seq1 = pF1KB7342.tfa, 2682 bp
seq2 = pF1KB7342/gi568815580r_31030517.tfa (gi568815580r:31030517_31262594), 232078 bp

>pF1KB7342 2682
>gi568815580r:31030517_31262594 (Chr18)

(complement)

1-63  (100001-100063)   100% ->
64-148  (103066-103150)   100% ->
149-351  (105022-105224)   100% ->
352-471  (106433-106552)   100% ->
472-627  (107666-107821)   99% ->
628-772  (113953-114097)   100% ->
773-939  (116818-116984)   100% ->
940-1074  (118804-118938)   100% ->
1075-1260  (120411-120596)   98% ->
1261-1520  (122294-122553)   100% ->
1521-1663  (122705-122847)   100% ->
1664-1876  (127811-128023)   100% ->
1877-2116  (128465-128704)   100% ->
2117-2238  (129906-130027)   100% ->
2239-2487  (130753-131001)   100% ->
2488-2682  (131884-132078)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCTGGCCTCTGCTGCCCCAGGGAGCATCTTCTGTAAGCAGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCTGGCCTCTGCTGCCCCAGGGAGCATCTTCTGTAAGCAGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TTTCTCTCTCCTG         GTTTTAACATTACTTTGCGATGCTTGTC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TTTCTCTCTCCTGGTG...GAGGTTTTAACATTACTTTGCGATGCTTGTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGAAAGTTTATCTTCGAGTTCCTTCTCATCTTCAGGCTGAAACACTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103094 AGAAAGTTTATCTTCGAGTTCCTTCTCATCTTCAGGCTGAAACACTTGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGCAAAG         TGAATCTGGAGGAGTGTCTCAAGTCGGCCAGCCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103144 GGCAAAGGTG...CAGTGAATCTGGAGGAGTGTCTCAAGTCGGCCAGCCT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 AATCCGGTCCAGTGACCCTGCCTTCAGAATTCTAGAAGATGGCTCAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105056 AATCCGGTCCAGTGACCCTGCCTTCAGAATTCTAGAAGATGGCTCAATTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACACAACACATGACCTCATTTTGTCTTCTGAAAGGAAAAGTTTTTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105106 ACACAACACATGACCTCATTTTGTCTTCTGAAAGGAAAAGTTTTTCCATT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TTCCTTTCAGATGGTCAGAGACGGGAACAACAAGAGATAAAAGTTGTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105156 TTCCTTTCAGATGGTCAGAGACGGGAACAACAAGAGATAAAAGTTGTACT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTCAGCAAGAGAAAACAAG         TCTCCTAAGAAGAGACATACCA
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 105206 GTCAGCAAGAGAAAACAAGGTA...TAGTCTCCTAAGAAGAGACATACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AAGACACAGCCCTCAAGCGCAGCAAGAGACGATGGGCTCCTATTCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106455 AAGACACAGCCCTCAAGCGCAGCAAGAGACGATGGGCTCCTATTCCAGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TCATTGATGGAGAACTCGTTGGGTCCATTTCCACAACACGTTCAGCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 106505 TCATTGATGGAGAACTCGTTGGGTCCATTTCCACAACACGTTCAGCAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    472        ATCCAATCTGATGCTGCACAGAATTACACCATCTTTTATTCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106555 G...CAGATCCAATCTGATGCTGCACAGAATTACACCATCTTTTATTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TAAGTGGGCCAGGCGTGGACAAAGAACCCTTCAATTTGTTTTACATAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107709 TAAGTGGGCCAGGCGTGGACAAAGAACCCTTCAATTTGTTTTACATAGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 AAAGACACTGGGGATATCTTTTGTACAAGGAGCATTGACCGTGAGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107759 AAAGACACTGGGGATATCTTTTGTACAAGGAGCATTGACCGTGAGAAATA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGAACAGTTTGCG         TTATATGGCTATGCAACAACTGCAGATG
         ||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107809 TGAACAGTTTGCGGTA...CAGTTATATGGCTATGCAACAACTGCAGATG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 GCTATGCACCAGAATATCCACTCCCTTTGATCATCAAAATTGAAGATGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113981 GCTATGCACCAGAATATCCACTCCCTTTGATCATCAAAATTGAAGATGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AATGATAACGCCCCATATTTTGAACACAGAGTGACTATCTTTACTGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114031 AATGATAACGCCCCATATTTTGAACACAGAGTGACTATCTTTACTGTGCC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGAAAATTGCCGATCCG         GAACTTCAGTGGGAAAAGTGACCG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114081 TGAAAATTGCCGATCCGGTA...CAGGAACTTCAGTGGGAAAAGTGACCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 CCACAGACCTTGACGAACCTGACACTCTCCATACTCGTCTGAAATATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116842 CCACAGACCTTGACGAACCTGACACTCTCCATACTCGTCTGAAATATAAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 ATCTTACAACAAATCCCAGATCATCCAAAGCATTTCTCCATACACCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116892 ATCTTACAACAAATCCCAGATCATCCAAAGCATTTCTCCATACACCCAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 TACCGGTGTCATCACCACAACTACACCTTTTCTGGATAGAGAA       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 116942 TACCGGTGTCATCACCACAACTACACCTTTTCTGGATAGAGAAGTA...C

