seq1 = pF1KB7383.tfa, 1050 bp
seq2 = pF1KB7383/gi568815582f_14726291.tfa (gi568815582f:14726291_14865410), 139120 bp

>pF1KB7383 1050
>gi568815582f:14726291_14865410 (Chr16)

1-63  (24523-24585)   100% ->
64-192  (28902-29030)   99% ->
193-292  (32657-32756)   100% ->
293-437  (32920-33064)   99% ->
438-545  (36022-36129)   99% ->
546-606  (37148-37208)   100% ->
607-642  (37318-37353)   100% ->
643-1050  (38713-39120)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTTGTTGCTTAGGATATGAATGGCTGAGCGGAGGCTGTAAAACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  24523 ATGTTTTGTTGCTTAGGATATGAATGGCTGAGCGGAGGCTGTAAAACCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCACTCTGCTTGG         GTTATCAATACTCTGGCTGACCATCGTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
  24573 GCACTCTGCTTGGGTA...CAGGTTATCAATACTCTGGCTGACCATCGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATCGTGGGACTGACTTTGGTGGAAGTCCTTGGTTACTTATCATTACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  28930 ATCGTGGGACTGACTTTGGTGGAAGTCCTTGGTTACTTATCATTACTGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTTCTGAGAAGTTATAAATTTGCCATCTCCCTCTGCACAACTTACCTTTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  28980 TTTCTGAGAAGTTATAAATTTGCCATCTCCCTCTGCACAAGTTACCTTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 T         GTGTCTTTCCTGAAGACTATCTTCCCGTCTCAAAATGGAC
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  29030 TGTG...TAGGTGTCTTTCCTGAAGACTATCTTCCCGTCTCAAAATGGAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ATGATGGATCCACGGATGTACAGCAGAGAGCCAGGAGGTCCAACCGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  32697 ATGATGGATCCACGGATGTACAGCAGAGAGCCAGGAGGTCCAACCGCCGT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGACAGGAAG         GAATTAAAATTGTCCTGGAAGACATCTTTAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
  32747 AGACAGGAAGGTA...CAGGAATTAAAATTGTCCTGGAAGACATCTTTAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TTTATGGAGACAGGTGGAAACCAAAGTTCGAGCTAAAATCCGTAAGATGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
  32951 TTTATGGAGACAGGTGGAAACCAAAGTTCGAGCTAAAATCTGTAAGATGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AGGTGACAACAAAAGTCAACCGTCATGACAAAATCAATGGAAAGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  33001 AGGTGACAACAAAAGTCAACCGTCATGACAAAATCAATGGAAAGAGGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ACCGCCAAAGAACA         TCTGAGGAAACTAAGCATGAAAGAACG
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
  33051 ACCGCCAAAGAACAGTA...TAGTCTGAGGAAACTAAGCATGAAAGAACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGAGCACGGAGAAAAGGAGAGGCAGGTGTCAGAGGCAGAGGAAAATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
  36049 TGAGCACGGAGAAAAGGAGAGGCAGGTGTCAGAGGCAGAGGAAAACGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AATTGGATATGAAAGAAATACACACCTACAT         GGAAATGTTT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
  36099 AATTGGATATGAAAGAAATACACACCTACATGTG...TAGGGAAATGTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 CAACGTGCGCAAGCGTTGCGGCGGCGGGCAGAGGACTACTACAGATGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  37158 CAACGTGCGCAAGCGTTGCGGCGGCGGGCAGAGGACTACTACAGATGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 A         ATCACCCCTTCTGCAAGAAAGCCTCTTTGCAACCGG    
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
  37208 AGTA...CAGATCACCCCTTCTGCAAGAAAGCCTCTTTGCAACCGGGTA.

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    643      GTCAGAATGGCGGCAGTGGAGCATCGTCATTCTTCAGGATTGCCC
        ..>>>|||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
  37358 ..CAGGTCAGAATGGCGGCAGCGGAGCATCGTCATTCTTCAGGATTGCCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 TACTGGCCCTACCTCACAGCTGAAACTTTAAAAAACAGGATGGGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  38758 TACTGGCCCTACCTCACAGCTGAAACTTTAAAAAACAGGATGGGCCACCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GCCACCTCCTCCAACTCAACAACATTCTATAATTGATAACTCCCTGAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  38808 GCCACCTCCTCCAACTCAACAACATTCTATAATTGATAACTCCCTGAGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TCAAGACACCTTCCGAGTGTCTGCTCACTCCCCTTCCACCCTCAGCTCTA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  38858 TCAAGACACCTCCCGAGTGTCTGCTCACTCCCCTTCCACCCTCAGCTCTA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CCCTCAGCGGATGATAATCTCAAGACACCTGCGGAGTGTCTGCTCTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  38908 CCCTCAGCGGATGATAATCTCAAGACACCTGCGGAGTGTCTGCTCTATCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CCTTCCACCCTCAGCGGATGATAATCTCAAGACACCTCCCGAGTGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  38958 CCTTCCACCCTCAGCGGATGATAATCTCAAGACACCTCCCGAGTGTCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 TCACTCCCCTTCCACCCTCAGCTCCACCCTCAGCGGATGATAATCTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  39008 TCACTCCCCTTCCACCCTCAGCTCCACCCTCAGCGGATGATAATCTCAAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ACACCTCCCGAGTGTGTCTGCTCACTCCCCTTCCACCCTCAGCGGATGAT
        ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  39058 ACACCTCCCAAGTGTGTCTGCTCACTCCCCTTCCACCCTCAGCGGATGAT

   1100     .    :
   1038 AATCTCAAGAAAC
        |||||||||||||
  39108 AATCTCAAGAAAC