Result of SIM4 for
pF1KB7355
seq1 = pF1KB7355.tfa, 3264 bp
seq2 = pF1KB7355/gi568815593f_170778095.tfa (gi568815593f:170778095_171398855), 620761 bp
>pF1KB7355 3264
>gi568815593f:170778095_171398855 (Chr5)
1-18 (83940-83957) 100% ->
19-165 (100003-100149) 100% ->
166-256 (103712-103802) 100% ->
257-423 (114293-114459) 100% ->
424-489 (117956-118021) 100% ->
490-594 (131567-131671) 100% ->
595-760 (132875-133040) 100% ->
761-834 (136073-136146) 100% ->
835-954 (138371-138490) 100% ->
955-1101 (140619-140765) 100% ->
1102-1274 (141347-141519) 100% ->
1275-1468 (146263-146456) 100% ->
1469-1574 (175503-175608) 100% ->
1575-1710 (190148-190283) 100% ->
1711-1784 (392036-392109) 100% ->
1785-1860 (393112-393187) 100% ->
1861-1929 (405070-405136) 94% ->
1930-2038 (405228-405336) 100% ->
2039-2142 (421576-421679) 100% ->
2143-2231 (427430-427518) 100% ->
2232-2339 (435537-435644) 100% ->
2340-2422 (443664-443746) 100% ->
2423-2637 (462834-463048) 100% ->
2638-2776 (464588-464726) 100% ->
2777-2943 (487587-487753) 100% ->
2944-3042 (515789-515887) 100% ->
3043-3170 (517793-517920) 100% ->
3171-3264 (520668-520761) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGGCGCTGCACTTCCAG AGTTTGGCTGAATTGGAAGTGTT
||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
83940 ATGGCGCTGCACTTCCAGGTC...AAGAGTTTGGCTGAATTGGAAGTGTT
50 . : . : . : . : . :
42 ATGTACTCATCTCTACATAGGGACTGATCTTACACAAAGAATAGAGGCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100026 ATGTACTCATCTCTACATAGGGACTGATCTTACACAAAGAATAGAGGCTG
100 . : . : . : . : . :
92 AGAAAGCACTCTTGGAACTTATTGACAGTCCAGAATGTCTCAGCAAGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100076 AGAAAGCACTCTTGGAACTTATTGACAGTCCAGAATGTCTCAGCAAGTGT
150 . : . : . : . : . :
142 CAACTTTTATTAGAACAAGGAACA ACATCCTATGCTCAGCT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
100126 CAACTTTTATTAGAACAAGGAACAGTA...CAGACATCCTATGCTCAGCT
200 . : . : . : . : . :
183 CCTTGCAGCAACATGTCTTTCAAAACTTGTCAGCCGAGTCAGTCCTTTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
103729 CCTTGCAGCAACATGTCTTTCAAAACTTGTCAGCCGAGTCAGTCCTTTAC
250 . : . : . : . : . :
233 CTGTTGAGCAGAGGATGGACATCA GAAACTACATTCTGAAT
||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
103779 CTGTTGAGCAGAGGATGGACATCAGTA...TAGGAAACTACATTCTGAAT
300 . : . : . : . : . :
274 TACGTGGCATCACAGCCCAAGCTGGCTCCCTTTGTCATCCAAGCTCTTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114310 TACGTGGCATCACAGCCCAAGCTGGCTCCCTTTGTCATCCAAGCTCTTAT
350 . : . : . : . : . :
324 TCAAGTCATTGCTAAAATCACTAAGTTGGGGTGGTTTGAGGTTCAGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114360 TCAAGTCATTGCTAAAATCACTAAGTTGGGGTGGTTTGAGGTTCAGAAAG
400 . : . : . : . : . :
374 ACCAATTTGTCTTCAGAGAAATTATTGCTGATGTGAAGAAGTTTCTCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114410 ACCAATTTGTCTTCAGAGAAATTATTGCTGATGTGAAGAAGTTTCTCCAG
