Result of SIM4 for
pF1KB7306
seq1 = pF1KB7306.tfa, 3192 bp
seq2 = pF1KB7306/gi568815593f_147964045.tfa (gi568815593f:147964045_148233888), 269844 bp
>pF1KB7306 3192
>gi568815593f:147964045_148233888 (Chr5)
1-55 (100001-100055) 100% ->
56-81 (101303-101328) 100% ->
82-209 (106279-106406) 100% ->
210-282 (108104-108176) 100% ->
283-410 (122361-122488) 100% ->
411-474 (124498-124561) 100% ->
475-602 (125450-125577) 100% ->
603-666 (127121-127184) 100% ->
667-794 (130310-130437) 100% ->
795-882 (131774-131861) 100% ->
883-1010 (133823-133950) 100% ->
1011-1092 (135190-135271) 100% ->
1093-1220 (136410-136537) 100% ->
1221-1302 (137311-137392) 100% ->
1303-1430 (137737-137864) 100% ->
1431-1479 (140908-140956) 100% ->
1480-1607 (142993-143120) 100% ->
1608-1692 (144709-144793) 100% ->
1693-1820 (147724-147851) 100% ->
1821-1887 (148824-148890) 100% ->
1888-2015 (150318-150445) 100% ->
2016-2112 (152326-152422) 100% ->
2113-2240 (154393-154520) 100% ->
2241-2313 (154942-155014) 100% ->
2314-2441 (155965-156092) 100% ->
2442-2538 (156251-156347) 100% ->
2539-2666 (159789-159916) 100% ->
2667-2739 (160721-160793) 100% ->
2740-2867 (161679-161806) 100% ->
2868-2964 (162939-163035) 100% ->
2965-3095 (167215-167345) 100% ->
3096-3192 (169753-169847) 96%
0 . : . : . : . : . :
1 ATGAAGATAGCCACAGTGTCAGTGCTTCTGCCCTTGGCTCTTTGCCTCAT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
100001 ATGAAGATAGCCACAGTGTCAGTGCTTCTGCCCTTGGCTCTTTGCCTCAT
50 . : . : . : . : . :
51 ACAAG ATGCTGCCAGTAAGAATGAAGATCAG G
|||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
100051 ACAAGGTG...CAGATGCTGCCAGTAAGAATGAAGATCAGGTT...TAGG
100 . : . : . : . : . :
83 AAATGTGCCATGAATTTCAGGCATTTATGAAAAATGGAAAACTGTTCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106280 AAATGTGCCATGAATTTCAGGCATTTATGAAAAATGGAAAACTGTTCTGT
150 . : . : . : . : . :
133 CCCCAGGATAAGAAATTTTTTCAAAGTCTTGATGGAATAATGTTCATCAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
106330 CCCCAGGATAAGAAATTTTTTCAAAGTCTTGATGGAATAATGTTCATCAA
200 . : . : . : . : . :
183 TAAATGTGCCACGTGCAAAATGATACT GGAAAAAGAAGCAA
|||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
106380 TAAATGTGCCACGTGCAAAATGATACTGTG...CAGGGAAAAAGAAGCAA
250 . : . : . : . : . :
224 AATCACAGAAGAGGGCCAGGCATTTAGCAAGAGCTCCCAAGGCTACTGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
108118 AATCACAGAAGAGGGCCAGGCATTTAGCAAGAGCTCCCAAGGCTACTGCC
300 . : . : . : . : . :
274 CCAACAGAG CTGAATTGTGATGATTTTAAAAAAGGAGAAAG
|||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
108168 CCAACAGAGGTG...CAGCTGAATTGTGATGATTTTAAAAAAGGAGAAAG
350 . : . : . : . : . :
315 AGATGGGGATTTTATCTGTCCTGATTATTATGAAGCTGTTTGTGGCACAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122393 AGATGGGGATTTTATCTGTCCTGATTATTATGAAGCTGTTTGTGGCACAG
400 . : . : . : . : . :
