Result of SIM4 for
pF1KB7337
seq1 = pF1KB7337.tfa, 3129 bp
seq2 = pF1KB7337/gi568815579r_55795948.tfa (gi568815579r:55795948_56032311), 236364 bp
>pF1KB7337 3129
>gi568815579r:55795948_56032311 (Chr19)
(complement)
1-319 (100001-100319) 100% ->
320-388 (107277-107345) 100% ->
389-457 (107654-107722) 100% ->
458-523 (108333-108398) 100% ->
524-2111 (119019-120606) 100% ->
2112-2282 (121579-121749) 100% ->
2283-2447 (124356-124520) 100% ->
2448-2618 (127200-127370) 100% ->
2619-2789 (130107-130277) 100% ->
2790-2957 (133375-133542) 100% ->
2958-3129 (136193-136364) 100%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAACTTTTCTGTAATCACCTGCCCCAACGGTGGTACCAACCAAGGGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAACTTTTCTGTAATCACCTGCCCCAACGGTGGTACCAACCAAGGGCT
50 . : . : . : . : . :
51 TCTGCCTTACCTGATGGCCCTGGATCAGTATCAGCTGGAGGAATTCAAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100051 TCTGCCTTACCTGATGGCCCTGGATCAGTATCAGCTGGAGGAATTCAAGC
100 . : . : . : . : . :
101 TTTGCTTGGAACCCCAGCAGCTGATGGACTTCTGGTCGGCCCCCCAGGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100101 TTTGCTTGGAACCCCAGCAGCTGATGGACTTCTGGTCGGCCCCCCAGGGG
150 . : . : . : . : . :
151 CACTTCCCGCGTATCCCCTGGGCAAACTTGAGAGCTGCCGACCCTTTGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100151 CACTTCCCGCGTATCCCCTGGGCAAACTTGAGAGCTGCCGACCCTTTGAA
200 . : . : . : . : . :
201 TCTGTCCTTTCTTTTGGATGAACACTTCCCAAAAGGTCAGGCATGGAAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100201 TCTGTCCTTTCTTTTGGATGAACACTTCCCAAAAGGTCAGGCATGGAAAG
250 . : . : . : . : . :
251 TGGTCCTCGGCATCTTCCAGACAATGAATCTGACCTCACTGTGTGAGAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100251 TGGTCCTCGGCATCTTCCAGACAATGAATCTGACCTCACTGTGTGAGAAA
300 . : . : . : . : . :
301 GTTAGAGCCGAGATGAAAG AGAATGTGCAGACCCAAGAGCT
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
100301 GTTAGAGCCGAGATGAAAGGTG...CAGAGAATGTGCAGACCCAAGAGCT
350 . : . : . : . : . :
342 GCAAGATCCAACCCAGGAAGATCTAGAGATGCTAGAAGCAGCAGCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
107299 GCAAGATCCAACCCAGGAAGATCTAGAGATGCTAGAAGCAGCAGCAGGTG
400 . : . : . : . : . :
389 GGAATATGCAGACCCAGGGATGCCAAGATCCAAACCAAGAAGAA
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
107349 ...CAGGGAATATGCAGACCCAGGGATGCCAAGATCCAAACCAAGAAGAA
450 . : . : . : . : . :
433 CTAGACGAGCTAGAAGAAGAAACAG GGAATGTACAGGCCCA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
107698 CTAGACGAGCTAGAAGAAGAAACAGGTG...CAGGGAATGTACAGGCCCA
500 . : . : . : . : . :
474 GGGATGCCAAGATCCAAACCAAGAAGAACCAGAGATGCTAGAGGAAGCAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108349 GGGATGCCAAGATCCAAACCAAGAAGAACCAGAGATGCTAGAGGAAGCAG
550 . : . : . : . : . :
524 ACCACAGAAGAAAATACAGAGAGAACATGAAGGCTGAACTA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108399 GTG...TAGACCACAGAAGAAAATACAGAGAGAACATGAAGGCTGAACTA
600 . : . : . : . : . :
565 CTGGAGACATGGGACAACATCAGTTGGCCTAAAGACCACGTATATATCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119060 CTGGAGACATGGGACAACATCAGTTGGCCTAAAGACCACGTATATATCCG
650 . : . : . : . : . :
615 TAATACATCAAAGGACGAACATGAGGAACTGCAGCGCCTACTGGATCCTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119110 TAATACATCAAAGGACGAACATGAGGAACTGCAGCGCCTACTGGATCCTA