450 . : . : . : . : . :
424 GGTACTGTGGAACACTGCATAATAGGAGTAATAATCCTTTC
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
114460 GTA...AAGGGTACTGTGGAACACTGCATAATAGGAGTAATAATCCTTTC
500 . : . : . : . : . :
465 TGAATTGACTCAGGAAATGAACCTG GTTGATTATTCTAGAC
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
117997 TGAATTGACTCAGGAAATGAACCTGGTA...TAGGTTGATTATTCTAGAC
550 . : . : . : . : . :
506 CTTCAGCAAAACACAGGAAAATAGCTACCTCATTTCGTGATACTTCTCTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131583 CTTCAGCAAAACACAGGAAAATAGCTACCTCATTTCGTGATACTTCTCTC
600 . : . : . : . : . :
556 AAAGACGTTTTAGTGCTAGCATGCTCTCTTTTAAAAGAG GT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
131633 AAAGACGTTTTAGTGCTAGCATGCTCTCTTTTAAAAGAGGTA...CAGGT
650 . : . : . : . : . :
597 GTTTGCCAAACCTTTAAATCTTCAGGATCAATGTCAGCAAAATCTGGTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132877 GTTTGCCAAACCTTTAAATCTTCAGGATCAATGTCAGCAAAATCTGGTAA
700 . : . : . : . : . :
647 TGCAGGTCTTGAAACTGGTCCTTAACTGCCTTAACTTTGACTTCATTGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132927 TGCAGGTCTTGAAACTGGTCCTTAACTGCCTTAACTTTGACTTCATTGGC
750 . : . : . : . : . :
697 AGTTCAGCAGATGAATCTGCAGATGATCTTTGCACGGTGCAGATTCCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
132977 AGTTCAGCAGATGAATCTGCAGATGATCTTTGCACGGTGCAGATTCCAAC
800 . : . : . : . : . :
747 AACTTGGAGAACAA TTTTCCTGGAACCAGAAACATTGGATC
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
133027 AACTTGGAGAACAAGTA...CAGTTTTCCTGGAACCAGAAACATTGGATC
850 . : . : . : . : . :
788 TTTTCTTCAATTTGTATCATTCACTTCCACCACTACTATCTCAGTTA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
136100 TTTTCTTCAATTTGTATCATTCACTTCCACCACTACTATCTCAGTTAGTA
900 . : . : . : . : . :
835 GCACTTTCATGTTTAGTTCAGTTTGCTTCGACAAGAAGGTCCTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136150 ...TAGGCACTTTCATGTTTAGTTCAGTTTGCTTCGACAAGAAGGTCCTT
950 . : . : . : . : . :
879 ATTTAACAGTCCTGAACGTGCCAAGTACCTTGGTAATTTAATTAAGGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
138415 ATTTAACAGTCCTGAACGTGCCAAGTACCTTGGTAATTTAATTAAGGGAG
1000 . : . : . : . : . :
929 TAAAAAGGATACTTGAAAACCCTCAG GGTTTGTCTGATCCA
||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
138465 TAAAAAGGATACTTGAAAACCCTCAGGTA...TAGGGTTTGTCTGATCCA
1050 . : . : . : . : . :
970 GGTAATTATCATGAATTTTGTCGATTTTTGGCTCGTTTAAAGACAAATTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140634 GGTAATTATCATGAATTTTGTCGATTTTTGGCTCGTTTAAAGACAAATTA
1100 . : . : . : . : . :
1020 TCAGCTGGGAGAATTAGTTATGGTGAAGGAATATCCTGAAGTTATTAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
140684 TCAGCTGGGAGAATTAGTTATGGTGAAGGAATATCCTGAAGTTATTAGAT
1150 . : . : . : . : . :
1070 TGATTGCTAATTTTACCATTACTAGCCTACAG CACTGGGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
140734 TGATTGCTAATTTTACCATTACTAGCCTACAGGTA...TAGCACTGGGAA
1200 . : . : . : . : . :
