seq1 = pF1KB7359.tfa, 1017 bp
seq2 = pF1KB7359/gi568815583r_50400772.tfa (gi568815583r:50400772_50646525), 245754 bp

>pF1KB7359 1017
>gi568815583r:50400772_50646525 (Chr15)

(complement)

1-53  (100001-100053)   100% ->
54-248  (101745-101939)   100% ->
249-459  (102716-102928)   98% ->
460-675  (105262-105477)   100% ->
676-818  (107675-107817)   100% ->
819-951  (116597-116729)   100% ->
952-1017  (145689-145754)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTCTCAGCCGTCTCTCCCTGCAGATGACTTCGATATCTACCACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTCTCAGCCGTCTCTCCCTGCAGATGACTTCGATATCTACCACGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCT         TGCAGAGTGCACAGATTACTATGATACCCTTCCAGTTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGTG...CAGTGCAGAGTGCACAGATTACTATGATACCCTTCCAGTTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGGAGGCTGATGGGAACCAGCCCCATTTTCAGGGTGTCACTGGCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101783 AGGAGGCTGATGGGAACCAGCCCCATTTTCAGGGTGTCACTGGCTTGTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTTGGGCAACACATGCTGCGTGAATGCCATCTCACAGTGTCTCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101833 AACTTGGGCAACACATGCTGCGTGAATGCCATCTCACAGTGTCTCTGCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CATCTTGCCGCTGGTGGAATACTTTCTCACCGGGAAGTATATCACCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101883 CATCTTGCCGCTGGTGGAATACTTTCTCACCGGGAAGTATATCACCGCTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAAAA           GTTTCTTCTTCCAAGCGATTGCAGTGAAGTTG
        |||||||>>>...>>>-- |||||||||||||||||||||||||||||||
 101933 TGCAAAAGTA...TATCCCTTTCTTCTTCCAAGCGATTGCAGTGAAGTTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    281 CCACTGCTTTTGCCTATCTGATGACAGACATGTGGCTGGGAGACTCAGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102750 CCACTGCTTTTGCCTATCTGATGACAGACATGTGGCTGGGAGACTCAGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    331 TGTGTCTCACCAGAAATATTCTGGTCAGCTCTTGGCAACCTCTACCCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102800 TGTGTCTCACCAGAAATATTCTGGTCAGCTCTTGGCAACCTCTACCCAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    381 ATTTACGAAAAAGATGCAACAAGATGCTCAGGAATTCTTGATTTGTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102850 ATTTACGAAAAAGATGCAACAAGATGCTCAGGAATTCTTGATTTGTGTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    431 TAAATGAACTTCATGAAGCTCTAAAAAAG         TACCACTACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 102900 TAAATGAACTTCATGAAGCTCTAAAAAAGGTA...CAGTACCACTACTCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472 CGGAGAAGATCATATGAGAAAGGATCTACTCAGAGATGCTGCAGGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105274 CGGAGAAGATCATATGAGAAAGGATCTACTCAGAGATGCTGCAGGAAGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    522 GATTACCACTGAGACATCCATCATCACCCAGCTGTTTGAAGAGCAGCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105324 GATTACCACTGAGACATCCATCATCACCCAGCTGTTTGAAGAGCAGCTCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    572 ATTATAGCATCGTATGTTTAAAGTGTGAGAAATGCACCTACAAGAACGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105374 ATTATAGCATCGTATGTTTAAAGTGTGAGAAATGCACCTACAAGAACGAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    622 GTCTTCACTGTCTTCTCACTCCCCATTCCATCCAAATATGAATGCTCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105424 GTCTTCACTGTCTTCTCACTCCCCATTCCATCCAAATATGAATGCTCCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    672 TCGG         GACTGTCTCCAATGTTTTTTTCAACAAGACGCACTGA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105474 TCGGGTA...CAGGACTGTCTCCAATGTTTTTTTCAACAAGACGCACTGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    713 CCTGGAACAACGAAATTCACTGCTCCTTTTGTGAAACCAAGCAAGAAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107712 CCTGGAACAACGAAATTCACTGCTCCTTTTGTGAAACCAAGCAAGAAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    763 GCTGTGAGGGCCAGTATTTCCAAAGCACCAAAAATAATTATTTTCCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107762 GCTGTGAGGGCCAGTATTTCCAAAGCACCAAAAATAATTATTTTCCACCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    813 AAAAAG         GTTTGACATTCAGGGTACAACAAAAAGGAAGCTGA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107812 AAAAAGGTA...CAGGTTTGACATTCAGGGTACAACAAAAAGGAAGCTGA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    854 GAACGGATATTCATTACCCACTCACTAACTTGGACCTCACTCCTTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116632 GAACGGATATTCATTACCCACTCACTAACTTGGACCTCACTCCTTATATT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    904 TGCTCAATTTTCCGGAAATATCCTAAATACAACCTCTGTGCAGTGGTG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 116682 TGCTCAATTTTCCGGAAATATCCTAAATACAACCTCTGTGCAGTGGTGGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    952        AACCATTTTGGTGATTTGGATGGTGGCCACTACACTGCTTTCT
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116732 G...TAGAACCATTTTGGTGATTTGGATGGTGGCCACTACACTGCTTTCT

   1050     .    :    .    :
    995 GCAAGAATTCAGTCACCCAGGCC
        |||||||||||||||||||||||
 145732 GCAAGAATTCAGTCACCCAGGCC