seq1 = pF1KB7515.tfa, 381 bp
seq2 = pF1KB7515/gi568815597r_212586794.tfa (gi568815597r:212586794_212799762), 212969 bp

>pF1KB7515 381
>gi568815597r:212586794_212799762 (Chr1)

(complement)

1-90  (100001-100090)   100% ->
91-195  (102698-102802)   100% ->
196-381  (112784-112969)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGCAAGGGCTCCCGGCCGCCGGCAGCGTCCTGCAGAGGAGCGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGCAAGGGCTCCCGGCCGCCGGCAGCGTCCTGCAGAGGAGCGTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCGCCCGGGAACCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAG         A
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100051 GGCGCCCGGGAACCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAGGTA...CAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCCCTGAGGATGATGACAGGAAGGTCCGAAGGAGAGAAAAAAACCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102699 GCCCTGAGGATGATGACAGGAAGGTCCGAAGGAGAGAAAAAAACCGAGTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GCTGCTCAGAGAAGTCGGAAGAAGCAGACCCAGAAGGCTGACAAGCTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102749 GCTGCTCAGAGAAGTCGGAAGAAGCAGACCCAGAAGGCTGACAAGCTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGAG         GAATATGAGAGCCTGGAGCAAGAAAACACCATGCTGC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102799 TGAGGTG...CAGGAATATGAGAGCCTGGAGCAAGAAAACACCATGCTGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAGAGAGATCGGGAAGCTGACAGAGGAGCTGAAGCACCTGACAGAGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112821 GGAGAGAGATCGGGAAGCTGACAGAGGAGCTGAAGCACCTGACAGAGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGAAGGAGCACGAGAAGATGTGCCCGCTGCTGCTCTGCCCTATGAACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112871 CTGAAGGAGCACGAGAAGATGTGCCCGCTGCTGCTCTGCCCTATGAACTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    333 TGTGCCAGTGCCTCCCCGGCCGGACCCTGTGGCCGGCTGCTTGCCCCGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112921 TGTGCCAGTGCCTCCCCGGCCGGACCCTGTGGCCGGCTGCTTGCCCCGA