seq1 = pF1KB7423.tfa, 729 bp
seq2 = pF1KB7423/gi568815581f_74492047.tfa (gi568815581f:74492047_74692775), 200729 bp

>pF1KB7423 729
>gi568815581f:74492047_74692775 (Chr17)

1-729  (100001-100729)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATGAATTGGCGCTGTCATTTTCCCTGACATGTCTCCTTCCTGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATGAATTGGCGCTGTCATTTTCCCTGACATGTCTCCTTCCTGAGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGAGCGTCTCTGTCTCCAAGCCAGCCGCTGTCATTCCAGTGCCTTAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGAGCGTCTCTGTCTCCAAGCCAGCCGCTGTCATTCCAGTGCCTTAAAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCCAGCCACACTCACCTGGGAGGATGAGAAGCAGCAGAGATGGGGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCCAGCCACACTCACCTGGGAGGATGAGAAGCAGCAGAGATGGGGACAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCACATGGTCCTGTCTCCTCTCCTCTCCTTGGTGATCACAGGTGTCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCACATGGTCCTGTCTCCTCTCCTCTCCTTGGTGATCACAGGTGTCTGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCCCTTCAGGGACTTGAATCCAAGCTCGGAAGTCAACACCGCAAACCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCCCTTCAGGGACTTGAATCCAAGCTCGGAAGTCAACACCGCAAACCTAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCGAATCTCCTTCAAGTCTCTTGCTCACTTCCTGTTACATCTGTAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCGAATCTCCTTCAAGTCTCTTGCTCACTTCCTGTTACATCTGTAGCTAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTCTTTTTACATATTAGGAGAAAAGAGGTGTCATTCTTTGAAAAGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTCTTTTTACATATTAGGAGAAAAGAGGTGTCATTCTTTGAAAAGACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AAGGTACAGTGTATGTTGCAAGGTGTGCCCAAACTTTTGTGCATGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AAGGTACAGTGTATGTTGCAAGGTGTGCCCAAACTTTTGTGCATGTGGAA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AAGAAAATGTGTCCGGGACTGGTCAGGTTTGCACGGGAGTGCACGTAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AAGAAAATGTGTCCGGGACTGGTCAGGTTTGCACGGGAGTGCACGTAGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCAAGGAGCAGGAGGAGCCAGGAGGAACCCAAGCATTGAGGAGCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCAAGGAGCAGGAGGAGCCAGGAGGAACCCAAGCATTGAGGAGCTGCGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATCTACTGCCTGGAGGAGAGGACGGACAAGGCCAGCCATGAGGAGTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATCTACTGCCTGGAGGAGAGGACGGACAAGGCCAGCCATGAGGAGTGCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGGAGAGGAGCACTTTGGGAAGACCACAGTGCACAGGACTCACACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGGAGAGGAGCACTTTGGGAAGACCACAGTGCACAGGACTCACACCCAGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTGCTGGAGAAAGCCCATGCCCCAGGCTTCTTCCAGGCAGCCCCACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTGCTGGAGAAAGCCCATGCCCCAGGCTTCTTCCAGGCAGCCCCACTGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AAGACATCTCATTGCCTCTTCCTGCCCTGGGCTGTCTGACCCACTGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AAGACATCTCATTGCCTCTTCCTGCCCTGGGCTGTCTGACCCACTGCCCC

    700     .    :    .    :    .
    701 TTCCCCCAGGAACACTTCCACTGGGATCA
        |||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TTCCCCCAGGAACACTTCCACTGGGATCA