seq1 = pF1KB7437.tfa, 714 bp
seq2 = pF1KB7437/gi568815586r_66037963.tfa (gi568815586r:66037963_66269951), 231989 bp

>pF1KB7437 714
>gi568815586r:66037963_66269951 (Chr12)

(complement)

1-97  (100001-100097)   100% ->
98-206  (116504-116612)   100% ->
207-312  (117576-117681)   100% ->
313-346  (122011-122044)   100% ->
347-464  (123994-124111)   100% ->
465-510  (131183-131228)   100% ->
511-714  (131786-131989)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTGACCCCGACCCCCGGTACCCTCGCTCCTCGATCGAGGACGACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTGACCCCGACCCCCGGTACCCTCGCTCCTCGATCGAGGACGACTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACTATGGCAGCAGCGTGGCCTCCGCCACCGTGCACATCCGAATGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100051 CAACTATGGCAGCAGCGTGGCCTCCGCCACCGTGCACATCCGAATGGGTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     98       CCTTTCTGAGAAAAGTCTACAGCATTCTTTCTCTGCAGGTTCTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ...TAGCCTTTCTGAGAAAAGTCTACAGCATTCTTTCTCTGCAGGTTCTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTAACTACAGTGACTTCAACAGTTTTTTTATACTTTGAGTCTGTACGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116548 TTAACTACAGTGACTTCAACAGTTTTTTTATACTTTGAGTCTGTACGGAC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ATTTGTACATGAGAG         TCCTGCCTTAATTTTGCTGTTTGCCC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 116598 ATTTGTACATGAGAGGTA...CAGTCCTGCCTTAATTTTGCTGTTTGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCGGATCTCTGGGTTTGATTTTTGCGTTGATTTTAAACAGACATAAGTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117602 TCGGATCTCTGGGTTTGATTTTTGCGTTGATTTTAAACAGACATAAGTAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CCCCTTAACCTGTACCTACTTTTTGGATTT         ACGCTGTTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 117652 CCCCTTAACCTGTACCTACTTTTTGGATTTGTG...TAGACGCTGTTGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 AGCTCTGACTGTGGCAGTTGTTG         TTACTTTCTATGATGTAT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 122022 AGCTCTGACTGTGGCAGTTGTTGGTA...CAGTTACTTTCTATGATGTAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 ATATTATTCTGCAAGCTTTCATACTGACTACTACAGTATTTTTTGGTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124012 ATATTATTCTGCAAGCTTTCATACTGACTACTACAGTATTTTTTGGTTTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ACTGTGTATACTCTACAATCTAAGAAGGATTTCAGCAAATTTGGAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124062 ACTGTGTATACTCTACAATCTAAGAAGGATTTCAGCAAATTTGGAGCAGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465          GCTGTTTGCTCTTTTGTGGATATTGTGCCTGTCAGGATTCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124112 GTA...TAGGCTGTTTGCTCTTTTGTGGATATTGTGCCTGTCAGGATTCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TGAAG         TTTTTTTTTTATAGTGAGATAATGGAGTTGGTCTTA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131224 TGAAGGTA...TAGTTTTTTTTTTATAGTGAGATAATGGAGTTGGTCTTA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 GCCGCTGCAGGAGCCCTTCTTTTCTGTGGATTCATCATCTATGACACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131822 GCCGCTGCAGGAGCCCTTCTTTTCTGTGGATTCATCATCTATGACACACA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 CTCACTGATGCATAAACTGTCACCTGAAGAGTACGTATTAGCTGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131872 CTCACTGATGCATAAACTGTCACCTGAAGAGTACGTATTAGCTGCCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 GCCTCTACTTGGATATCATCAATCTATTCCTGCACCTGTTACGGTTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131922 GCCTCTACTTGGATATCATCAATCTATTCCTGCACCTGTTACGGTTTCTG

    750     .    :    .
    697 GAAGCAGTTAATAAAAAG
        ||||||||||||||||||
 131972 GAAGCAGTTAATAAAAAG