Result of SIM4 for
pF1KB7338
seq1 = pF1KB7338.tfa, 3189 bp
seq2 = pF1KB7338/gi568815588r_15417161.tfa (gi568815588r:15417161_15819771), 402611 bp
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>gi568815588r:15417161_15819771 (Chr10)
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2767-2880 (271204-271317) 100% ->
2881-2982 (288621-288722) 99% ->
2983-3105 (300360-300482) 100% ->
3106-3189 (302528-302611) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGTCGCCCGGGGCCAGCCGCGGTCCCCGGGGAAGCCAGGCGCCGCTGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGTCGCCCGGGGCCAGCCGCGGTCCCCGGGGAAGCCAGGCGCCGCTGAT
50 . : . : . : . : . :
51 CGCGCCCCTCTGCTGCGCCGCGGCCGCGCTGGGGATGTTGCTGTGGTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 CGCGCCCCTCTGCTGCGCCGCGGCCGCGCTGGGGATGTTGCTGTGGTCCC
100 . : . : . : . : . :
101 CCGCCTGTCAGGCGTTCAACCTGGACGTGGAAAAGCTCACAGTGTACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 CCGCCTGTCAGGCGTTCAACCTGGACGTGGAAAAGCTCACAGTGTACAGC
150 . : . : . : . : . :
151 GGCCCCAAGGGCAGCTACTTCGGCTACGCCGTGGACTTCCACATACCCGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 GGCCCCAAGGGCAGCTACTTCGGCTACGCCGTGGACTTCCACATACCCGA
200 . : . : . : . : . :
201 CGCCCGCAC AGCGAGTGTCTTGGTGGGGGCGCCCAAAGCCA
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100201 CGCCCGCACGTA...CAGAGCGAGTGTCTTGGTGGGGGCGCCCAAAGCCA
250 . : . : . : . : . :
242 ACACCAGCCAGCCCGATATCGTGGAAGGGGGAGCCGTCTATTACTGTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100905 ACACCAGCCAGCCCGATATCGTGGAAGGGGGAGCCGTCTATTACTGTCCT
300 . : . : . : . : . :
292 TGGCCCGCGGAGGGGTCTGCGCAGTGCAGGCAGATACCGTTTGACACCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100955 TGGCCCGCGGAGGGGTCTGCGCAGTGCAGGCAGATACCGTTTGACACCAC
350 . : . : . : . : . :
342 CA ACAACAGAAAGATCAGAGTTAATGGAACCAAAGAACCTA
||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
101005 CAGTA...CAGACAACAGAAAGATCAGAGTTAATGGAACCAAAGAACCTA
400 . : . : . : . : . :
383 TCGAGTTCAAATCCAATCAGTGGTTTGGAGCAACAGTGAAAGCTCACAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131773 TCGAGTTCAAATCCAATCAGTGGTTTGGAGCAACAGTGAAAGCTCACAAA
450 . : . : . : . : . :
433 GGAAAAGTTGTG GCCTGTGCTCCTTTATATCACTGGAGAAC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
131823 GGAAAAGTTGTGGTG...TAGGCCTGTGCTCCTTTATATCACTGGAGAAC
500 . : . : . : . : . :
474 TCTTAAACCGACACCAGAAAAGGACCCAGTTGGCACCTGCTATGTAGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135674 TCTTAAACCGACACCAGAAAAGGACCCAGTTGGCACCTGCTATGTAGCAA
550 . : . : . : . : . :
