seq1 = pF1KB7283.tfa, 2670 bp
seq2 = pF1KB7283/gi568815578f_2458454.tfa (gi568815578f:2458454_2741348), 282895 bp

>pF1KB7283 2670
>gi568815578f:2458454_2741348 (Chr20)

1-34  (78169-78202)   100% ->
35-353  (100003-100321)   100% ->
354-506  (103405-103557)   100% ->
507-597  (113726-113816)   100% ->
598-679  (120693-120774)   100% ->
680-786  (121497-121603)   100% ->
787-885  (133857-133955)   100% ->
886-1028  (136372-136514)   100% ->
1029-1176  (138698-138845)   100% ->
1177-1365  (143660-143848)   100% ->
1366-1545  (151966-152145)   100% ->
1546-1695  (153738-153887)   100% ->
1696-1824  (154741-154869)   100% ->
1825-1892  (157684-157751)   100% ->
1893-2132  (158619-158858)   100% ->
2133-2258  (165818-165943)   100% ->
2259-2337  (177473-177551)   100% ->
2338-2455  (179021-179138)   100% ->
2456-2670  (182681-182895)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCACCAGGTAAAGGGCCTGAAAGAGGAAG         GTGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
  78169 ATGAGCCACCAGGTAAAGGGCCTGAAAGAGGAAGGTG...CAGGTGACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 GCTGGGAAGGAGATCCTCAAGCAAGCGGGCTCTCAAAGCCGAGGGGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 GCTGGGAAGGAGATCCTCAAGCAAGCGGGCTCTCAAAGCCGAGGGGACCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CAGGCAGGCGCGGAGCTCAGCGAAGCCAGAAGGAGCGCGCCGGGGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100060 CAGGCAGGCGCGGAGCTCAGCGAAGCCAGAAGGAGCGCGCCGGGGGCAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAAGCCCGGGGTCTCCCCGGAGGAAGCAAACAGGGCGCAGGAGACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100110 CCAAGCCCGGGGTCTCCCCGGAGGAAGCAAACAGGGCGCAGGAGACACAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AGAAGAGCTGGGGGAGCAGGAGCGGGGCGAGGCAGAGAGGACCTGCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100160 AGAAGAGCTGGGGGAGCAGGAGCGGGGCGAGGCAGAGAGGACCTGCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCAGGAGAAAGCGCGACGAGAGGGCCTCCTTCCAGGAGCGGACAGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100210 GCAGGAGAAAGCGCGACGAGAGGGCCTCCTTCCAGGAGCGGACAGCAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CCAAAGAGGGAAAAGGAGATTCCGAGGAGGGAGGAGAAGTCGAAGCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100260 CCAAAGAGGGAAAAGGAGATTCCGAGGAGGGAGGAGAAGTCGAAGCGGCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GAAGAAACCCAG         GTCATCCTCCTTGGCCTCCAGTGCCTCTG
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100310 GAAGAAACCCAGGTG...CAGGTCATCCTCCTTGGCCTCCAGTGCCTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGGGGAGTCCCTGTCCGAGGAGGAACTGGCCCAGATCCTGGAGCAGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103434 GTGGGGAGTCCCTGTCCGAGGAGGAACTGGCCCAGATCCTGGAGCAGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GAAGAAAAAAAGAAGCTCATTGCCACCATGCGGAGCAAGCCCTGGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103484 GAAGAAAAAAAGAAGCTCATTGCCACCATGCGGAGCAAGCCCTGGCCCAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GGCGAAGAAGCTGACAGAGCTCAG         GGAGGCCCAGGAATTTG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 103534 GGCGAAGAAGCTGACAGAGCTCAGGTG...CAGGGAGGCCCAGGAATTTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGAGAAGTATGAAGGTGCCTTGGGAAAGGGGAAAGGCAAGCAACTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113743 TGGAGAAGTATGAAGGTGCCTTGGGAAAGGGGAAAGGCAAGCAACTATAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCCTACAAGATGCTGATGGCCAAG         AAATGGGTCAAATTTAA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 113793 GCCTACAAGATGCTGATGGCCAAGGTG...CAGAAATGGGTCAAATTTAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GAGAGACTTTGATAATTTCAAGACTCAATGTATCCCCTGGGAAATGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120710 GAGAGACTTTGATAATTTCAAGACTCAATGTATCCCCTGGGAAATGAAGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 TCAAGGACATTGAAA         GTCACTTTGGTTCTTCAGTGGCATCG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 120760 TCAAGGACATTGAAAGTG...TAGGTCACTTTGGTTCTTCAGTGGCATCG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 TATTTCATCTTTCTCCGATGGATGTATGGAGTTAACCTTGTCCTTTTTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121523 TATTTCATCTTTCTCCGATGGATGTATGGAGTTAACCTTGTCCTTTTTGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CTTAATATTTGGTCTAGTCATAATCCCAGAG         GTACTGATGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 121573 CTTAATATTTGGTCTAGTCATAATCCCAGAGGTA...AAGGTACTGATGG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 GCATGCCCTATGGGAGTATTCCCAGAAAGACAGTGCCTCGGGCTGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133867 GCATGCCCTATGGGAGTATTCCCAGAAAGACAGTGCCTCGGGCTGAGGAA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 GAAAAGGCCATGGATTTTTCTGTCCTTTGGGATTTTGAG         GG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 133917 GAAAAGGCCATGGATTTTTCTGTCCTTTGGGATTTTGAGGTA...CAGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 CTATATCAAGTACTCTGCACTCTTCTATGGCTACTACAACAACCAGAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136374 CTATATCAAGTACTCTGCACTCTTCTATGGCTACTACAACAACCAGAGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 CCATCGGGTGGCTGAGGTACCGGCTGCCTATGGCTTACTTTATGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136424 CCATCGGGTGGCTGAGGTACCGGCTGCCTATGGCTTACTTTATGGTGGGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 GTCAGCGTGTTCGGCTACAGCCTGATTATTGTCATTCGATC         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 136474 GTCAGCGTGTTCGGCTACAGCCTGATTATTGTCATTCGATCGTA...CAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GATGGCCAGCAATACCCAAGGAAGCACAGGCGAAGGGGAGAGTGACAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138698 GATGGCCAGCAATACCCAAGGAAGCACAGGCGAAGGGGAGAGTGACAACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCACATTCAGCTTCAAGATGTTCACCAGCTGGGACTACCTGATCGGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138748 TCACATTCAGCTTCAAGATGTTCACCAGCTGGGACTACCTGATCGGGAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCAGAGACAGCTGATAACAAATATGCATCCATCACCACCAGCTTCAAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 138798 TCAGAGACAGCTGATAACAAATATGCATCCATCACCACCAGCTTCAAGGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1177        GAATCAATAGTGGATGAACAAGAGAGTAACAAAGAAGAAAATA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138848 A...AAGGAATCAATAGTGGATGAACAAGAGAGTAACAAAGAAGAAAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCCATCTGACAAGATTTCTTCGTGTCCTGGCCAACTTTCTCATCATCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143703 TCCATCTGACAAGATTTCTTCGTGTCCTGGCCAACTTTCTCATCATCTGC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TGTTTGTGTGGAAGTGGGTACCTCATTTACTTTGTGGTTAAGCGATCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143753 TGTTTGTGTGGAAGTGGGTACCTCATTTACTTTGTGGTTAAGCGATCTCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 GCAATTCTCCAAAATGCAGAATGTCAGCTGGTATGAAAGGAATGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 143803 GCAATTCTCCAAAATGCAGAATGTCAGCTGGTATGAAAGGAATGAGGTA.

