seq1 = pF1KB7506.tfa, 720 bp
seq2 = pF1KB7506/gi568815581f_49869469.tfa (gi568815581f:49869469_50073940), 204472 bp

>pF1KB7506 720
>gi568815581f:49869469_50073940 (Chr17)

1-283  (100001-100283)   100% ->
284-480  (103605-103801)   100% ->
481-720  (104233-104472)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCTCTTTGCCCTGCCCCCTCCCCGGCCGGGACGCCTCCAAAGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCTCTTTGCCCTGCCCCCTCCCCGGCCGGGACGCCTCCAAAGCTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCCAGACCTCGCCCCTGTCCCGTCGGTAGCGGCTGCCTACCCGCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCCAGACCTCGCCCCTGTCCCGTCGGTAGCGGCTGCCTACCCGCTTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTGTCCCCTACAACCGCAGCCTCCCCCAATTTGTCCTACTCCAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTGTCCCCTACAACCGCAGCCTCCCCCAATTTGTCCTACTCCAGGCCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TATGGCCACCTCCTGTCTTACCCCTACACCGAGCCAGCGAACCCCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TATGGCCACCTCCTGTCTTACCCCTACACCGAGCCAGCGAACCCCGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCTACCTGTCCTGCCAGCAACCCGCGGCGCTCTCTCAGCCCCTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCTACCTGTCCTGCCAGCAACCCGCGGCGCTCTCTCAGCCCCTCTGCG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GACCTGCAGAGCACCCTCAGGAACTCGAGGCAG         ACTCGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100251 GACCTGCAGAGCACCCTCAGGAACTCGAGGCAGGTA...CAGACTCGGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGCCGCGGCTGTCCCCGGAACCCTCCGAGCGGCGCCCTCAGGCCCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103613 AAGCCGCGGCTGTCCCCGGAACCCTCCGAGCGGCGCCCTCAGGCCCCCGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAAAAGCTCCGCAAGCCGAGGACCATCTACTCCAGCCTGCAGCTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103663 CAAAAAGCTCCGCAAGCCGAGGACCATCTACTCCAGCCTGCAGCTGCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCTAAACCAGCGTTTCCAGCACACGCAGTACCTGGCGCTGCCCGAGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103713 ACCTAAACCAGCGTTTCCAGCACACGCAGTACCTGGCGCTGCCCGAGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCCCAGCTGGCAGCGCAGCTCGGCCTCACCCAGACCCAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 103763 GCCCAGCTGGCAGCGCAGCTCGGCCTCACCCAGACCCAGGTG...AAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAAGATCTGGTTTCAGAACAAACGCTCCAAGTATAAGAAGCTCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104235 AAAGATCTGGTTTCAGAACAAACGCTCCAAGTATAAGAAGCTCCTGAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAATTCTGGGGGGCAGGAAGGGGACTTCCCTGGGAGGACCTTCTCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104285 AGAATTCTGGGGGGCAGGAAGGGGACTTCCCTGGGAGGACCTTCTCTGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 TCTCCCTGCTCCCCACCCCTCCCCTCCCTCTGGGATCTACCCAAGGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104335 TCTCCCTGCTCCCCACCCCTCCCCTCCCTCTGGGATCTACCCAAGGCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 GACCCTGCCCACCAGTGGCTATGGCAACAGCTTTGGAGCCTGGTATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104385 GACCCTGCCCACCAGTGGCTATGGCAACAGCTTTGGAGCCTGGTATCAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .
    683 ATCACTCCTCAGATGTCCTGGCTTCGCCTCAGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104435 ATCACTCCTCAGATGTCCTGGCTTCGCCTCAGATGATG