524 TTCAGAACTTCAGCGCCTATGCCGAGTTCTCTCCTTGCCGGAACA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
135724 TTCAGAACTTCAGCGCCTATGCCGAGTTCTCTCCTTGCCGGAACAGTA..
600 . : . : . : . : . :
569 GCAATGCTGATCCGGAAGGCCAGGGTTACTGCCAAGCAGGATTTAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
135774 .TAGGCAATGCTGATCCGGAAGGCCAGGGTTACTGCCAAGCAGGATTTAG
650 . : . : . : . : . :
615 TCTGGATTTTTATAAG AATGGAGACCTTATTGTGGGAGGAC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
141035 TCTGGATTTTTATAAGGTG...TAGAATGGAGACCTTATTGTGGGAGGAC
700 . : . : . : . : . :
656 CTGGGAGTTTCTACTGGCAAG GACAAGTGATCACTGCCAGT
|||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
142160 CTGGGAGTTTCTACTGGCAAGGTA...CAGGACAAGTGATCACTGCCAGT
750 . : . : . : . : . :
697 GTTGCAGATATCATTGCAAATTACTCATTCAAGGATATCCTCAGGAAACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147043 GTTGCAGATATCATTGCAAATTACTCATTCAAGGATATCCTCAGGAAACT
800 . : . : . : . : . :
747 GGCAGGAGAAAAGCAGACGGAAGTGGCTCCAGCTTCCTATGATGACAGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147093 GGCAGGAGAAAAGCAGACGGAAGTGGCTCCAGCTTCCTATGATGACAGTT
850 . : . : . : . : . :
797 ACCTTG GATACTCAGTTGCTGCTGGGGAGTTTACTGGGGAT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
147143 ACCTTGGTA...CAGGATACTCAGTTGCTGCTGGGGAGTTTACTGGGGAT
900 . : . : . : . : . :
838 TCTCAGCAAG AATTGGTTGCTGGAATTCCAAGAGGAGCACA
||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
148160 TCTCAGCAAGGTG...CAGAATTGGTTGCTGGAATTCCAAGAGGAGCACA
950 . : . : . : . : . :
879 GAATTTTGGATAT GTTTCCATCATTAACTCTACGGATATGA
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
158881 GAATTTTGGATATGTG...CAGGTTTCCATCATTAACTCTACGGATATGA
1000 . : . : . : . : . :
920 CGTTTATTCAGAATTTCACGGGAGAACAG ATGGCATCTTAT
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
160745 CGTTTATTCAGAATTTCACGGGAGAACAGGTA...CAGATGGCATCTTAT
1050 . : . : . : . : . :
961 TTTGGATATACCGTTGTCGTATCAGATGTTAACAGTGATGG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
164378 TTTGGATATACCGTTGTCGTATCAGATGTTAACAGTGATGGGTA...CAG
1100 . : . : . : . : . :
1002 ACTGGATGATGTCCTGGTTGGGGCACCTCTCTTTATGGAACGTGAATTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172721 ACTGGATGATGTCCTGGTTGGGGCACCTCTCTTTATGGAACGTGAATTTG
1150 . : . : . : . : . :
1052 AGAGCAACCCCAGAGAAGTAGGGCAAATCTACCTGTATTTGCAAGTGAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172771 AGAGCAACCCCAGAGAAGTAGGGCAAATCTACCTGTATTTGCAAGTGAGC
1200 . : . : . : . : . :
1102 TCTCTCCTCTTCAGAGACCCCCAGATCCTCACTGGCACCGAGACGTTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172821 TCTCTCCTCTTCAGAGACCCCCAGATCCTCACTGGCACCGAGACGTTTGG
1250 . : . : . : . : . :
1152 GAGATTCGGTAGTGCTATGGCACACTTAGGAGACCTGAACCAAGATGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
172871 GAGATTCGGTAGTGCTATGGCACACTTAGGAGACCTGAACCAAGATGGAT
1300 . : . : . : . : . :
1202 ACAATG ACATTGCCATCGGAGTGCCTTTTGCAGGCAAGGAT
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
172921 ACAATGGTA...TAGACATTGCCATCGGAGTGCCTTTTGCAGGCAAGGAT
1350 . : . : . : . : . :
1243 CAAAGAGGCAAAGTGCTCATTTATAATGGGAACAAAGATGGCTTAAACAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175586 CAAAGAGGCAAAGTGCTCATTTATAATGGGAACAAAGATGGCTTAAACAC
1400 . : . : . : . : . :
1293 CAAGCCTTCCCAAGTTCTGCAAGGAGTGTGGGCCTCACATGCTGTCCCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175636 CAAGCCTTCCCAAGTTCTGCAAGGAGTGTGGGCCTCACATGCTGTCCCTT
1450 . : . : . : . : . :
1343 CCGGATTTGGCTTTACTTTAAGAGGAGATTCAGACATAGACAAGAATGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
175686 CCGGATTTGGCTTTACTTTAAGAGGAGATTCAGACATAGACAAGAATGAT
1500 . : . : . : . : . :
1393 TACCCAG ATTTGATTGTGGGTGCATTTGGAACAGGAAAAGT
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
175736 TACCCAGGTA...AAGATTTGATTGTGGGTGCATTTGGAACAGGAAAAGT
1550 . : . : . : . : . :
1434 CGCTGTTTACAG AGCAAGACCGGTTGTGACTGTAGATGCCC
||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
203247 CGCTGTTTACAGGTA...CAGAGCAAGACCGGTTGTGACTGTAGATGCCC
1600 . : . : . : . : . :
1475 AGCTTCTGCTGCACCCAATGATTATCAATCTTGAAAATAAAACTTGCCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
206034 AGCTTCTGCTGCACCCAATGATTATCAATCTTGAAAATAAAACTTGCCAG
1650 . : . : . : . : . :
1525 GTTCCAGACTCTATGACATCTGCTGCCTG CTTTTCTTTAAG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
206084 GTTCCAGACTCTATGACATCTGCTGCCTGGTG...TAGCTTTTCTTTAAG
1700 . : . : . : . : . :
