seq1 = pF1KB7512.tfa, 729 bp
seq2 = pF1KB7512/gi568815591r_27732803.tfa (gi568815591r:27732803_28280577), 547775 bp

>pF1KB7512 729
>gi568815591r:27732803_28280577 (Chr7)

(complement)

1-115  (100001-100115)   100% ==
187-385  (385160-385358)   100% ->
386-555  (439711-439880)   100% ->
556-729  (447602-447775)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACAGGCATCGCCGCCGCCTCCTTCTTCTCCAATACCTGCCGATTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACAGGCATCGCCGCCGCCTCCTTCTTCTCCAATACCTGCCGATTCGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTGCGGACTCCACTTCCCCACCCTGGCCGACCTCATCGAGCACATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCTGCGGACTCCACTTCCCCACCCTGGCCGACCTCATCGAGCACATCG

    100     .    :    .
    101 AGGACAACCACATCG
        |||||||||||||||
 100101 AGGACAACCACATCG

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    187 AGATTCATGACAGATGCTGCCCGCCGAGAGCAGGAGTCCCTAAAGAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385160 AGATTCATGACAGATGCTGCCCGCCGAGAGCAGGAGTCCCTAAAGAAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    237 GATTCAGCCGAAGCTCTCGCTGACTCTGTCCAGCTCAGTGTCTCGAGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385210 GATTCAGCCGAAGCTCTCGCTGACTCTGTCCAGCTCAGTGTCTCGAGGGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    287 ATGTGTCCACTCCCCCACGCCACAGCAGTGGAAGCCTTACTCCCCCCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385260 ATGTGTCCACTCCCCCACGCCACAGCAGTGGAAGCCTTACTCCCCCCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    337 ACCCCACCCATCACCCCCTCCTCTTCATTCCGCAGCAGCACTCCGACAG 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 385310 ACCCCACCCATCACCCCCTCCTCTTCATTCCGCAGCAGCACTCCGACAGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    386         GCAGCGAGTATGACGAGGAGGAGGTGGACTATGAGGAGTCGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 385360 TG...CAGGCAGCGAGTATGACGAGGAGGAGGTGGACTATGAGGAGTCGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    428 ACAGCGATGAGTCCTGGACCACAGAGAGTGCCATCAGCTCCGAAGCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 439753 ACAGCGATGAGTCCTGGACCACAGAGAGTGCCATCAGCTCCGAAGCCATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    478 CTCAGCTCCATGTGCATGAATGGAGGGGAAGAGAAGCCTTTTGCCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 439803 CTCAGCTCCATGTGCATGAATGGAGGGGAAGAGAAGCCTTTTGCCTGCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    528 AGTTCCTGGATGTAAAAAGAGATACAAG         AATGTGAATGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 439853 AGTTCCTGGATGTAAAAAGAGATACAAGGTA...CAGAATGTGAATGGCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    569 TAAAGTATCACGCTAAGAATGGTCACAGAACACAGATTCGTGTCCGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447615 TAAAGTATCACGCTAAGAATGGTCACAGAACACAGATTCGTGTCCGCAAA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    619 CCATTCAAGTGTCGCTGTGGGAAGAGTTACAAGACAGCTCAGGGCCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447665 CCATTCAAGTGTCGCTGTGGGAAGAGTTACAAGACAGCTCAGGGCCTGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    669 GCACCACACAATCAATTTCCATCCCCCGGTGTCGGCTGAGATTATCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 447715 GCACCACACAATCAATTTCCATCCCCCGGTGTCGGCTGAGATTATCAGGA

    550     .    :
    719 AGATGCAGCAA
        |||||||||||
 447765 AGATGCAGCAA