365 ATGGGAAAACATATGACAACAGATGTGCACTGTGTGCTGAGAATGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
122443 ATGGGAAAACATATGACAACAGATGTGCACTGTGTGCTGAGAATGCGTG.
450 . : . : . : . : . :
411 GAAAACCGGGTCCCAAATTGGTGTAAAAAGTGAAGGGGAATGTAA
..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
122493 ..TAGGAAAACCGGGTCCCAAATTGGTGTAAAAAGTGAAGGGGAATGTAA
500 . : . : . : . : . :
456 GAGCAGTAATCCAGAGCAG GATGTATGCAGTGCTTTTCGGC
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
124543 GAGCAGTAATCCAGAGCAGGTG...CAGGATGTATGCAGTGCTTTTCGGC
550 . : . : . : . : . :
497 CCTTTGTTAGAGATGGAAGACTTGGATGCACAAGGGAAAATGATCCTGTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125472 CCTTTGTTAGAGATGGAAGACTTGGATGCACAAGGGAAAATGATCCTGTT
600 . : . : . : . : . :
547 CTTGGTCCTGATGGGAAGACGCATGGCAATAAGTGTGCAATGTGTGCTGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
125522 CTTGGTCCTGATGGGAAGACGCATGGCAATAAGTGTGCAATGTGTGCTGA
650 . : . : . : . : . :
597 GCTGTT TTTAAAAGAAGCTGAAAATGCCAAGCGAGAGGGTG
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
125572 GCTGTTGTA...CAGTTTAAAAGAAGCTGAAAATGCCAAGCGAGAGGGTG
700 . : . : . : . : . :
638 AAACTAGAATTCGACGAAATGCTGAAAAG GATTTTTGCAAG
|||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
127156 AAACTAGAATTCGACGAAATGCTGAAAAGGTA...AAGGATTTTTGCAAG
750 . : . : . : . : . :
679 GAATATGAAAAACAAGTGAGAAATGGAAGGCTTTTTTGTACACGGGAGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130322 GAATATGAAAAACAAGTGAGAAATGGAAGGCTTTTTTGTACACGGGAGAG
800 . : . : . : . : . :
729 TGATCCAGTCCGTGGCCCTGACGGCAGGATGCATGGCAACAAATGTGCCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
130372 TGATCCAGTCCGTGGCCCTGACGGCAGGATGCATGGCAACAAATGTGCCC
850 . : . : . : . : . :
779 TGTGTGCTGAAATTTT CAAGCAGCGTTTTTCAGAGGAAAAC
||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
130422 TGTGTGCTGAAATTTTGTG...CAGCAAGCAGCGTTTTTCAGAGGAAAAC
900 . : . : . : . : . :
820 AGTAAAACAGATCAAAATTTGGGAAAAGCTGAAGAAAAAACTAAAGTTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
131799 AGTAAAACAGATCAAAATTTGGGAAAAGCTGAAGAAAAAACTAAAGTTAA
950 . : . : . : . : . :
870 AAGAGAAATTGTG AAACTCTGCAGTCAATATCAAAATCAGG
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
131849 AAGAGAAATTGTGGTG...CAGAAACTCTGCAGTCAATATCAAAATCAGG
1000 . : . : . : . : . :
911 CAAAGAATGGAATACTTTTCTGTACCAGAGAAAATGACCCTATTCGTGGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133851 CAAAGAATGGAATACTTTTCTGTACCAGAGAAAATGACCCTATTCGTGGT
1050 . : . : . : . : . :
961 CCAGATGGGAAAATGCATGGCAACTTGTGTTCCATGTGTCAAGCCTACTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133901 CCAGATGGGAAAATGCATGGCAACTTGTGTTCCATGTGTCAAGCCTACTT
1100 . : . : . : . : . :
