seq1 = pF1KB7435.tfa, 420 bp
seq2 = pF1KB7435/gi568815581r_15878050.tfa (gi568815581r:15878050_16099594), 221545 bp

>pF1KB7435 420
>gi568815581r:15878050_16099594 (Chr17)

(complement)

1-76  (100001-100076)   100% ==
99-201  (112227-112329)   100% ->
202-306  (118451-118555)   100% ->
307-420  (121432-121545)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGTAGTGTTGCCGGCGGTTGTGGAGGAGCTCCTGAGCGAGATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGTAGTGTTGCCGGCGGTTGTGGAGGAGCTCCTGAGCGAGATGGC

     50     .    :    .    :    .
     51 GGCGGCGGTGCAGGAGAGCGCGCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCGGCGGTGCAGGAGAGCGCGCGAA

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     99 GCTGAAGTTTCTCTTTGGCTCATCAGCCACCCAGGCCTTGGACCTAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112227 GCTGAAGTTTCTCTTTGGCTCATCAGCCACCCAGGCCTTGGACCTAGTTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    149 ATCGACAGTCCATCACCTTAATCTCATCACCCAGTGGAAGGCGTGTTTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112277 ATCGACAGTCCATCACCTTAATCTCATCACCCAGTGGAAGGCGTGTTTAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    199 CAG         GTCCTTGGAAGTTCCAGTAAAACATACACATGTTTGGC
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112327 CAGGTA...TAGGTCCTTGGAAGTTCCAGTAAAACATACACATGTTTGGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    240 TTCTTGTCATTACTGTTCATGTCCTGCATTTGCATTCTCAGTGCTACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118489 TTCTTGTCATTACTGTTCATGTCCTGCATTTGCATTCTCAGTGCTACGGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    290 AGAGTGACAGCATCCTG         TGCAAGCATCTCTTGGCAGTTTAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 118539 AGAGTGACAGCATCCTGGTG...CAGTGCAAGCATCTCTTGGCAGTTTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331 CTGAGTCAGGTTATGAGGACCTGTCAGCAGCTAAGTGTCTCTGACAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121456 CTGAGTCAGGTTATGAGGACCTGTCAGCAGCTAAGTGTCTCTGACAAGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :
    381 GTTGACTGACATATTATTGATGGAGAAGAAACAAGAAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121506 GTTGACTGACATATTATTGATGGAGAAGAAACAAGAAGCA