCTTCGGAGCGCACAAAGCAGAGCTGCAGGGCTCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCGAGTGGCTGCCTTCGGAGCGCACAAAGCAGAGCTGCAGGGCTCAGAT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGACGAGCACGTGCGAGCGCCTACCGGCCACCACCAGGCTGGTCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGACGAGCACGTGCGAGCGCCTACCGGCCACCACCAGGCTGGTCACTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTCATGTGGGCCTGCAAAGCCTGCAAGAGGAAGTCCACCACCATGGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTCATGTGGGCCTGCAAAGCCTGCAAGAGGAAGTCCACCACCATGGATC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGCGGAAGGCAGCCACTATGCGCGAGCGGAGGCGCCTGAAGAAGGTCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGCGGAAGGCAGCCACTATGCGCGAGCGGAGGCGCCTGAAGAAGGTCAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGGCTTTCGAAACCCTCAAGAGGTGTACCACGACCAACCCCAACCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGGCTTTCGAAACCCTCAAGAGGTGTACCACGACCAACCCCAACCAGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGCCCAAGGTGGAGATCCTCAGGAATGCCATCCGCTACATCGAGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGCCCAAGGTGGAGATCCTCAGGAATGCCATCCGCTACATCGAGAGCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCAGGAGTTGCTGAGAGAGCAGGTGGAGAACTACTATAGCCTGCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCAGGAGTTGCTGAGAGAGCAGGTGGAGAACTACTATAGCCTGCCGGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CAGAGCTGCTCGGAGCCCACCAGCCCCACCTCCAACTGCTCTGATGGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CAGAGCTGCTCGGAGCCCACCAGCCCCACCTCCAACTGCTCTGATGGCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 G         CCCGAATGTAACAGTCCTGTCTGGTCCAGAAAGAGCAGTA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GGTA...TAGCCCGAATGTAACAGTCCTGTCTGGTCCAGAAAGAGCAGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CTTTTGACAGCATCTACTGTCCTGATGTATCAAATG         TATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101335 CTTTTGACAGCATCTACTGTCCTGATGTATCAAATGGTA...TAGTATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GCCACAGATAAAAACTCCTTATCCAGCTTGGATTGCTTATCCAACATAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101803 GCCACAGATAAAAACTCCTTATCCAGCTTGGATTGCTTATCCAACATAGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GGACCGGATCACCTCCTCAGAGCAACCTGGGTTGCCTCTCCAGGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101853 GGACCGGATCACCTCCTCAGAGCAACCTGGGTTGCCTCTCCAGGATCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 CTTCTCTCTCTCCAGTTGCCAGCACCGATTCACAGCCTGCAACTCCAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101903 CTTCTCTCTCTCCAGTTGCCAGCACCGATTCACAGCCTGCAACTCCAGGG

    750     .    :    .    :    .    :
    733 GCTTCTAGTTCCAGGCTTATCTATCATGTGCTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||
 101953 GCTTCTAGTTCCAGGCTTATCTATCATGTGCTA