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1366      GTAGAGATCGTGATGTCCCTGCTTGGAATGTTTTGTCCCCCTCTG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143853 ..CAGGTAGAGATCGTGATGTCCCTGCTTGGAATGTTTTGTCCCCCTCTG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1411 TTTGAAACCATCGCTGCCCTGGAGAATTACCACCCACGCACTGGACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152011 TTTGAAACCATCGCTGCCCTGGAGAATTACCACCCACGCACTGGACTGAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1461 GTGGCAGCTGGGACGCATCTTTGCACTCTTCCTGGGGAACCTCTACACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152061 GTGGCAGCTGGGACGCATCTTTGCACTCTTCCTGGGGAACCTCTACACAT

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1511 TTCTCTTGGCCCTGATGGATGACGTCCACCTCAAG         CTTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 152111 TTCTCTTGGCCCTGATGGATGACGTCCACCTCAAGGTA...TAGCTTGCT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1552 AATGAAGAGACAATAAAGAACATCACTCACTGGACTCTGTTTAACTATTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153744 AATGAAGAGACAATAAAGAACATCACTCACTGGACTCTGTTTAACTATTA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1602 CAACTCTTCTGGTTGGAACGAGAGTGTCCCCCGACCACCCCTGCACCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153794 CAACTCTTCTGGTTGGAACGAGAGTGTCCCCCGACCACCCCTGCACCCTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1652 CAGATGTGCCCCGGGGTTCTTGCTGGGAGACAGCTGTGGGCATT      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 153844 CAGATGTGCCCCGGGGTTCTTGCTGGGAGACAGCTGTGGGCATTGTG...