1111 TTTGCTCCTAACAGTGTTCATTATTTATTAACTCTGTGGCAAAGGATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141356 TTTGCTCCTAACAGTGTTCATTATTTATTAACTCTGTGGCAAAGGATGGT
1250 . : . : . : . : . :
1161 AGCATCTGTTCCTTTTGTGAAATCAACTGAACCCCACCTATTAGACACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141406 AGCATCTGTTCCTTTTGTGAAATCAACTGAACCCCACCTATTAGACACTT
1300 . : . : . : . : . :
1211 ATGCACCAGAAATCACGAAGGCCTTTATCACTTCTCGGTTGGACTCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
141456 ATGCACCAGAAATCACGAAGGCCTTTATCACTTCTCGGTTGGACTCTGTT
1350 . : . : . : . : . :
1261 GCCATAGTTGTGAG AGATCACTTAGATGATCCACTGGATGA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
141506 GCCATAGTTGTGAGGTA...CAGAGATCACTTAGATGATCCACTGGATGA
1400 . : . : . : . : . :
1302 TACTGCCACTGTGTTTCAGCAGTTGGAGCAGTTGTGCACGGTCAGCAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146290 TACTGCCACTGTGTTTCAGCAGTTGGAGCAGTTGTGCACGGTCAGCAGAT
1450 . : . : . : . : . :
1352 GTGAATATGAAAAGACATGTGCTCTTCTTGTGCAGTTATTCGACCAAAAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146340 GTGAATATGAAAAGACATGTGCTCTTCTTGTGCAGTTATTCGACCAAAAT
1500 . : . : . : . : . :
1402 GCACAGAATTACCAAAAACTTCTGCATCCATATTCTGGTGTAACTGTGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
146390 GCACAGAATTACCAAAAACTTCTGCATCCATATTCTGGTGTAACTGTGGA
1550 . : . : . : . : . :
1452 CATCACCATTCAGGAAG GACGTCTTGCATGGCTGGTATACT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
146440 CATCACCATTCAGGAAGGTC...TAGGACGTCTTGCATGGCTGGTATACT
1600 . : . : . : . : . :
1493 TAGTTGGGACAGTTGTAGGAGGAAGATTAACATATACCAGTACAGATGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175527 TAGTTGGGACAGTTGTAGGAGGAAGATTAACATATACCAGTACAGATGAG
1650 . : . : . : . : . :
1543 CATGATGCTATGGATGGAGAATTATCCTGTCG AGTTTTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
175577 CATGATGCTATGGATGGAGAATTATCCTGTCGGTA...AAGAGTTTTTCA
1700 . : . : . : . : . :
1584 GCTTATATCTTTAATGGATACCGGATTGCCTCGATGTTGTAATGAGAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
190157 GCTTATATCTTTAATGGATACCGGATTGCCTCGATGTTGTAATGAGAAAA
1750 . : . : . : . : . :
1634 TAGAGCTTGCAATTCTGTGGTTCTTGGATCAGTTTCGTAAAACATATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
190207 TAGAGCTTGCAATTCTGTGGTTCTTGGATCAGTTTCGTAAAACATATGTT
1800 . : . : . : . : . :
1684 GGTGATCAACTTCAAAGAACCTCAAAG GTATATGCTCGTAT
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
190257 GGTGATCAACTTCAAAGAACCTCAAAGGTA...CAGGTATATGCTCGTAT
1850 . : . : . : . : . :
1725 GTCAGAAGTCTTAGGAATAACAGATGACAACCACGTTCTAGAGACGTTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
392050 GTCAGAAGTCTTAGGAATAACAGATGACAACCACGTTCTAGAGACGTTCA
1900 . : . : . : . : . :
1775 TGACAAAAAT TGTTACAAACCTTAAATACTGGGGAAGATAT
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
392100 TGACAAAAATGTG...TAGTGTTACAAACCTTAAATACTGGGGAAGATAT
1950 . : . : . : . : . :