1566 AGTATGTGCATCTGTCACAGGCCAGAGCATTGCAAACACAATAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
211494 AGTATGTGCATCTGTCACAGGCCAGAGCATTGCAAACACAATAGGTA...
1750 . : . : . : . : . :
1610 TCTTGATGGCAGAGGTGCAATTAGATTCCCTGAAACAGAAAGGAGCT
>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211938 TAGTCTTGATGGCAGAGGTGCAATTAGATTCCCTGAAACAGAAAGGAGCT
1800 . : . : . : . : . :
1657 ATTAAACGGACGCTCTTCCTTGATAACCATCAGGCTCATCGCGTCTTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
211988 ATTAAACGGACGCTCTTCCTTGATAACCATCAGGCTCATCGCGTCTTCCC
1850 . : . : . : . : . :
1707 TCTTGTGATAAAAAGGCAGAAATCCCACCAGTGCCAGGATTTCATCGTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
212038 TCTTGTGATAAAAAGGCAGAAATCCCACCAGTGCCAGGATTTCATCGTTT
1900 . : . : . : . : . :
1757 ACCTTCGA GATGAAACTGAATTCCGAGATAAATTATCTCCA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
212088 ACCTTCGAGTA...TAGGATGAAACTGAATTCCGAGATAAATTATCTCCA
1950 . : . : . : . : . :
1798 ATCAACATTAGTTTGAATTACAGTTTGGACGAATCCACCTTTAAAGAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213383 ATCAACATTAGTTTGAATTACAGTTTGGACGAATCCACCTTTAAAGAAGG
2000 . : . : . : . : . :
1848 CCTGGAAGTGAAACCAATATTGAACTACTACAGAGAAAACATTGTTAGTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213433 CCTGGAAGTGAAACCAATATTGAACTACTACAGAGAAAACATTGTTAGTG
2050 . : . : . : . : . :
1898 AACAG GCTCACATTCTGGTGGACTGTGGAGAAGACAATCTG
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
213483 AACAGGTA...CAGGCTCACATTCTGGTGGACTGTGGAGAAGACAATCTG
2100 . : . : . : . : . :
1939 TGTGTTCCTGACTTGAAGCTGTCGGCTAGACC AGATAAGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
214017 TGTGTTCCTGACTTGAAGCTGTCGGCTAGACCGTA...TAGAGATAAGCA
2150 . : . : . : . : . :
1980 TCAGGTAATCATTGGAGATGAAAATCACCTTATGCTCATAATAAATGCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
215426 TCAGGTAATCATTGGAGATGAAAATCACCTTATGCTCATAATAAATGCAA
2200 . : . : . : . : . :
2030 GAAATGAAGGGGAAGGAGCATATGAAGCTGAACTCTTTGTAATGATCCCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
215476 GAAATGAAGGGGAAGGAGCATATGAAGCTGAACTCTTTGTAATGATACCA
2250 . : . : . : . : . :
2080 GAAGAGGCAGATTATGTTGGAATCGAACGCAACAACAAG GG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
215526 GAAGAGGCAGATTATGTTGGAATCGAACGCAACAACAAGGTA...TAGGG
2300 . : . : . : . : . :
2121 ATTTCGACCACTGAGCTGTGAGTACAAGATGGAAAATGTAACCAGGATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
222475 ATTTCGACCACTGAGCTGTGAGTACAAGATGGAAAATGTAACCAGGATGG
2350 . : . : . : . : . :
2171 TGGTGTGTGACCTTGGGAACCCTATGGTGTCTGGAACAAAT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
222525 TGGTGTGTGACCTTGGGAACCCTATGGTGTCTGGAACAAATGTA...TAG
2400 . : . : . : . : . :
2212 TATTCCCTGGGCCTCCGATTTGCAGTTCCACGTCTTGAGAAAACAAACAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
227468 TATTCCCTGGGCCTCCGATTTGCAGTTCCACGTCTTGAGAAAACAAACAT
2450 . : . : . : . : . :
2262 GAGCATTAACTTCGATCTCCAAATCAGAAG TTCCAACAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
227518 GAGCATTAACTTCGATCTCCAAATCAGAAGGTT...TAGTTCCAACAAGG
2500 . : . : . : . : . :
2303 ACAATCCAGACAGCAATTTTGTGAGCCTGCAAATCAACATCACTGCTGTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
233119 ACAATCCAGACAGCAATTTTGTGAGCCTGCAAATCAACATCACTGCTGTA
2550 . : . : . : . : . :
2353 GCGCAGGTGGAAATAAGAGG AGTGTCACACCCTCCGCAGAT
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