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    940   AAATGTGATACTTACCAGTTAATAATGGAAGTGCGAGACATGGGTGGT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118802 AGAAATGTGATACTTACCAGTTAATAATGGAAGTGCGAGACATGGGTGGT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 CAGCCTTTCGGTTTATTTAATACAGGAACAATTACTATTTCACTTGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118852 CAGCCTTTCGGTTTATTTAATACAGGAACAATTACTATTTCACTTGAGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 TGAAAATGACAATCCACCATCTTTCACAGAAACTTCT         TATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 118902 TGAAAATGACAATCCACCATCTTTCACAGAAACTTCTGTG...CAGTATG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TTACAGAAGTAGAAGAAAACAGAATTGACGTGGAGATTTTGCGAATGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
 120415 TTACAGAAGTAGAAGAAAACAGAATTGACGTGGAGATTTTACGAATGAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 GTACAGGATCAGGATTTGCCAAACACTCCTCACTCAAAGGCTGTATACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120465 GTACAGGATCAGGATTTGCCAAACACTCCTCACTCAAAGGCTGTATACAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1179 AATCTTACAAGGAAATGAAAATGGAAACTTCATAATTAGCACAGATCCAA
        |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120515 AATCCTACAAGGAAATGAAAATGGAAACTTCATAATTAGCACAGATCCAA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1229 ATACAAATGAAGGAGTGCTGTGTGTTGTCAAG         CCATTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 120565 ATACAAATGAAGGAGTGCTGTGTGTTGTCAAGGTA...CAGCCATTGAAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TATGAAGTCAATCGCCAAGTTATTTTGCAAGTTGGTGTCATTAACGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122303 TATGAAGTCAATCGCCAAGTTATTTTGCAAGTTGGTGTCATTAACGAGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 ACAATTCTCTAAAGCAGCGAGCTCACAAACTCCTACAATGTGCACTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122353 ACAATTCTCTAAAGCAGCGAGCTCACAAACTCCTACAATGTGCACTACAA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 CTGTCACCGTTAAAATTATAGACAGTGATGAGGGCCCTGAATGCCACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122403 CTGTCACCGTTAAAATTATAGACAGTGATGAGGGCCCTGAATGCCACCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 CCAGTGAAAGTTATTCAGAGTCAAGATGGCTTCCCAGCTGGCCAAGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122453 CCAGTGAAAGTTATTCAGAGTCAAGATGGCTTCCCAGCTGGCCAAGAACT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 CCTTGGATACAAAGCACTGGACCCGGAAATATCCAGTGGTGAAGGCTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122503 CCTTGGATACAAAGCACTGGACCCGGAAATATCCAGTGGTGAAGGCTTAA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 G         GTATCAGAAGTTAGGGGATGAAGATAACTGGTTTGAAATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122553 GGTG...TAGGTATCAGAAGTTAGGGGATGAAGATAACTGGTTTGAAATT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1561 AATCAACACACTGGCGACTTGAGAACTCTAAAAGTACTAGATAGAGAATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122745 AATCAACACACTGGCGACTTGAGAACTCTAAAAGTACTAGATAGAGAATC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1611 CAAATTTGTAAAAAACAACCAATACAATATTTCAGTTGTTGCAGTGGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122795 CAAATTTGTAAAAAACAACCAATACAATATTTCAGTTGTTGCAGTGGATG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 CAG         TTGGCCGATCTTGCACTGGAACATTAGTAGTTCATTTG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122845 CAGGTG...TAGTTGGCCGATCTTGCACTGGAACATTAGTAGTTCATTTG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1702 GATGATTACAACGATCACGCACCTCAAATTGACAAAGAAGTGACCATTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127849 GATGATTACAACGATCACGCACCTCAAATTGACAAAGAAGTGACCATTTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1752 TCAGAATAATGAGGATTTTGCTGTTCTGAAACCTGTAGATCCAGATGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127899 TCAGAATAATGAGGATTTTGCTGTTCTGAAACCTGTAGATCCAGATGGAC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1802 CTGAAAATGGACCACCTTTTCAATTCTTTCTGGATAATTCTGCCAGTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127949 CTGAAAATGGACCACCTTTTCAATTCTTTCTGGATAATTCTGCCAGTAAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1852 AACTGGAACATAGAAGAAAAGGATG         GTAAAACTGCCATTCT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 127999 AACTGGAACATAGAAGAAAAGGATGGTA...TAGGTAAAACTGCCATTCT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1893 TCGTCAACGGCAAAATCTTGATTATAACTATTATTCTGTGCCTATTCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128481 TCGTCAACGGCAAAATCTTGATTATAACTATTATTCTGTGCCTATTCAAA