1011 CCAAGCAGAAAATGAAGAAAAGAAAAAGGCTGAAGCACGAG
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
133951 GTG...CAGCCAAGCAGAAAATGAAGAAAAGAAAAAGGCTGAAGCACGAG
1150 . : . : . : . : . :
1052 CTAGAAACAAAAGAGAATCTGGAAAAGCAACCTCATATGCA
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
135231 CTAGAAACAAAAGAGAATCTGGAAAAGCAACCTCATATGCAGTG...CAG
1200 . : . : . : . : . :
1093 GAGCTTTGCAGTGAATATCGAAAGCTTGTGAGGAACGGAAAACTTGCTTG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136410 GAGCTTTGCAGTGAATATCGAAAGCTTGTGAGGAACGGAAAACTTGCTTG
1250 . : . : . : . : . :
1143 CACCAGAGAGAACGATCCTATCCAGGGCCCAGATGGGAAAGTGCATGGCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
136460 CACCAGAGAGAACGATCCTATCCAGGGCCCAGATGGGAAAGTGCATGGCA
1300 . : . : . : . : . :
1193 ACACCTGCTCCATGTGTGAGGTCTTCTT CCAAGCAGAAGAA
||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
136510 ACACCTGCTCCATGTGTGAGGTCTTCTTGTG...TAGCCAAGCAGAAGAA
1350 . : . : . : . : . :
1234 GAAGAAAAGAAAAAGAAGGAAGGTAAATCAAGAAACAAAAGACAATCTAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137324 GAAGAAAAGAAAAAGAAGGAAGGTAAATCAAGAAACAAAAGACAATCTAA
1400 . : . : . : . : . :
1284 GAGTACAGCTTCCTTTGAG GAGTTGTGTAGTGAATACCGCA
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
137374 GAGTACAGCTTCCTTTGAGGTG...CAGGAGTTGTGTAGTGAATACCGCA
1450 . : . : . : . : . :
1325 AATCCAGGAAAAACGGACGGCTTTTTTGCACCAGAGAGAATGACCCCATC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137759 AATCCAGGAAAAACGGACGGCTTTTTTGCACCAGAGAGAATGACCCCATC
1500 . : . : . : . : . :
1375 CAGGGCCCAGATGGAAAAATGCATGGCAACACCTGCTCCATGTGTGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
137809 CAGGGCCCAGATGGAAAAATGCATGGCAACACCTGCTCCATGTGTGAGGC
1550 . : . : . : . : . :
1425 CTTCTT TCAACAAGAAGAAAGAGCAAGAGCAAAGGCTAAAA
||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
137859 CTTCTTGTG...AAGTCAACAAGAAGAAAGAGCAAGAGCAAAGGCTAAAA
1600 . : . : . : . : . :
1466 GAGAAGCTGCAAAG GAAATCTGCAGTGAATTTCGGGACCAA
||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
140943 GAGAAGCTGCAAAGGTA...CAGGAAATCTGCAGTGAATTTCGGGACCAA
1650 . : . : . : . : . :
1507 GTGAGGAATGGAACACTTATATGCACCAGGGAGCATAATCCTGTCCGTGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143020 GTGAGGAATGGAACACTTATATGCACCAGGGAGCATAATCCTGTCCGTGG
1700 . : . : . : . : . :
1557 CCCAGATGGCAAAATGCATGGAAACAAGTGTGCCATGTGTGCCAGTGTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143070 CCCAGATGGCAAAATGCATGGAAACAAGTGTGCCATGTGTGCCAGTGTGT
1750 . : . : . : . : . :
1607 T CAAACTTGAAGAAGAAGAGAAGAAAAATGATAAAGAAGAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
143120 TGTG...CAGCAAACTTGAAGAAGAAGAGAAGAAAAATGATAAAGAAGAA
1800 . : . : . : . : . :
