seq1 = pF1KB7405.tfa, 1455 bp
seq2 = pF1KB7405/gi568815597r_219815452.tfa (gi568815597r:219815452_220028440), 212989 bp

>pF1KB7405 1455
>gi568815597r:219815452_220028440 (Chr1)

(complement)

1-640  (100001-100640)   100% ->
641-718  (101336-101413)   100% ->
719-958  (109947-110186)   100% ->
959-1455  (112493-112989)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCCGCTACTCTGGCAAGACGTGCCGGCTGCTCTTCATGCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGCCGCTACTCTGGCAAGACGTGCCGGCTGCTCTTCATGCTGGTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACCGTCGCCTTCTTCGTGGCGGAGCTGGTCTCCGGCTACCTGGGCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACCGTCGCCTTCTTCGTGGCGGAGCTGGTCTCCGGCTACCTGGGCAACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATCGCGCTGCTCTCCGACTCCTTCAACATGCTCTCCGACCTGATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATCGCGCTGCTCTCCGACTCCTTCAACATGCTCTCCGACCTGATCTCG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGTGCGTGGGCCTGAGCGCCGGCTACATCGCCCGGCGCCCCACCCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGTGCGTGGGCCTGAGCGCCGGCTACATCGCCCGGCGCCCCACCCGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTTCAGCGCCACCTACGGCTACGCCCGCGCCGAGGTGGTGGGCGCGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTTCAGCGCCACCTACGGCTACGCCCGCGCCGAGGTGGTGGGCGCGCTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCAACGCGGTCTTCCTCACCGCGCTCTGCTTCACCATCTTCGTGGAGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCAACGCGGTCTTCCTCACCGCGCTCTGCTTCACCATCTTCGTGGAGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GTGCTGCGCCTGGCCCGGCCCGAGCGCATCGATGACCCCGAGCTGGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GTGCTGCGCCTGGCCCGGCCCGAGCGCATCGATGACCCCGAGCTGGTGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CATCGTCGGCGTCCTGGGGCTGTTGGTCAACGTGGTGGGGCTGCTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CATCGTCGGCGTCCTGGGGCTGTTGGTCAACGTGGTGGGGCTGCTCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TCCAGGACTGCGCCGCCTGGTTCGCGTGCTGCCTCCGGGGACGCAGTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TCCAGGACTGCGCCGCCTGGTTCGCGTGCTGCCTCCGGGGACGCAGTCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGCCTGCAGCAGCGGCAGCAGCTGGCGGAGGGCTGTGTCCCCGGCGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGCCTGCAGCAGCGGCAGCAGCTGGCGGAGGGCTGTGTCCCCGGCGCTTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGGGGGCCTCAGGGCGCGGAGGACCCGCGGCGCGCGGCGGACCCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGGGGGCCTCAGGGCGCGGAGGACCCGCGGCGCGCGGCGGACCCGACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCCAGGCTCGGACTCGGCCGTAACCCTCCGGGGGACCTCGGTGGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCCAGGCTCGGACTCGGCCGTAACCCTCCGGGGGACCTCGGTGGAAAGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGCGGGAGAAGGGGGCGACCGTGTTCGCAAACGTAGCAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 100601 AAGCGGGAGAAGGGGGCGACCGTGTTCGCAAACGTAGCAGGTG...CAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 TGATTCCTTCAACACCCAGAATGAGCCAGAAGACATGATGAAAAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101337 TGATTCCTTCAACACCCAGAATGAGCCAGAAGACATGATGAAAAAAGAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 AAAAGTCTGAAGCTCTGAATATCAGAG         GTGTACTTTTGCAT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 101387 AAAAGTCTGAAGCTCTGAATATCAGAGGTA...CAGGTGTACTTTTGCAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 GTGATGGGAGATGCCCTGGGGTCCGTGGTTGTGGTCATCACGGCCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109961 GTGATGGGAGATGCCCTGGGGTCCGTGGTTGTGGTCATCACGGCCATCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 ATTCTATGTGCTTCCCCTGAAGAGTGAGGACCCGTGTAACTGGCAGTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110011 ATTCTATGTGCTTCCCCTGAAGAGTGAGGACCCGTGTAACTGGCAGTGTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACATTGACCCCAGCCTGACTGTCCTCATGGTCATCATCATTTTGTCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110061 ACATTGACCCCAGCCTGACTGTCCTCATGGTCATCATCATTTTGTCATCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GCCTTCCCGCTTATCAAGGAGACCGCTGCCATTCTGCTACAGATGGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110111 GCCTTCCCGCTTATCAAGGAGACCGCTGCCATTCTGCTACAGATGGTCCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 AAAAGGAGTCAACATGGAAGAGCTGA         TGAGTAAACTCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 110161 AAAAGGAGTCAACATGGAAGAGCTGAGTA...TAGTGAGTAAACTCTCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 CTGTGCCTGGAATTAGCAGTGTACATGAAGTGCACATCTGGGAACTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112508 CTGTGCCTGGAATTAGCAGTGTACATGAAGTGCACATCTGGGAACTTGTA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 AGTGGAAAGATTATTGCCACCCTGCACATCAAGTATCCTAAGGACAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112558 AGTGGAAAGATTATTGCCACCCTGCACATCAAGTATCCTAAGGACAGGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 ATATCAAGATGCCAGCACAAAAATTCGAGAAATCTTCCACCATGCGGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112608 ATATCAAGATGCCAGCACAAAAATTCGAGAAATCTTCCACCATGCGGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TCCACAATGTGACCATCCAGTTTGAAAATGTGGACTTGAAGGAACCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112658 TCCACAATGTGACCATCCAGTTTGAAAATGTGGACTTGAAGGAACCCCTG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAGCAGAAGGACTTACTGTTGCTCTGCAACTCACCCTGCATCTCCAAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112708 GAGCAGAAGGACTTACTGTTGCTCTGCAACTCACCCTGCATCTCCAAGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTGTGCTAAGCAGCTGTGTTGTCCCCCCGGGGCACTGCCTCTGGCTCACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112758 CTGTGCTAAGCAGCTGTGTTGTCCCCCCGGGGCACTGCCTCTGGCTCACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCAATGGCTGTGCTGAGCACAATGGTGGGCCCTCTCTAGACACATACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112808 TCAATGGCTGTGCTGAGCACAATGGTGGGCCCTCTCTAGACACATACGGA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AGTGATGGCCTCAGTAGAAGAGACGCAAGAGAAGTGGCTATTGAAGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112858 AGTGATGGCCTCAGTAGAAGAGACGCAAGAGAAGTGGCTATTGAAGTGTC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 TTTGGATAGCTGTCTGAGTGACCACGGACAAAGTCTTAACAAAACTCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112908 TTTGGATAGCTGTCTGAGTGACCACGGACAAAGTCTTAACAAAACTCAGG

   1450     .    :    .    :    .    :
   1424 AGGACCAATGTTATGTCAACAGAACGCATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 112958 AGGACCAATGTTATGTCAACAGAACGCATTTT