seq1 = pF1KB7522.tfa, 747 bp
seq2 = pF1KB7522/gi568815585f_45020656.tfa (gi568815585f:45020656_45383558), 362903 bp

>pF1KB7522 747
>gi568815585f:45020656_45383558 (Chr13)

1-66  (100001-100066)   100% ->
67-140  (116078-116151)   100% ->
141-159  (129115-129133)   100% ->
160-304  (131032-131176)   100% ->
305-386  (186769-186850)   100% ->
387-486  (232216-232315)   100% ->
487-630  (246578-246721)   100% ->
631-747  (262787-262903)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGAGCGCGGGGAACTCGACTTGACCGGCGCCAAACAGAACACAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGAGCGCGGGGAACTCGACTTGACCGGCGCCAAACAGAACACAGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGTGTGGCTAGTCAAG         GTTCCTAAATATTTGTCACAGCAAT
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100051 AGTGTGGCTAGTCAAGGTA...TAGGTTCCTAAATATTTGTCACAGCAAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGGCTAAAGCCTCTGGAAGAGGTGAAGTTGGGAAACTGCGGATTGCCAA 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 116103 GGGCTAAAGCCTCTGGAAGAGGTGAAGTTGGGAAACTGCGGATTGCCAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    141         GACTCAAGGAAGGACTGAG         GTGTCATTTACTTT
        >>...>>>|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 116153 TA...TAGGACTCAAGGAAGGACTGAGGTA...TAGGTGTCATTTACTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    174 GAATGAGGATCTTGCAAATATTCATGATATTGGTGGAAAACCAGCTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131046 GAATGAGGATCTTGCAAATATTCATGATATTGGTGGAAAACCAGCTTCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAGTGCTCCTAGAGAACATCCATTTGTCTTGCAAAGTGTTGGAGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131096 TCAGTGCTCCTAGAGAACATCCATTTGTCTTGCAAAGTGTTGGAGGACAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACATTAACAGTATTTACTGAGAGCTCATCAG         ATAAGCTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 131146 ACATTAACAGTATTTACTGAGAGCTCATCAGGTA...AAGATAAGCTGTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 ATTGGAAGGAATAGTGGTACAAAGAGCTGAATGCCGACCAGCTGCCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 186779 ATTGGAAGGAATAGTGGTACAAAGAGCTGAATGCCGACCAGCTGCCAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 AAAACTACATGCGATTAAAAAG         ATTGCAAATAGAAGAGTCT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 186829 AAAACTACATGCGATTAAAAAGGTT...CAGATTGCAAATAGAAGAGTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 TCCAAACCAGTGAGGCTATCACAACAGCTGGACAAAGTTGTAACAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 232235 TCCAAACCAGTGAGGCTATCACAACAGCTGGACAAAGTTGTAACAACCAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTACAAACCTGTTGCTAATCATCAATACAAT         ATCGAATATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 232285 TTACAAACCTGTTGCTAATCATCAATACAATGTA...TAGATCGAATATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAAGGAAAAAGAAAGAAGACGGAAAGCGAGCTCGAGCTGATAAACAACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246588 AAAGGAAAAAGAAAGAAGACGGAAAGCGAGCTCGAGCTGATAAACAACAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GTTTTAGACATGCTATTTTCAGCCTTTGAGAAACATCAATACTATAATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 246638 GTTTTAGACATGCTATTTTCAGCCTTTGAGAAACATCAATACTATAATCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TAAGGACTTGGTGGACATCACAAAGCAACCTGTG         GTGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 246688 TAAGGACTTGGTGGACATCACAAAGCAACCTGTGGTA...TAGGTGTACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TGAAGGAAATCTTAAAAGAAATTGGTGTTCAGAATGTAAAAGGGATCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262794 TGAAGGAAATCTTAAAAGAAATTGGTGTTCAGAATGTAAAAGGGATCCAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 AAAAACACATGGGAGCTGAAGCCAGAGTACAGACACTATCAAGGAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 262844 AAAAACACATGGGAGCTGAAGCCAGAGTACAGACACTATCAAGGAGAAGA

    800     .    :
    738 AAAGAGTGAC
        ||||||||||
 262894 AAAGAGTGAC