700 . : . : . : . : . :
665 ATAGGACTAGAGCCCAGGCCCAGACGATAGTCTTGGTGGGGAGGGCAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119160 ATAGGACTAGAGCCCAGGCCCAGACGATAGTCTTGGTGGGGAGGGCAGGG
750 . : . : . : . : . :
715 GTTGGGAAGACCACCTTGGCAATGCAGGCTATGCTGCACTGGGCAAATGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119210 GTTGGGAAGACCACCTTGGCAATGCAGGCTATGCTGCACTGGGCAAATGG
800 . : . : . : . : . :
765 AGTTCTCTTTCAGCAAAGGTTCTCCTATGTTTTCTATCTCAGCTGCCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119260 AGTTCTCTTTCAGCAAAGGTTCTCCTATGTTTTCTATCTCAGCTGCCATA
850 . : . : . : . : . :
815 AAATAAGGTACATGAAGGAAACTACCTTTGCTGAATTGATTTCTTTGGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119310 AAATAAGGTACATGAAGGAAACTACCTTTGCTGAATTGATTTCTTTGGAT
900 . : . : . : . : . :
865 TGGCCCGATTTTGATGCCCCCATTGAAGAGTTCATGTCTCAACCAGAGAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119360 TGGCCCGATTTTGATGCCCCCATTGAAGAGTTCATGTCTCAACCAGAGAA
950 . : . : . : . : . :
915 GCTCCTGTTTATTATTGATGGCTTTGAGGAAATAATCATATCTGAGTCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119410 GCTCCTGTTTATTATTGATGGCTTTGAGGAAATAATCATATCTGAGTCAC
1000 . : . : . : . : . :
965 GCTCTGAGAGCTTGGATGATGGCTCGCCATGTACAGACTGGTACCAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119460 GCTCTGAGAGCTTGGATGATGGCTCGCCATGTACAGACTGGTACCAGGAG
1050 . : . : . : . : . :
1015 CTCCCAGTGACCAAAATCCTACACAGCTTGTTGAAGAAAGAATTGGTTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119510 CTCCCAGTGACCAAAATCCTACACAGCTTGTTGAAGAAAGAATTGGTTCC
1100 . : . : . : . : . :
1065 CCTGGCTACCTTACTGATCACGATCAAGACCTGGTTTGTGAGAGATCTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119560 CCTGGCTACCTTACTGATCACGATCAAGACCTGGTTTGTGAGAGATCTTA
1150 . : . : . : . : . :
1115 AGGCCTCATTAGTGAATCCATGCTTTGTACAAATTACAGGGTTCACAGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119610 AGGCCTCATTAGTGAATCCATGCTTTGTACAAATTACAGGGTTCACAGGG
1200 . : . : . : . : . :
1165 GACGACCTACGGGTATATTTCATGAGACACTTTGATGACTCAAGTGAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119660 GACGACCTACGGGTATATTTCATGAGACACTTTGATGACTCAAGTGAAGT
1250 . : . : . : . : . :
1215 TGAGAAAATCCTGCAGCAGCTAAGAAAAAACGAAACTCTCTTTCATTCCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119710 TGAGAAAATCCTGCAGCAGCTAAGAAAAAACGAAACTCTCTTTCATTCCT
1300 . : . : . : . : . :
1265 GCAGTGCCCCCATGGTGTGTTGGACCGTATGTTCCTGTCTGAAGCAGCCG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119760 GCAGTGCCCCCATGGTGTGTTGGACCGTATGTTCCTGTCTGAAGCAGCCG
1350 . : . : . : . : . :
1315 AAGGTGAGGTATTACGATCTCCAGTCAATCACTCAGACTACCACCAGTCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119810 AAGGTGAGGTATTACGATCTCCAGTCAATCACTCAGACTACCACCAGTCT
1400 . : . : . : . : . :
1365 GTATGCCTATTTTTTCTCCAACTTGTTCTCCACAGCAGAGGTAGATTTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119860 GTATGCCTATTTTTTCTCCAACTTGTTCTCCACAGCAGAGGTAGATTTGG
1450 . : . : . : . : . :
1415 CAGATGACAGCTGGCCAGGACAATGGAGGGCCCTCTGCAGTCTGGCCATA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119910 CAGATGACAGCTGGCCAGGACAATGGAGGGCCCTCTGCAGTCTGGCCATA
1500 . : . : . : . : . :
1465 GAAGGGCTGTGGTCTATGAACTTCACGTTTAACAAAGAAGACACTGAGAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
