seq1 = pF1KB7390.tfa, 963 bp
seq2 = pF1KB7390/gi568815587r_68880024.tfa (gi568815587r:68880024_69080986), 200963 bp

>pF1KB7390 963
>gi568815587r:68880024_69080986 (Chr11)

(complement)

1-963  (100001-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAACCAGACTTTGAATAGCAGTGGGACCGTGGAGTCAGCCCTAAACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAACCAGACTTTGAATAGCAGTGGGACCGTGGAGTCAGCCCTAAACTA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTCCAGAGGGAGCACAGTGCACACGGCCTACCTGGTGCTGAGCTCCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTCCAGAGGGAGCACAGTGCACACGGCCTACCTGGTGCTGAGCTCCCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCATGTTCACCTGCCTGTGCGGGATGGCAGGCAACAGCATGGTGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCATGTTCACCTGCCTGTGCGGGATGGCAGGCAACAGCATGGTGATCTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTGCTGGGCTTTCGAATGCACAGGAACCCCTTCTGCATCTATATCCTCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTGCTGGGCTTTCGAATGCACAGGAACCCCTTCTGCATCTATATCCTCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCTGGCGGCAGCCGACCTCCTCTTCCTCTTCAGCATGGCTTCCACGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCTGGCGGCAGCCGACCTCCTCTTCCTCTTCAGCATGGCTTCCACGCTCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCCTGGAAACCCAGCCCCTGGTCAATACCACTGACAAGGTCCACGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCCTGGAAACCCAGCCCCTGGTCAATACCACTGACAAGGTCCACGAGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ATGAAGAGACTGATGTACTTTGCCTACACAGTGGGCCTGAGCCTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ATGAAGAGACTGATGTACTTTGCCTACACAGTGGGCCTGAGCCTGCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCATCAGCACCCAGCGCTGTCTCTCTGTCCTCTTCCCTATCTGGTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCATCAGCACCCAGCGCTGTCTCTCTGTCCTCTTCCCTATCTGGTTCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTGTCACCGGCCCAGGCACCTGTCAGCCTGGGTGTGTGGCCTGCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTGTCACCGGCCCAGGCACCTGTCAGCCTGGGTGTGTGGCCTGCTGTGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACACTCTGTCTCCTGATGAACGGGTTGACCTCTTCCTTCTGCAGCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACACTCTGTCTCCTGATGAACGGGTTGACCTCTTCCTTCTGCAGCAAGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTTGAAATTCAATGAAGATCGGTGCTTCAGGGTGGACATGGTCCAGGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTTGAAATTCAATGAAGATCGGTGCTTCAGGGTGGACATGGTCCAGGCCG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 CCCTCATCATGGGGGTCTTAACCCCAGTGATGACTCTGTCCAGCCTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 CCCTCATCATGGGGGTCTTAACCCCAGTGATGACTCTGTCCAGCCTGACC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTCTTTGTCTGGGTGCGGAGGAGCTCCCAGCAGTGGCGGCGGCAGCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTCTTTGTCTGGGTGCGGAGGAGCTCCCAGCAGTGGCGGCGGCAGCCCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ACGGCTGTTCGTGGTGGTCCTGGCCTCTGTCCTGGTGTTCCTCATCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 ACGGCTGTTCGTGGTGGTCCTGGCCTCTGTCCTGGTGTTCCTCATCTGTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCCTGCCTCTGAGCATCTACTGGTTTGTGCTCTACTGGTTGAGCCTGCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCCTGCCTCTGAGCATCTACTGGTTTGTGCTCTACTGGTTGAGCCTGCCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCCGAGATGCAGGTCCTGTGCTTCAGCTTGTCACGCCTCTCCTCGTCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCCGAGATGCAGGTCCTGTGCTTCAGCTTGTCACGCCTCTCCTCGTCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 AAGCAGCAGCGCCAACCCCGTCATCTACTTCCTGGTGGGCAGCCGGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 AAGCAGCAGCGCCAACCCCGTCATCTACTTCCTGGTGGGCAGCCGGAGGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCCACAGGCTGCCCACCAGGTCCCTGGGGACTGTGCTCCAACAGGCGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCCACAGGCTGCCCACCAGGTCCCTGGGGACTGTGCTCCAACAGGCGCTT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCGAGGAGCCCGAGCTGGAAGGTGGGGAGACGCCCACCGTGGGCACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCGAGGAGCCCGAGCTGGAAGGTGGGGAGACGCCCACCGTGGGCACCAA

    950     .    :
    951 TGAGATGGGGGCT
        |||||||||||||
 100951 TGAGATGGGGGCT