seq1 = pF1KB7516.tfa, 738 bp
seq2 = pF1KB7516/gi568815588f_58285548.tfa (gi568815588f:58285548_58495071), 209524 bp

>pF1KB7516 738
>gi568815588f:58285548_58495071 (Chr10)

1-101  (100001-100101)   100% ->
102-220  (100673-100791)   100% ->
221-291  (102643-102713)   100% ->
292-441  (103123-103272)   100% ->
442-537  (105218-105313)   100% ->
538-594  (108811-108867)   100% ->
595-738  (109381-109524)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGTTTCTCCGAAGCATGTGGGGCGTGCTGAGTGCCCTGGGAAGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGTTTCTCCGAAGCATGTGGGGCGTGCTGAGTGCCCTGGGAAGGTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGAGCAGAGCTGTGCACCGGCTGTGGAAGTCGACTGCGCTCCCCCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGAGCAGAGCTGTGCACCGGCTGTGGAAGTCGACTGCGCTCCCCCTTCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 G         TTTTGTGTATTTACCGAGGTGGTTTTCATCTGTCTTGGCA
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGTA...TAGTTTTGTGTATTTACCGAGGTGGTTTTCATCTGTCTTGGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGTTGTCCAAAGAAACCTGTAAGTTCTTACCTTCGATTTTCTAAAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100713 AGTTGTCCAAAGAAACCTGTAAGTTCTTACCTTCGATTTTCTAAAGAACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACTACCCATATTTAAAGCTCAGAACCCAG         ATGCAAAAACTA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100763 ACTACCCATATTTAAAGCTCAGAACCCAGGTA...TAGATGCAAAAACTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CAGAACTAATTAGAAGAATTGCCCAGCGTTGGAGGGAACTTCCTGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102655 CAGAACTAATTAGAAGAATTGCCCAGCGTTGGAGGGAACTTCCTGATTCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AAGAAAAAA         ATATATCAAGATGCTTATAGGGCGGAGTGGCA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 102705 AAGAAAAAAGTA...TAGATATATCAAGATGCTTATAGGGCGGAGTGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGTATATAAAGAAGAGATAAGCAGATTTAAAGAACAGCTAACTCCAAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103155 GGTATATAAAGAAGAGATAAGCAGATTTAAAGAACAGCTAACTCCAAGTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGATTATGTCTTTGGAAAAAGAAATCATGGACAAACATTTAAAAAGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103205 AGATTATGTCTTTGGAAAAAGAAATCATGGACAAACATTTAAAAAGGAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCTATGACAAAAAAAAAA         GAGTTAACACTGCTTGGAAAACC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 103255 GCTATGACAAAAAAAAAAGTG...CAGGAGTTAACACTGCTTGGAAAACC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 AAAAAGACCTCGTTCAGCTTATAACGTTTATGTAGCTGAAAGATTCCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105241 AAAAAGACCTCGTTCAGCTTATAACGTTTATGTAGCTGAAAGATTCCAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGCTAAGGGTGATTCACCGCAG         GAAAAGCTGAAGACTGTA
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 105291 AAGCTAAGGGTGATTCACCGCAGGTA...CAGGAAAAGCTGAAGACTGTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGGAAAACTGGAAAAATCTGTCTGACTCTGAAAAGGAA         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 108829 AAGGAAAACTGGAAAAATCTGTCTGACTCTGAAAAGGAAGTG...CAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ATATATTCAGCATGCTAAAGAGGACGAAACTCGTTATCATAATGAAATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109383 ATATATTCAGCATGCTAAAGAGGACGAAACTCGTTATCATAATGAAATGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTCTTGGGAAGAACAAATGATTGAAGTTGGACGAAAGGATCTTCTACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109433 AGTCTTGGGAAGAACAAATGATTGAAGTTGGACGAAAGGATCTTCTACGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CGCACAATAAAGAAACAACGAAAATATGGTGCTGAGGAGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109483 CGCACAATAAAGAAACAACGAAAATATGGTGCTGAGGAGTGT