1816 GAGCCTGTAATTTCAAGGACTCTTCAGTTCCTAAATGACCTTTCT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
393143 GAGCCTGTAATTTCAAGGACTCTTCAGTTCCTAAATGACCTTTCTGTT..
2000 . : . : . : . : . :
1861 GTTGGTTATATCCTTTTAAAAAAACTTGTGAAGATAGATGCTGTGA
.>>>-| -|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
393193 .TAT TAC TTATATCCTTTTAAAAAAACTTGTGAAGATAGATGCTGTGA
2050 . : . : . : . : . :
1907 AATTCATGCTAAAAAACCACACG AGTGAACACTTCCCTTTT
|||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
405114 AATTCATGCTAAAAAACCACACGGTA...TAGAGTGAACACTTCCCTTTT
2100 . : . : . : . : . :
1948 CTTGGCATCAGTGACAATCATAGTCTCAGCGACTTCAGGTGTCGAACAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
405246 CTTGGCATCAGTGACAATCATAGTCTCAGCGACTTCAGGTGTCGAACAAC
2150 . : . : . : . : . :
1998 CTTCTACACAGCGCTCACTCGCCTTCTGATGGTAGATCTGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
405296 CTTCTACACAGCGCTCACTCGCCTTCTGATGGTAGATCTGGGTA...TAG
2200 . : . : . : . : . :
2039 GTGAAGATGAGGATGAATTTGAGAATTTCATGCTGCCTCTTACAGTTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421576 GTGAAGATGAGGATGAATTTGAGAATTTCATGCTGCCTCTTACAGTTGCT
2250 . : . : . : . : . :
2089 TTTGAAACAGTATTACAAATATTCAACAACAACTTTAAACAAGAAGATGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421626 TTTGAAACAGTATTACAAATATTCAACAACAACTTTAAACAAGAAGATGT
2300 . : . : . : . : . :
2139 AAAG CGTATGTTGATCGGGCTGGCAAGAGATCTTCGAGGGA
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
421676 AAAGGTG...CAGCGTATGTTGATCGGGCTGGCAAGAGATCTTCGAGGGA
2350 . : . : . : . : . :
2180 TTGCCTTTGCACTGAACACAAAGACCAGCTACACCATGCTGTTTGACTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
427467 TTGCCTTTGCACTGAACACAAAGACCAGCTACACCATGCTGTTTGACTGG
2400 . : . : . : . : . :
2230 AT GTACCCAACGTACCTTCCCCTTCTTCAGAATGCTGTTGA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
427517 ATGTA...AAGGTACCCAACGTACCTTCCCCTTCTTCAGAATGCTGTTGA
2450 . : . : . : . : . :
2271 ACGGTGGTATGGAGAGCCAACATGTACAACTCCCATCTTGAAACTTATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
435576 ACGGTGGTATGGAGAGCCAACATGTACAACTCCCATCTTGAAACTTATGG
2500 . : . : . : . : . :
2321 CAGAACTTATGCAAAACAG ATCCCAGCGTTTGAATTTTGAT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
435626 CAGAACTTATGCAAAACAGGTA...TAGATCCCAGCGTTTGAATTTTGAT
2550 . : . : . : . : . :
2362 GTATCATCTCCTAATGGAATTCTTCTCTTCAGAGAAGCTAGTAAAATGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
443686 GTATCATCTCCTAATGGAATTCTTCTCTTCAGAGAAGCTAGTAAAATGGT
2600 . : . : . : . : . :
2412 TTGCACTTATG GTAATCAGATCCTGTCCCTTGGGAGCCTCT
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
443736 TTGCACTTATGGTG...CAGGTAATCAGATCCTGTCCCTTGGGAGCCTCT
2650 . : . : . : . : . :
2453 CAAAAGATCAGATTTATCCAATGAAACTCAAGGGCATCTCCATCTGCTAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462864 CAAAAGATCAGATTTATCCAATGAAACTCAAGGGCATCTCCATCTGCTAT
2700 . : . : . : . : . :
2503 TCAGCTCTCAAGTCTGCCTTGTGTGGAAATTATGTCAGCTTTGGCGTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462914 TCAGCTCTCAAGTCTGCCTTGTGTGGAAATTATGTCAGCTTTGGCGTCTT