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1943 TAAAAGACAGGCATGGTTTAGTTGCAACACATATGTTAACAGTGAGAGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128531 TAAAAGACAGGCATGGTTTAGTTGCAACACATATGTTAACAGTGAGAGTA

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1993 TGTGACTGTTCAACTCCATCTGAGTGTAGAATGAAGGATAAAAGTACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128581 TGTGACTGTTCAACTCCATCTGAGTGTAGAATGAAGGATAAAAGTACAAG

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2043 AGACGTTAGACCAAATGTAATACTTGGAAGATGGGCTATTCTTGCTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128631 AGACGTTAGACCAAATGTAATACTTGGAAGATGGGCTATTCTTGCTATGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2093 TGTTGGGTTCTGTATTGTTATTAT         GTATTCTGTTTACATGT
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 128681 TGTTGGGTTCTGTATTGTTATTATGTA...TAGGTATTCTGTTTACATGT

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2134 TTCTGTGTCACTGCTAAGAGAACAGTCAAGAAATGTTTTCCAGAAGACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129923 TTCTGTGTCACTGCTAAGAGAACAGTCAAGAAATGTTTTCCAGAAGACAT

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2184 AGCCCAGCAAAATTTAATTGTATCAAATACTGAAGGACCTGGAGAAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129973 AGCCCAGCAAAATTTAATTGTATCAAATACTGAAGGACCTGGAGAAGAAG

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2234 TAACG         GAAGCAAATATTAGACTCCCCATGCAGACATCCAAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130023 TAACGGTA...TAGGAAGCAAATATTAGACTCCCCATGCAGACATCCAAC

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2275 ATTTGTGACACAAGCATGTCTGTTGGTACTGTTGGTGGCCAGGGAATCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130789 ATTTGTGACACAAGCATGTCTGTTGGTACTGTTGGTGGCCAGGGAATCAA

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2325 AACACAGCAAAGTTTTGAGATGGTCAAAGGAGGCTACACTTTGGATTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130839 AACACAGCAAAGTTTTGAGATGGTCAAAGGAGGCTACACTTTGGATTCCA

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2375 ACAAAGGAGGTGGACATCAGACCTTGGAGTCCGTCAAGGGAGTGGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130889 ACAAAGGAGGTGGACATCAGACCTTGGAGTCCGTCAAGGGAGTGGGGCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2425 GGAGATACTGGCAGATATGCGTACACGGACTGGCAGAGTTTCACCCAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130939 GGAGATACTGGCAGATATGCGTACACGGACTGGCAGAGTTTCACCCAACC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2475 TCGGCTTGGCGAA         AAGGTGTATTTGTGTGGACAAGATGAGG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 130989 TCGGCTTGGCGAAGTA...CAGAAGGTGTATTTGTGTGGACAAGATGAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2516 AGCATAAACATTGTGAAGACTACGTTTGTTCGTATAACTATGAAGGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131912 AGCATAAACATTGTGAAGACTACGTTTGTTCGTATAACTATGAAGGCAAA

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2566 GGTTCTCTGGCCGGCTCAGTAGGTTGCTGCAGCGATCGGCAGGAAGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131962 GGTTCTCTGGCCGGCTCAGTAGGTTGCTGCAGCGATCGGCAGGAAGAAGA

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2616 GGGACTGGAGTTTCTAGATCACCTGGAACCCAAATTTAGGACATTAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 132012 GGGACTGGAGTTTCTAGATCACCTGGAACCCAAATTTAGGACATTAGCAA

   2800     .    :    .
   2666 AGACATGCATCAAGAAA
        |||||||||||||||||
 132062 AGACATGCATCAAGAAA