seq1 = pF1KB7331.tfa, 2982 bp
seq2 = pF1KB7331/gi568815581r_28856159.tfa (gi568815581r:28856159_29105869), 249711 bp

>pF1KB7331 2982
>gi568815581r:28856159_29105869 (Chr17)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-724  (123831-124499)   100% ->
725-858  (126057-126190)   100% ->
859-1054  (135918-136113)   100% ->
1055-1254  (141723-141922)   100% ->
1255-1409  (144912-145065)   99% ->
1410-1576  (145199-145365)   100% ->
1577-1771  (145978-146172)   100% ->
1772-1910  (146398-146536)   100% ->
1911-2107  (146649-146845)   100% ->
2108-2302  (147729-147923)   100% ->
2303-2494  (148331-148522)   100% ->
2495-2692  (148628-148825)   100% ->
2693-2731  (149113-149151)   100% ->
2732-2849  (149403-149520)   100% ->
2850-2952  (149609-149711)   100% ->
2953-2982  (149876-149905)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCGCCCGGTAGCCCTGCTGCTCCTGCCCTCGCTGCTGGCGCTCCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCGCCCGGTAGCCCTGCTGCTCCTGCCCTCGCTGCTGGCGCTCCTGGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCACG         GACTCTCTTTAGAGGCCCCAACCGTGGGGAAAGGAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCACGGTA...CAGGACTCTCTTTAGAGGCCCCAACCGTGGGGAAAGGAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AAGCCCCAGGCATCGAGGAGACAGATGGCGAGCTGACAGCAGCCCCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123867 AAGCCCCAGGCATCGAGGAGACAGATGGCGAGCTGACAGCAGCCCCCACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTGAGCAGCCAGAACGAGGCGTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123917 CCTGAGCAGCCAGAACGAGGCGTCCACTTTGTCACAACAGCCCCCACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GAAGCTGCTCAACCACCACCCGCTGCTTGAGGAATTCCTACAAGAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123967 GAAGCTGCTCAACCACCACCCGCTGCTTGAGGAATTCCTACAAGAGGGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGGAAAAGGGAGATGAGGAGCTGAGGCCAGCACTGCCCTTCCAGCCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124017 TGGAAAAGGGAGATGAGGAGCTGAGGCCAGCACTGCCCTTCCAGCCTGAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCACCTGCACCCTTCACCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124067 CCACCTGCACCCTTCACCCCAAGTCCCCTTCCCCGCCTGGCCAACCAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGCTGCGGTACCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124117 CAGCCGCCCTGTCTTTACCAGCCCCACTCCAGCCATGGCTGCGGTACCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CTCAGCCCCAGTCCAAGGAGGGACCCTGGAGTCCGGAGTCAGAGTCCCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124167 CTCAGCCCCAGTCCAAGGAGGGACCCTGGAGTCCGGAGTCAGAGTCCCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 ATGCTTCGAATCACAGCTCCCCTACCTCCAGGGCCCAGCATGGCAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124217 ATGCTTCGAATCACAGCTCCCCTACCTCCAGGGCCCAGCATGGCAGTGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CACCCTAGGCCCAGGGGAGATAGCCAGCACTACACCCCCCAGCAGAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124267 CACCCTAGGCCCAGGGGAGATAGCCAGCACTACACCCCCCAGCAGAGCCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 GGACACCAACCCAAGAGGGTCCTGGAGACATGGGAAGGCCGTGGGTTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124317 GGACACCAACCCAAGAGGGTCCTGGAGACATGGGAAGGCCGTGGGTTGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GAGGTTGTGTCCCAGGGCGCAGGGATCGGGATCCAGGGGACCATCACCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124367 GAGGTTGTGTCCCAGGGCGCAGGGATCGGGATCCAGGGGACCATCACCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CTCCACAGCTTCAGGAGATGATGAGGAGACCACCACTACCACCACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124417 CTCCACAGCTTCAGGAGATGATGAGGAGACCACCACTACCACCACCATCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TCACCACCACCATCACCACAGTCCAGACACCAG         GCCCTTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 124467 TCACCACCACCATCACCACAGTCCAGACACCAGGTC...CAGGCCCTTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 AGCTGGAATTTCTCAGGCCCAGAGGGCTCTCTGGACTCCCCTACAGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126065 AGCTGGAATTTCTCAGGCCCAGAGGGCTCTCTGGACTCCCCTACAGACCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CAGCTCCCCCACTGATGTTGGCCTGGACTGCTTCTTCTACATCTCTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126115 CAGCTCCCCCACTGATGTTGGCCTGGACTGCTTCTTCTACATCTCTGTCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 ACCCTGGCTATGGCGTGGAAATCAAG         GTCCAGAATATCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 126165 ACCCTGGCTATGGCGTGGAAATCAAGGTG...CAGGTCCAGAATATCAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTCCGGGAAGGGGAGACAGTGACTGTGGAAGGCCTGGGGGGGCCTGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135933 CTCCGGGAAGGGGAGACAGTGACTGTGGAAGGCCTGGGGGGGCCTGACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 ACTGCCCCTGGCCAACCAGTCTTTCCTGCTGCGGGGCCAAGTCATCCGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 135983 ACTGCCCCTGGCCAACCAGTCTTTCCTGCTGCGGGGCCAAGTCATCCGCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 GCCCCACCCACCAAGCGGCCCTGAGGTTCCAGAGCCTCCCGCCACCGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136033 GCCCCACCCACCAAGCGGCCCTGAGGTTCCAGAGCCTCCCGCCACCGGCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGCCCTGGCACCTTCCATTTCCATTACCAAG         CCTATCTCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 136083 GGCCCTGGCACCTTCCATTTCCATTACCAAGGTA...CAGCCTATCTCCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1065 GAGCTGCCACTTTCCCCGTCGTCCAGCTTATGGAGATGTGACTGTCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141733 GAGCTGCCACTTTCCCCGTCGTCCAGCTTATGGAGATGTGACTGTCACCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 GCCTCCACCCAGGGGGTAGTGCCCGCTTCCATTGTGCCACTGGCTACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141783 GCCTCCACCCAGGGGGTAGTGCCCGCTTCCATTGTGCCACTGGCTACCAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 CTGAAGGGCGCCAGGCATCTCACCTGTCTCAATGCCACCCAGCCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141833 CTGAAGGGCGCCAGGCATCTCACCTGTCTCAATGCCACCCAGCCCTTCTG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGATTCAAAGGAGCCCGTCTGCATCGGTGAGTGCCCAGGG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>-
 141883 GGATTCAAAGGAGCCCGTCTGCATCGGTGAGTGCCCAGGGGAA...GAG 