2750 . : . : . : . : . :
2553 CAAGTTGTATGGGGACAACCATTTTGACAATGTACTCCAGGCTTTTGTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
462964 CAAGTTGTATGGGGACAACCATTTTGACAATGTACTCCAGGCTTTTGTCA
2800 . : . : . : . : . :
2603 AAATGCTGCTGTCAGTGTCCCACAGTGACTTGCTA CAATAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
463014 AAATGCTGCTGTCAGTGTCCCACAGTGACTTGCTAGTA...TAGCAATAC
2850 . : . : . : . : . :
2644 CGGAAACTGAGCCAGTCTTATTATCCACTCCTGGAATGTCTCACTCAGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
464594 CGGAAACTGAGCCAGTCTTATTATCCACTCCTGGAATGTCTCACTCAGGA
2900 . : . : . : . : . :
2694 CCATATGAGCTTCATCATCAACTTAGAGCCTCCTGTACTCATGTATGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
464644 CCATATGAGCTTCATCATCAACTTAGAGCCTCCTGTACTCATGTATGTTC
2950 . : . : . : . : . :
2744 TCACATCTATCTCAGAGGGACTCACTACTCTTG ATACAGTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
464694 TCACATCTATCTCAGAGGGACTCACTACTCTTGGTA...CAGATACAGTT
3000 . : . : . : . : . :
2785 GTCTCCTCCAGCTGCTGTACCAGTTTAGACTACATCGTCACCTACCTCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
487595 GTCTCCTCCAGCTGCTGTACCAGTTTAGACTACATCGTCACCTACCTCTT
3050 . : . : . : . : . :
2835 CAAGCACATAGCAAAAGAGGGCAAGAAGCCACTTCGATGCAGAGAGGCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
487645 CAAGCACATAGCAAAAGAGGGCAAGAAGCCACTTCGATGCAGAGAGGCTA
3100 . : . : . : . : . :
2885 CCCAGGCTGGTCAGAGACTATTACATTTTATGCAGCAAAACCCAGATGTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
487695 CCCAGGCTGGTCAGAGACTATTACATTTTATGCAGCAAAACCCAGATGTC
3150 . : . : . : . : . :
2935 CTGCAGCAG ATGATGTCTGTCCTCATGAACACCATTGTCTT
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
487745 CTGCAGCAGGTA...TAGATGATGTCTGTCCTCATGAACACCATTGTCTT
3200 . : . : . : . : . :
2976 TGAAGACTGTCGGAACCAGTGGTCAGTATCCAGGCCTCTCCTGGGGCTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
515821 TGAAGACTGTCGGAACCAGTGGTCAGTATCCAGGCCTCTCCTGGGGCTCA
3250 . : . : . : . : . :
3026 TCCTGCTCAATGAGAAG TATTTCAGTGAACTGAGAGCAAGT
|||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
515871 TCCTGCTCAATGAGAAGGTG...CAGTATTTCAGTGAACTGAGAGCAAGT
3300 . : . : . : . : . :
3067 TTGATAAACAGCCAGCCCCTCCCCAAGCAGGAGGTCCTTGCCCAGTGCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
517817 TTGATAAACAGCCAGCCCCTCCCCAAGCAGGAGGTCCTTGCCCAGTGCTT
3350 . : . : . : . : . :
3117 CAGAAACCTAATGGAAGGAGTGGAGCAGAACCTGTCCGTCAAGAACAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
517867 CAGAAACCTAATGGAAGGAGTGGAGCAGAACCTGTCCGTCAAGAACAGAG
3400 . : . : . : . : . :
3167 ACAG GTTCACCCAAAATCTGTCTGTATTCAGAAGAGATGTG
||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
517917 ACAGGTG...CAGGTTCACCCAAAATCTGTCTGTATTCAGAAGAGATGTG
3450 . : . : . : . : . :
3208 GCAGAGGCGTTGCGCAGTGATGGCAACACTGAACCATGCAGTCTCGACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
520705 GCAGAGGCGTTGCGCAGTGATGGCAACACTGAACCATGCAGTCTCGACAT
3500 .
3258 GATGAGC
|||||||
520755 GATGAGC