seq1 = pF1KB7438.tfa, 939 bp
seq2 = pF1KB7438/gi568815584f_19647428.tfa (gi568815584f:19647428_19848366), 200939 bp

>pF1KB7438 939
>gi568815584f:19647428_19848366 (Chr14)

1-939  (100001-100939)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAAAAAGAACAAGATTCTAATGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAAAAAGAACAAGATTCTAATGTGACAGAATTTGTTCTTCTGGGCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCATCTTCTTGGGAGCTGCAGCTATTTCTCTTCTTACTATTTTTGTTTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTTACATTGCTATTGTCCTGGGAAACCTCTTGATAGTGGTAACAGTGCAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCCCATGCTCACCTGCTCCAATCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCCATGCTCACCTGCTCCAATCTCCTATGTATTATTTTTTAGGTCATCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCTTTCATTGACCTATGCCTGAGCTGTGTTACTGTGCCAAAGATGTTAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGGATTTCCTACAGCAGGGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGCCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGGATTTCCTACAGCAGGGCAAGAGCATCTCTTTTTCAGGATGCCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTTTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAGATCTACTTCCTCCACTTTCTAGGAGCCAGTGAGATGTTTTTGCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGTCATGGCCTATGACAGGTATGTTGCCATCTGTAACCCTTTGCGCTACC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TTACAGTCATGAACCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TTACAGTCATGAACCCCCAGCTATGCCTTTGGTTGGTTCTTGCCTGCTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGGTCATACTAGTCATCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TGTGGGGGTTTTATCCACTCTATCATGCAGGTCATACTAGTCATCCAGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCCTTTCTGTGGGCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCCTTTCTGTGGGCCCAATGAACTGGACAACTTCTACTGTGATGTCCCAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGTCATCAAGCTGGCCTGCATGGACACCTATGTGGTAGAGGTGCTGGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ATAGCCAACAGTGGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ATAGCCAACAGTGGTCTGCTGTCTCTTGTCTGCTTCTTGGTCTTACTATT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCTGCCAGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCTTATGCTATCATCCTGATCACCCTGAGAACACACTTCTGCCAGGGCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AGAACAAGGTCTTCTCTACCTGTGCTTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AGAACAAGGTCTTCTCTACCTGTGCTTCTCACCTGACAGTGGTCAGCCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATCTTCGTGCCATGCGTATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATCTTCGTGCCATGCGTATTCATCTATTTGAGGCCTTTCTGCAGCTTCTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGTGGATAAGATATTCTCCTTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGTGGATAAGATATTCTCCTTGTTTTACACAGTGATTACACCTATGTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 ACCCCCTCATCTACACACTCAGAAATACTGATATGAAGACAGCTATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 ACCCCCTCATCTACACACTCAGAAATACTGATATGAAGACAGCTATGAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .
    901 AAGCTGAGGATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCCTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAGCTGAGGATAAAACCATGTGGCATTCCATTGCCTTGT