seq1 = pF1KB7241.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KB7241/gi568815592r_31576960.tfa (gi568815592r:31576960_31780364), 203405 bp

>pF1KB7241 441
>gi568815592r:31576960_31780364 (Chr6)

(complement)

1-112  (100001-100112)   100% ->
113-280  (101097-101264)   100% ->
281-441  (103245-103405)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCAGGCCCTGCAGGGAGCCAGAGTCTGGGTCCCCTGTGCTTCCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCAGGCCCTGCAGGGAGCCAGAGTCTGGGTCCCCTGTGCTTCCACAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGCCCCCAAGCCCTCTACACGGTCCTCTTAATAGTGCTGGTCATGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGCCCCCAAGCCCTCTACACGGTCCTCTTAATAGTGCTGGTCATGATGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTGGTGTTTG         GTAAGTTTGTTCCTGTCAATTGGGAACCC
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCTTGGTGTTTGGTA...TAGGTAAGTTTGTTCCTGTCAATTGGGAACCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCTCAACCACTTCCATTCCCCAAATACCTGCGCTGCTACCGATGCCTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101126 CCTCAACCACTTCCATTCCCCAAATACCTGCGCTGCTACCGATGCCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGAGACCAAGGAGTTAGGGTGCCTTCTGGGATCTGACATCTGCCTCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101176 GGAGACCAAGGAGTTAGGGTGCCTTCTGGGATCTGACATCTGCCTCACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CAGCTGGCAGCAGCTGCATCACTCTCCACAAAAAGAACA         GC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 101226 CAGCTGGCAGCAGCTGCATCACTCTCCACAAAAAGAACAGTA...CAGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGCGGTTCTGACGTCATGGTGAGTGACTGCCGAAGTAAGGAGCAGATGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103247 AGCGGTTCTGACGTCATGGTGAGTGACTGCCGAAGTAAGGAGCAGATGAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGATTGTTCAAATACCCGAACTTCTCCGGTGTCTGGCTTCTGGATATTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103297 TGATTGTTCAAATACCCGAACTTCTCCGGTGTCTGGCTTCTGGATATTCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTCAATACTGCTTCCTGGATTTCTGCAATGACCCTCAAAACAGAGGGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103347 CTCAATACTGCTTCCTGGATTTCTGCAATGACCCTCAAAACAGAGGGCTC

    450     .
    433 TATACTCCT
        |||||||||
 103397 TATACTCCT