1648 AAAGGGAAAGTCGAGGCTGAAAAAGTTAAGAGAGAAGCAGTTCAG
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
144749 AAAGGGAAAGTCGAGGCTGAAAAAGTTAAGAGAGAAGCAGTTCAGGTA..
1850 . : . : . : . : . :
1693 GAGCTGTGCAGTGAATATCGTCATTATGTGAGGAATGGACGACTCC
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
144799 .CAGGAGCTGTGCAGTGAATATCGTCATTATGTGAGGAATGGACGACTCC
1900 . : . : . : . : . :
1739 CCTGTACCAGAGAGAATGATCCTATTGAGGGTCTAGATGGGAAAATCCAC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
147770 CCTGTACCAGAGAGAATGATCCTATTGAGGGTCTAGATGGGAAAATCCAC
1950 . : . : . : . : . :
1789 GGCAACACCTGCTCCATGTGTGAAGCCTTCTT CCAGCAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
147820 GGCAACACCTGCTCCATGTGTGAAGCCTTCTTGTG...TAGCCAGCAAGA
2000 . : . : . : . : . :
1830 AGCAAAAGAAAAAGAAAGAGCTGAACCCAGAGCAAAAGTCAAAAGAGAAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
148833 AGCAAAAGAAAAAGAAAGAGCTGAACCCAGAGCAAAAGTCAAAAGAGAAG
2050 . : . : . : . : . :
1880 CTGAAAAG GAGACATGCGATGAATTTCGGAGACTTTTGCAA
||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
148883 CTGAAAAGGTA...TAGGAGACATGCGATGAATTTCGGAGACTTTTGCAA
2100 . : . : . : . : . :
1921 AATGGAAAACTTTTCTGCACAAGAGAAAATGATCCTGTGCGTGGCCCAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150351 AATGGAAAACTTTTCTGCACAAGAGAAAATGATCCTGTGCGTGGCCCAGA
2150 . : . : . : . : . :
1971 TGGCAAGACCCATGGCAACAAGTGTGCCATGTGTAAGGCAGTCTT
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
150401 TGGCAAGACCCATGGCAACAAGTGTGCCATGTGTAAGGCAGTCTTGTG..
2200 . : . : . : . : . :
2016 CCAGAAAGAAAATGAGGAAAGAAAGAGGAAAGAAGAGGAAGATCAG
.>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
150451 .CAGCCAGAAAGAAAATGAGGAAAGAAAGAGGAAAGAAGAGGAAGATCAG
2250 . : . : . : . : . :
2062 AGAAATGCTGCAGGACATGGTTCCAGTGGTGGTGGAGGAGGAAACACTCA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152372 AGAAATGCTGCAGGACATGGTTCCAGTGGTGGTGGAGGAGGAAACACTCA
2300 . : . : . : . : . :
2112 G GACGAATGTGCTGAGTATCGGGAACAAATGAAAAATGGAA
|>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
152422 GGTG...CAGGACGAATGTGCTGAGTATCGGGAACAAATGAAAAATGGAA
2350 . : . : . : . : . :
2153 GACTCAGCTGTACTCGGGAGAGTGATCCTGTACGTGATGCTGATGGCAAA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154433 GACTCAGCTGTACTCGGGAGAGTGATCCTGTACGTGATGCTGATGGCAAA
2400 . : . : . : . : . :
2203 TCGTACAACAATCAGTGTACCATGTGTAAAGCAAAATT GGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
154483 TCGTACAACAATCAGTGTACCATGTGTAAAGCAAAATTGTA...CAGGGA
2450 . : . : . : . : . :
2244 AAGAGAAGCAGAGAGAAAAAATGAGTATTCTCGCTCCAGATCAAATGGGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
154945 AAGAGAAGCAGAGAGAAAAAATGAGTATTCTCGCTCCAGATCAAATGGGA
2500 . : . : . : . : . :
2294 CTGGATCAGAATCAGGGAAG GATACATGTGATGAGTTTAGA
||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
154995 CTGGATCAGAATCAGGGAAGGTG...CAGGATACATGTGATGAGTTTAGA
2550 . : . : . : . : . :
2335 AGCCAAATGAAAAATGGAAAACTCATCTGCACTCGAGAAAGTGACCCTGT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
155986 AGCCAAATGAAAAATGGAAAACTCATCTGCACTCGAGAAAGTGACCCTGT
2600 . : . : . : . : . :
2385 CCGGGGTCCAGATGGCAAGACACATGGCAATAAGTGTACTATGTGTAAGG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156036 CCGGGGTCCAGATGGCAAGACACATGGCAATAAGTGTACTATGTGTAAGG
