seq1 = pF1KB7448.tfa, 972 bp
seq2 = pF1KB7448/gi568815587f_4587863.tfa (gi568815587f:4587863_4695010), 107148 bp

>pF1KB7448 972
>gi568815587f:4587863_4695010 (Chr11)

1-972  (6177-7148)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGTCCAGCTTACAACCACACAATGGAAACCCCTGCCTCCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6177 ATGCTGGGTCCAGCTTACAACCACACAATGGAAACCCCTGCCTCCTTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTTGTGGGTATCCCAGGACTGCAATCTTCACATCTTTGGCTGGCTATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6227 CCTTGTGGGTATCCCAGGACTGCAATCTTCACATCTTTGGCTGGCTATCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACTGAGTGCCATGTACATCACAGCCCTGTTAGGAAACACCCTCATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6277 CACTGAGTGCCATGTACATCACAGCCCTGTTAGGAAACACCCTCATCGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGCAATCTGGATGGATTCCACTCGGCATGAGCCCATGTATTGCTTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6327 ACTGCAATCTGGATGGATTCCACTCGGCATGAGCCCATGTATTGCTTTCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTGTGTTCTGGCTGCTGTGGACATTGTTATGGCCTCCTCCGTGGTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6377 GTGTGTTCTGGCTGCTGTGGACATTGTTATGGCCTCCTCCGTGGTACCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AGATGGTGAGCATCTTCTGCTCGGGAGACAGCTCCATCAGCTTTAGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6427 AGATGGTGAGCATCTTCTGCTCGGGAGACAGCTCCATCAGCTTTAGTGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TGTTTCACTCAGATGTTTTTTGTCCACTTAGCCACAGCTGTGGAGACGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6477 TGTTTCACTCAGATGTTTTTTGTCCACTTAGCCACAGCTGTGGAGACGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGCTGCTGACCATGGCTTTTGACCGCTATGTAGCCATCTGCAAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6527 GCTGCTGCTGACCATGGCTTTTGACCGCTATGTAGCCATCTGCAAGCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TACACTACAAGAGAATTCTCACGCCTCAAGTGATGCTGGGAATGAGTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6577 TACACTACAAGAGAATTCTCACGCCTCAAGTGATGCTGGGAATGAGTATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCGTCACCATCAGAGCTGTCACATTCATGACTCCACTGAGTTGGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6627 GCCGTCACCATCAGAGCTGTCACATTCATGACTCCACTGAGTTGGATGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATCATCTACCTTTCTGTGGCTCCAATGTGGTTGTCCACTCCTACTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6677 GAATCATCTACCTTTCTGTGGCTCCAATGTGGTTGTCCACTCCTACTGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGCACATAGCTTTGGCCAGGTTAGCATGTGCTGACCCCGTGCCCAGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6727 AGCACATAGCTTTGGCCAGGTTAGCATGTGCTGACCCCGTGCCCAGCAGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTACAGTCTGATTGGTTCCTCTCTTATGGTGGGCTCTGATGTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6777 CTCTACAGTCTGATTGGTTCCTCTCTTATGGTGGGCTCTGATGTGGCCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CATTGCTGCCTCCTATATCTTAATTCTCAGGGCAGTATTTGATCTCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6827 CATTGCTGCCTCCTATATCTTAATTCTCAGGGCAGTATTTGATCTCTCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CAAAGACTGCTCAGTTGAAAGCATTAAGCACATGTGGCTCCCATGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6877 CAAAGACTGCTCAGTTGAAAGCATTAAGCACATGTGGCTCCCATGTGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GTTATGGCTTTGTACTATCTACCTGGGATGGCATCCATCTATGCGGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6927 GTTATGGCTTTGTACTATCTACCTGGGATGGCATCCATCTATGCGGCCTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GTTGGGGCAGGATATAGTGCCCTTGCACACCCAAGTGCTGCTAGCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   6977 GTTGGGGCAGGATATAGTGCCCTTGCACACCCAAGTGCTGCTAGCTGACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGTACGTGATCATCCCAGCCACTTTAAATCCCATCATCTATGGCATGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7027 TGTACGTGATCATCCCAGCCACTTTAAATCCCATCATCTATGGCATGAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 ACCAAACAATTGCTGGAGGGAATATGGAGTTATCTGATGCACTTCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
   7077 ACCAAACAATTGCTGGAGGGAATATGGAGTTATCTGATGCACTTCCTCTT

    950     .    :    .    :
    951 TGACCACTCCAACCTGGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||
   7127 TGACCACTCCAACCTGGGTTCA