119960 GAAGGGCTGTGGTCTATGAACTTCACGTTTAACAAAGAAGACACTGAGAT
1550 . : . : . : . : . :
1515 CGAGGGCCTGGAAGTGCCTTTCATTGATTCTCTCTACGAGTTCAATATTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120010 CGAGGGCCTGGAAGTGCCTTTCATTGATTCTCTCTACGAGTTCAATATTC
1600 . : . : . : . : . :
1565 TTCAAAAGATCAATGACTGTGGGGGTTGCACTACTTTCACCCACCTAAGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120060 TTCAAAAGATCAATGACTGTGGGGGTTGCACTACTTTCACCCACCTAAGT
1650 . : . : . : . : . :
1615 TTCCAGGAGTTTTTTGCAGCCATGTCCTTTGTGCTAGAGGAACCTAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120110 TTCCAGGAGTTTTTTGCAGCCATGTCCTTTGTGCTAGAGGAACCTAGAGA
1700 . : . : . : . : . :
1665 ATTCCCTCCCCATTCCACAAAGCCACAAGAGATGAAGATGTTACTGCAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120160 ATTCCCTCCCCATTCCACAAAGCCACAAGAGATGAAGATGTTACTGCAAC
1750 . : . : . : . : . :
1715 ACGTCTTGCTTGACAAAGAAGCCTACTGGACTCCAGTGGTTCTGTTCTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120210 ACGTCTTGCTTGACAAAGAAGCCTACTGGACTCCAGTGGTTCTGTTCTTC
1800 . : . : . : . : . :
1765 TTTGGTCTTTTAAATAAAAACATAGCAAGAGAACTGGAAGATACTTTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120260 TTTGGTCTTTTAAATAAAAACATAGCAAGAGAACTGGAAGATACTTTGCA
1850 . : . : . : . : . :
1815 TTGTAAAATATCTCCCAGGGTAATGGAGGAATTATTAAAGTGGGGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120310 TTGTAAAATATCTCCCAGGGTAATGGAGGAATTATTAAAGTGGGGAGAAG
1900 . : . : . : . : . :
1865 AGTTAGGTAAGGCTGAAAGTGCCTCTCTCCAATTTCACATTCTACGACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120360 AGTTAGGTAAGGCTGAAAGTGCCTCTCTCCAATTTCACATTCTACGACTT
1950 . : . : . : . : . :
1915 TTTCACTGCCTACACGAGTCCCAGGAGGAAGACTTCACAAAGAAGATGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120410 TTTCACTGCCTACACGAGTCCCAGGAGGAAGACTTCACAAAGAAGATGTT
2000 . : . : . : . : . :
1965 GGGTCGTATCTTTGAAGTTGACCTTAATATTTTGGAGGACGAAGAACTCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120460 GGGTCGTATCTTTGAAGTTGACCTTAATATTTTGGAGGACGAAGAACTCC
2050 . : . : . : . : . :
2015 AAGCTTCTTCATTTTGCCTAAAGCACTGTAAAAGGTTAAATAAGCTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120510 AAGCTTCTTCATTTTGCCTAAAGCACTGTAAAAGGTTAAATAAGCTAAGG
2100 . : . : . : . : . :
2065 CTTTCTGTTAGCAGTCACATCCTTGAAAGGGACTTGGAAATTCTGGA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
120560 CTTTCTGTTAGCAGTCACATCCTTGAAAGGGACTTGGAAATTCTGGAGTG
2150 . : . : . : . : . :
2112 GACAAGCAAGTTTGATTCCAGGATGCACGCATGGAACAGCATTT
...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
120610 ...AAGGACAAGCAAGTTTGATTCCAGGATGCACGCATGGAACAGCATTT
2200 . : . : . : . : . :
2156 GCTCTACGTTGGTCACAAATGAGAATCTGCATGAGCTAGACCTGAGTAAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121623 GCTCTACGTTGGTCACAAATGAGAATCTGCATGAGCTAGACCTGAGTAAC
2250 . : . : . : . : . :
2206 AGCAAACTTCATGCTTCCTCTGTGAAGGGTCTCTGTCTTGCACTGAAAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
121673 AGCAAACTTCATGCTTCCTCTGTGAAGGGTCTCTGTCTTGCACTGAAAAA
2300 . : . : . : . : . :
2256 TCCAAGATGCAAAGTCCAGAAACTGAC GTGCAAATCGGTAA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
121723 TCCAAGATGCAAAGTCCAGAAACTGACGTA...CAGGTGCAAATCGGTAA
2350 . : . : . : . : . :
2297 CTCCTGAGTGGGTTCTGCAGGACCTCATTATTGCCCTTCAGGGTAACAGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124370 CTCCTGAGTGGGTTCTGCAGGACCTCATTATTGCCCTTCAGGGTAACAGC