233169 GCGCAGGTGGAAATAAGAGGGTA...CAGAGTGTCACACCCTCCGCAGAT
2600 . : . : . : . : . :
2394 TGTTCTGCCCATTCATAACTGGGAACCAGAAGAGGAGCCCCACAAAGAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
244199 TGTTCTGCCCATTCATAACTGGGAACCAGAAGAGGAGCCCCACAAAGAGG
2650 . : . : . : . : . :
2444 AGGAGGTTGGACCATTGGTGGAACATATTTATGAG CTGCAC
|||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
244249 AGGAGGTTGGACCATTGGTGGAACATATTTATGAGGTA...CAGCTGCAC
2700 . : . : . : . : . :
2485 AATATTGGACCAAGTACCATCAGTGACACCATCCTGGAGGTGGGCTGGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247409 AATATTGGACCAAGTACCATCAGTGACACCATCCTGGAGGTGGGCTGGCC
2750 . : . : . : . : . :
2535 TTTCTCTGCCCGGGATGAATTTCTTCTCTATATTTTCCATATTCAAACTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247459 TTTCTCTGCCCGGGATGAATTTCTTCTCTATATTTTCCATATTCAAACTC
2800 . : . : . : . : . :
2585 TGGGACCTCTGCAGTGCCAACCAAATCCTAATATCAATCCACAGGATATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247509 TGGGACCTCTGCAGTGCCAACCAAATCCTAATATCAATCCACAGGATATA
2850 . : . : . : . : . :
2635 AAG CCTGCTGCCTCCCCAGAGGACACCCCTGAGCTCAGCGC
|||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
247559 AAGGTA...CAGCCTGCTGCCTCCCCAGAGGACACCCCTGAGCTCAGCGC
2900 . : . : . : . : . :
2676 CTTTTTGCGAAACTCTACTATTCCTCATCTTGTCAGGAAGAGGGATGTAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
261608 CTTTTTGCGAAACTCTACTATTCCTCATCTTGTCAGGAAGAGGGATGTAC
2950 . : . : . : . : . :
2726 ATGTGGTCGAATTCCACAGACAGAGCCCTGCAAAAATACTG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
261658 ATGTGGTCGAATTCCACAGACAGAGCCCTGCAAAAATACTGGTG...CAG
3000 . : . : . : . : . :
2767 AATTGTACAAATATCGAGTGTTTACAAATCTCCTGTGCAGTGGGACGACT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271204 AATTGTACAAATATCGAGTGTTTACAAATCTCCTGTGCAGTGGGACGACT
3050 . : . : . : . : . :
2817 CGAAGGAGGAGAAAGCGCAGTCCTGAAAGTCAGGTCACGATTATGGGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
271254 CGAAGGAGGAGAAAGCGCAGTCCTGAAAGTCAGGTCACGATTATGGGCCC
3100 . : . : . : . : . :
2867 ACACCTTCCTCCAG AGAAAAAATGATCCCTATGCTCTTGCA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
271304 ACACCTTCCTCCAGGTA...CAGAGAAAAAATGATCCCTATGCTCTTGCA
3150 . : . : . : . : . :
2908 TCCCTGGTGTCCTTTGAAGTTAAGAAGATGCCTTATACAGATCAGCCAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
288648 TCCCTGGTGTCCTTTGAAGTTAAGAAGATGCCTTATACAGATCAGCCAGC
3200 . : . : . : . : . :
2958 AAAACTCCCAGAAGGAAGCATAGCA ATTAAGACATCAGTTA
||||||||||||||||||||||| |>>>...>>>||||||||||||||||
288698 AAAACTCCCAGAAGGAAGCATAGTAGTG...CAGATTAAGACATCAGTTA
3250 . : . : . : . : . :
2999 TTTGGGCAACTCCGAATGTTTCCTTCTCAATCCCATTATGGGTAATAATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
300376 TTTGGGCAACTCCGAATGTTTCCTTCTCAATCCCATTATGGGTAATAATA
3300 . : . : . : . : . :
3049 CTAGCAATACTTCTTGGATTGTTGGTTCTCGCCATTTTAACCTTAGCTTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
300426 CTAGCAATACTTCTTGGATTGTTGGTTCTCGCCATTTTAACCTTAGCTTT
3350 . : . : . : . : . :
3099 ATGGAAG TGTGGATTCTTTGACAGAGCCAGACCTCCTCAGG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
300476 ATGGAAGGTA...TAGTGTGGATTCTTTGACAGAGCCAGACCTCCTCAGG
3400 . : . : . : . : . :
3140 AGGACATGACCGACAGGGAACAGCTGACAAATGACAAGACCCCTGAGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
302562 AGGACATGACCGACAGGGAACAGCTGACAAATGACAAGACCCCTGAGGCA