2650 . : . : . : . : . :
2435 AAAAACT GGAAAGGGAAGCAGCTGAAAAAAAAAAGAAAGAG
|||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
156086 AAAAACTGTG...CAGGGAAAGGGAAGCAGCTGAAAAAAAAAAGAAAGAG
2700 . : . : . : . : . :
2476 GATGAAGACAGGAGCAATACAGGAGAAAGGAGCAATACAGGAGAAAGGAG
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
156285 GATGAAGACAGGAGCAATACAGGAGAAAGGAGCAATACAGGAGAAAGGAG
2750 . : . : . : . : . :
2526 CAATGACAAAGAG GATCTGTGTCGTGAATTTCGAAGCATGC
|||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
156335 CAATGACAAAGAGGTA...TAGGATCTGTGTCGTGAATTTCGAAGCATGC
2800 . : . : . : . : . :
2567 AGAGAAATGGAAAGCTTATCTGCACCAGAGAAAATAACCCTGTTCGAGGC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159817 AGAGAAATGGAAAGCTTATCTGCACCAGAGAAAATAACCCTGTTCGAGGC
2850 . : . : . : . : . :
2617 CCATATGGCAAGATGCACATCAATAAATGTGCTATGTGTCAGAGCATCTT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159867 CCATATGGCAAGATGCACATCAATAAATGTGCTATGTGTCAGAGCATCTT
2900 . : . : . : . : . :
2667 TGATCGAGAAGCTAATGAAAGAAAAAAGAAAGATGAAGAGA
>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
159917 GTA...CAGTGATCGAGAAGCTAATGAAAGAAAAAAGAAAGATGAAGAGA
2950 . : . : . : . : . :
2708 AATCAAGTAGCAAGCCCTCAAATAATGCAAAG GATGAGTGC
||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
160762 AATCAAGTAGCAAGCCCTCAAATAATGCAAAGGTT...TAGGATGAGTGC
3000 . : . : . : . : . :
2749 AGTGAATTTCGAAACTATATAAGGAACAATGAACTCATCTGCCCTAGAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161688 AGTGAATTTCGAAACTATATAAGGAACAATGAACTCATCTGCCCTAGAGA
3050 . : . : . : . : . :
2799 GAATGACCCAGTGCACGGTGCTGATGGAAAGTTCTATACAAACAAGTGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
161738 GAATGACCCAGTGCACGGTGCTGATGGAAAGTTCTATACAAACAAGTGCT
3100 . : . : . : . : . :
2849 ACATGTGCAGAGCTGTCTT TCTAACAGAAGCTTTGGAAAGG
|||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
161788 ACATGTGCAGAGCTGTCTTGTG...TAGTCTAACAGAAGCTTTGGAAAGG
3150 . : . : . : . : . :
2890 GCAAAGCTTCAAGAAAAGCCATCCCATGTTAGAGCTTCTCAAGAGGAAGA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
162961 GCAAAGCTTCAAGAAAAGCCATCCCATGTTAGAGCTTCTCAAGAGGAAGA
3200 . : . : . : . : . :
2940 CAGCCCAGACTCTTTCAGTTCTCTG GATTCTGAGATGTGCA
|||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
163011 CAGCCCAGACTCTTTCAGTTCTCTGGTA...CAGGATTCTGAGATGTGCA
3250 . : . : . : . : . :
2981 AAGACTACCGAGTATTGCCCAGGATAGGTTATCTTTGTCCAAAGGATTTA
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167231 AAGACTACCGAGTATTGCCCAGGATAGGTTATCTTTGTCCAAAGGATTTA
3300 . : . : . : . : . :
3031 AAGCCTGTCTGTGGTGACGATGGCCAAACCTACAACAATCCTTGCATGCT
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
167281 AAGCCTGTCTGTGGTGACGATGGCCAAACCTACAACAATCCTTGCATGCT
3350 . : . : . : . : . :
3081 CTGTCATGAAAACCT GATACGCCAAACAAATACACACATCC
|||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
167331 CTGTCATGAAAACCTGTA...TAGGATACGCCAAACAAATACACACATCC
3400 . : . : . : . : . :
3122 GCAGTACAGGGAAGTGTGAGGAGAGCAGCACCCCAGGAACCACCGCAGCC
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
169779 GCAGTACAGGGAAGTGTGAGGAGAGCAGCACCCCAGGAACCACCGCAGCC
3450 . : . :
3172 AGCATGCCCCCGTCTGACGAA
|||||||||||||||| --||
169829 AGCATGCCCCCGTCTGT AA