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 TGATCCGCAATGCCACCACCGGCCGCATCGTCTCTCCAGGCTTCCCGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144912 TGATCCGCAATGCCACCACCGGCCGCATCGTCTCTCCAGGCTTCCCGGGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 AACTACAGCAACAACCTCACCTGTCACTGGCTGCTTGAGGCTCCTGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144962 AACTACAGCAACAACCTCACCTGTCACTGGCTGCTTGAGGCTCCTGAGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CCAGCGGCTACACCTGCACTTTGAGAAGGTTTCCCTGGCAGAGGATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145012 CCAGCGGCTACACCTGCACTTTGAGAAGGTTTCCCTGGCAGAGGATGATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 ACAG         GCTCATCATTCGCAATGGGGACAACGTGGAGGCCCCA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145062 ACAGGTG...CAGGCTCATCATTCGCAATGGGGACAACGTGGAGGCCCCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1447 CCAGTGTATGATTCCTATGAGGTGGAATACCTGCCCATTGAGGGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145236 CCAGTGTATGATTCCTATGAGGTGGAATACCTGCCCATTGAGGGCCTGCT

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1497 CAGCTCTGGCAAACACTTCTTTGTTGAGCTCAGTACTGACAGCAGCGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145286 CAGCTCTGGCAAACACTTCTTTGTTGAGCTCAGTACTGACAGCAGCGGGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1547 CAGCTGCAGGCATGGCCCTGCGCTATGAGG         CCTTCCAGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 145336 CAGCTGCAGGCATGGCCCTGCGCTATGAGGGTG...CAGCCTTCCAGCAG

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1588 GGCCATTGCTATGAGCCCTTTGTCAAATACGGTAACTTCAGCAGCAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145989 GGCCATTGCTATGAGCCCTTTGTCAAATACGGTAACTTCAGCAGCAGCAC

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1638 ACCCACCTACCCTGTGGGTACCACTGTGGAGTTCAGCTGCGACCCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146039 ACCCACCTACCCTGTGGGTACCACTGTGGAGTTCAGCTGCGACCCTGGCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1688 ACACCCTGGAGCAGGGCTCCATCATCATCGAGTGTGTTGACCCCCACGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146089 ACACCCTGGAGCAGGGCTCCATCATCATCGAGTGTGTTGACCCCCACGAC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1738 CCCCAGTGGAATGAGACAGAGCCAGCCTGCCGAG         CCGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 146139 CCCCAGTGGAATGAGACAGAGCCAGCCTGCCGAGGTC...CAGCCGTGTG

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1779 CAGCGGGGAGATCACAGACTCGGCTGGCGTGGTACTCTCTCCCAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146405 CAGCGGGGAGATCACAGACTCGGCTGGCGTGGTACTCTCTCCCAACTGGC

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1829 CAGAGCCCTACGGTCGTGGGCAGGATTGTATCTGGGGTGTGCATGTGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146455 CAGAGCCCTACGGTCGTGGGCAGGATTGTATCTGGGGTGTGCATGTGGAA

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1879 GAGGACAAGCGCATCATGCTGGACATCCGAGT         GCTGCGCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 146505 GAGGACAAGCGCATCATGCTGGACATCCGAGTGTG...CAGGCTGCGCAT

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1920 AGGCCCTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146658 AGGCCCTGGTGATGTGCTTACCTTCTATGATGGGGATGACCTGACGGCCC