2400 . : . : . : . : . :
2347 AAGCTGACCCATCTGAACTTCAGCTCTAACAAGCTGGGAATGACTGTCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124420 AAGCTGACCCATCTGAACTTCAGCTCTAACAAGCTGGGAATGACTGTCCC
2450 . : . : . : . : . :
2397 CCTGATTCTTAAAGCTTTGAGACACTCAGCTTGCAACCTCAAGTATCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124470 CCTGATTCTTAAAGCTTTGAGACACTCAGCTTGCAACCTCAAGTATCTGT
2500 . : . : . : . : . :
2447 G CCTGGAGAAATGCAACTTGTCGGCAGCCAGCTGTCAGGAC
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
124520 GGTA...CAGCCTGGAGAAATGCAACTTGTCGGCAGCCAGCTGTCAGGAC
2550 . : . : . : . : . :
2488 CTAGCCTTGTTTCTCACCAGCATCCAACACGTAACTCGATTGTGCCTGGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127240 CTAGCCTTGTTTCTCACCAGCATCCAACACGTAACTCGATTGTGCCTGGG
2600 . : . : . : . : . :
2538 ATTTAATCGGCTCCAAGATGATGGCATAAAGCTATTGTGTGCGGCCCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
127290 ATTTAATCGGCTCCAAGATGATGGCATAAAGCTATTGTGTGCGGCCCTGA
2650 . : . : . : . : . :
2588 CTCACCCCAAGTGTGCCTTAGAGAGACTGGA GCTCTGGTTT
|||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
127340 CTCACCCCAAGTGTGCCTTAGAGAGACTGGAGTA...CAGGCTCTGGTTT
2700 . : . : . : . : . :
2629 TGCCAGCTGGCAGCACCCGCTTGCAAGCACTTGTCAGATGCTCTCCTGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130117 TGCCAGCTGGCAGCACCCGCTTGCAAGCACTTGTCAGATGCTCTCCTGCA
2750 . : . : . : . : . :
2679 GAACAGGAGCCTGACACACCTGAATCTGAGCAAGAACAGCCTGAGAGACG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130167 GAACAGGAGCCTGACACACCTGAATCTGAGCAAGAACAGCCTGAGAGACG
2800 . : . : . : . : . :
2729 AGGGAGTCAAGTTCCTGTGTGAGGCCTTGGGTCGCCCAGATGGTAACCTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130217 AGGGAGTCAAGTTCCTGTGTGAGGCCTTGGGTCGCCCAGATGGTAACCTG
2850 . : . : . : . : . :
2779 CAGAGCCTGAA TTTGTCAGGTTGTTCTTTCACAAGAGAGGG
|||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
130267 CAGAGCCTGAAGTA...CAGTTTGTCAGGTTGTTCTTTCACAAGAGAGGG
2900 . : . : . : . : . :
2820 CTGTGGAGAGCTGGCTAATGCCCTCAGCCATAATCATAATGTGAAAATCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133405 CTGTGGAGAGCTGGCTAATGCCCTCAGCCATAATCATAATGTGAAAATCT
2950 . : . : . : . : . :
2870 TGGATTTGGGAGAAAATGATCTTCAGGATGATGGAGTGAAGCTACTGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133455 TGGATTTGGGAGAAAATGATCTTCAGGATGATGGAGTGAAGCTACTGTGT
3000 . : . : . : . : . :
2920 GAGGCTCTGAAACCACATCGTGCATTGCACACACTTGG GTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
133505 GAGGCTCTGAAACCACATCGTGCATTGCACACACTTGGGTG...TAGGTT
3050 . : . : . : . : . :
2961 GGCGAAATGCAATCTGACAACTGCTTGCTGCCAGCATCTCTTCTCTGTTC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136196 GGCGAAATGCAATCTGACAACTGCTTGCTGCCAGCATCTCTTCTCTGTTC
3100 . : . : . : . : . :
3011 TCAGCAGCAGTAAGAGCCTGGTCAATCTGAACCTTCTAGGCAATGAATTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136246 TCAGCAGCAGTAAGAGCCTGGTCAATCTGAACCTTCTAGGCAATGAATTG
3150 . : . : . : . : . :
3061 GATACTGATGGTGTCAAGATGCTATGTAAGGCTTTGAAAAAGTCGACATG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136296 GATACTGATGGTGTCAAGATGCTATGTAAGGCTTTGAAAAAGTCGACATG
3200 . : .
3111 CAGGCTGCAGAAACTCGGG
|||||||||||||||||||
136346 CAGGCTGCAGAAACTCGGG