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1696    GAATTCATGAGGCTGACGGTGTCTGACATGCTGGTAACGTACATCAC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154738 CAGGAATTCATGAGGCTGACGGTGTCTGACATGCTGGTAACGTACATCAC

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1743 CATCCTGCTGGGGGACTTCCTACGGGCTTGTTTTGTGCGGTTCATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154788 CATCCTGCTGGGGGACTTCCTACGGGCTTGTTTTGTGCGGTTCATGAACT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1793 ACTGCTGGTGCTGGGACTTGGAGGCTGGATTT         CCTTCATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 154838 ACTGCTGGTGCTGGGACTTGGAGGCTGGATTTGTA...TAGCCTTCATAT

   1950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1834 GCTGAGTTTGATATTAGTGGAAATGTGCTGGGTTTGATCTTCAACCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157693 GCTGAGTTTGATATTAGTGGAAATGTGCTGGGTTTGATCTTCAACCAAGG

   2000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1884 AATGATCTG         GATGGGCTCCTTCTATGCTCCAGGCCTGGTGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 157743 AATGATCTGGTG...CAGGATGGGCTCCTTCTATGCTCCAGGCCTGGTGG

   2050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1925 GCATTAATGTGCTGCGCCTGCTGACCTCCATGTACTTCCAGTGCTGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158651 GCATTAATGTGCTGCGCCTGCTGACCTCCATGTACTTCCAGTGCTGGGCG

   2100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1975 GTGATGAGCAGCAACGTACCCCATGAACGCGTGTTCAAAGCCTCCCGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158701 GTGATGAGCAGCAACGTACCCCATGAACGCGTGTTCAAAGCCTCCCGATC

   2150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2025 CAACAACTTCTACATGGGCCTCCTGCTGCTGGTGCTCTTCCTCAGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158751 CAACAACTTCTACATGGGCCTCCTGCTGCTGGTGCTCTTCCTCAGCCTCC

   2200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2075 TGCCGGTGGCCTACACCATCATGTCCCTCCCACCCTCCTTTGACTGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158801 TGCCGGTGGCCTACACCATCATGTCCCTCCCACCCTCCTTTGACTGCGGG

   2250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2125 CCGTTCAG         TGGGAAAAACAGAATGTACGATGTCCTCCAAGA
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 158851 CCGTTCAGGTG...CAGTGGGAAAAACAGAATGTACGATGTCCTCCAAGA

   2300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2166 GACCATTGAAAACGATTTCCCAACCTTCCTGGGCAAGATCTTTGCTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 165851 GACCATTGAAAACGATTTCCCAACCTTCCTGGGCAAGATCTTTGCTTTCC

   2350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2216 TCGCCAATCCAGGCCTGATCATCCCAGCCATCCTGCTGATGTT       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 165901 TCGCCAATCCAGGCCTGATCATCCCAGCCATCCTGCTGATGTTGTA...C

   2400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2259   CTTGGCCATTTACTACCTGAACTCAGTTTCCAAAAGCCTTTCCCGAGC
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 177471 AGCTTGGCCATTTACTACCTGAACTCAGTTTCCAAAAGCCTTTCCCGAGC

   2450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2307 TAATGCCCAGCTGAGGAAGAAAATCCAAGTG         CTCCGTGAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 177521 TAATGCCCAGCTGAGGAAGAAAATCCAAGTGGTG...CAGCTCCGTGAAG

   2500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2348 TTGAGAAGAGTCACAAATCTGTAAAAGGCAAAGCCACAGCCAGAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179031 TTGAGAAGAGTCACAAATCTGTAAAAGGCAAAGCCACAGCCAGAGATTCA

   2550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2398 GAGGACACACCTAAAAGCAGCTCCAAAAATGCCACCCAGCTCCAACTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 179081 GAGGACACACCTAAAAGCAGCTCCAAAAATGCCACCCAGCTCCAACTCAC

   2600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2448 CAAGGAAG         AGACCACTCCTCCCTCTGCCAGCCAAAGCCAGG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 179131 CAAGGAAGGTA...CAGAGACCACTCCTCCCTCTGCCAGCCAAAGCCAGG

   2650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2489 CCATGGACAAGAAGGCGCAGGGCCCTGGGACCTCCAATTCTGCCAGCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182714 CCATGGACAAGAAGGCGCAGGGCCCTGGGACCTCCAATTCTGCCAGCAGG

   2700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2539 ACCACACTGCCTGCCTCTGGACACCTTCCTATATCTCGGCCCCCTGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182764 ACCACACTGCCTGCCTCTGGACACCTTCCTATATCTCGGCCCCCTGGAAT

   2750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   2589 CGGACCAGATTCTGGCCACGCCCCATCTCAGACTCATCCGTGGAGGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 182814 CGGACCAGATTCTGGCCACGCCCCATCTCAGACTCATCCGTGGAGGTCAG

   2800     .    :    .    :    .    :
   2639 CCTCTGGAAAGAGTGCTCAGAGACCTCCCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||
 182864 CCTCTGGAAAGAGTGCTCAGAGACCTCCCCAC