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1970 GGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146708 GGGTTCTGGGCCAGTACTCAGGGCCCCGTAGCCACTTCAAGCTCTTTACC

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2020 TCCATGGCTGATGTCACCATTCAGTTCCAGTCGGACCCCGGGACCTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 146758 TCCATGGCTGATGTCACCATTCAGTTCCAGTCGGACCCCGGGACCTCAGT

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2070 GCTGGGCTACCAGCAGGGCTTCGTCATCCACTTCTTTG         AGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 146808 GCTGGGCTACCAGCAGGGCTTCGTCATCCACTTCTTTGGTG...CAGAGG

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2111 TGCCCCGCAATGACACATGTCCGGAGCTGCCTGAGATCCCCAATGGCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147732 TGCCCCGCAATGACACATGTCCGGAGCTGCCTGAGATCCCCAATGGCTGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2161 AAGAGCCCATCGCAGCCTGAGCTAGTGCACGGCACCGTGGTCACTTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147782 AAGAGCCCATCGCAGCCTGAGCTAGTGCACGGCACCGTGGTCACTTACCA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2211 GTGCTACCCTGGCTACCAGGTAGTGGGATCCAGTGTCCTCATGTGCCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147832 GTGCTACCCTGGCTACCAGGTAGTGGGATCCAGTGTCCTCATGTGCCAGT

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2261 GGGACCTAACTTGGAGTGAGGACCTGCCCTCATGCCAGAGGG        
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>
 147882 GGGACCTAACTTGGAGTGAGGACCTGCCCTCATGCCAGAGGGGTG...TA

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2303  TGACTTCCTGCCACGATCCTGGAGATGTGGAGCACAGCCGACGCCTCAT
        >|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148330 GTGACTTCCTGCCACGATCCTGGAGATGTGGAGCACAGCCGACGCCTCAT

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2352 ATCCAGCCCCAAGTTTCCCGTGGGGGCCACCGTGCAATATATCTGTGACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148380 ATCCAGCCCCAAGTTTCCCGTGGGGGCCACCGTGCAATATATCTGTGACC

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2402 AGGGTTTTGTGCTGATGGGCAGCTCCATCCTCACCTGCCATGATCGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148430 AGGGTTTTGTGCTGATGGGCAGCTCCATCCTCACCTGCCATGATCGCCAG

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2452 GCTGGCAGCCCCAAGTGGAGTGACCGGGCCCCTAAATGTCTCC       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 148480 GCTGGCAGCCCCAAGTGGAGTGACCGGGCCCCTAAATGTCTCCGTA...T

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2495   TGGAACAGCTCAAGCCATGCCATGGTCTCAGTGCCCCTGAGAATGGTG
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148626 AGTGGAACAGCTCAAGCCATGCCATGGTCTCAGTGCCCCTGAGAATGGTG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2543 CCCGAAGTCCTGAGAAGCAGCTACACCCAGCAGGGGCCACCATCCACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148676 CCCGAAGTCCTGAGAAGCAGCTACACCCAGCAGGGGCCACCATCCACTTC

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2593 TCGTGTGCCCCTGGCTATGTGCTGAAGGGCCAGGCCAGCATCAAGTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148726 TCGTGTGCCCCTGGCTATGTGCTGAAGGGCCAGGCCAGCATCAAGTGTGT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2643 GCCTGGGCACCCCTCGCATTGGAGTGACCCCCCACCCATCTGTAGGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148776 GCCTGGGCACCCCTCGCATTGGAGTGACCCCCCACCCATCTGTAGGGCTG

   2800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2693          CCTCTCTGGATGGGTTCTACAACAGTCGCAGCCTGGATG  
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 148826 GTG...CAGCCTCTCTGGATGGGTTCTACAACAGTCGCAGCCTGGATGGT

   2850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2732        TTGCCAAGGCACCTGCTGCCTCCAGCACCCTGGATGCTGCCCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149154 A...CAGTTGCCAAGGCACCTGCTGCCTCCAGCACCCTGGATGCTGCCCA

   2900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2775 CATTGCAGCTGCCATCTTCTTGCCACTGGTGGCGATGGTGTTGTTGGTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149446 CATTGCAGCTGCCATCTTCTTGCCACTGGTGGCGATGGTGTTGTTGGTAG

   2950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2825 GAGGTGTATACTTCTACTTCTCCAG         GCTCCAGGGAAAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 149496 GAGGTGTATACTTCTACTTCTCCAGGTG...CAGGCTCCAGGGAAAAAGC

   3000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2866 TCCCTGCAGCTGCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCTACAACCGCATTACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149625 TCCCTGCAGCTGCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCTACAACCGCATTACCAT

   3050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2916 AGAGTCAGCGTTTGACAATCCAACTTACGAGACTGGA         TCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 149675 AGAGTCAGCGTTTGACAATCCAACTTACGAGACTGGAGTA...CAGTCTC

   3100     .    :    .    :    .
   2957 TTTCCTTTGCAGGAGACGAGAGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||
 149880 TTTCCTTTGCAGGAGACGAGAGAATA