seq1 = pF1KB7236.tfa, 933 bp
seq2 = pF1KB7236/gi568815579f_9913498.tfa (gi568815579f:9913498_10121746), 208249 bp

>pF1KB7236 933
>gi568815579f:9913498_10121746 (Chr19)

1-103  (100001-100103)   100% ->
104-262  (103560-103718)   100% ->
263-442  (105234-105413)   100% ->
443-536  (107212-107305)   100% ->
537-720  (107758-107941)   100% ->
721-933  (108037-108249)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGCTGCACCCCGGACTGTGTTGATCTCCGGCTGCTCATCAGGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGCTGCACCCCGGACTGTGTTGATCTCCGGCTGCTCATCAGGAAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGTCTGGAACTTGCAGTGCAACTGGCCCATGACCCCAAGAAGCGCTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGTCTGGAACTTGCAGTGCAACTGGCCCATGACCCCAAGAAGCGCTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGG         TCGTGGCCACCATGAGGGACCTGGGGAAGAAGGAGACA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGGTA...CAGTCGTGGCCACCATGAGGGACCTGGGGAAGAAGGAGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGGAGGCAGCTGCTGGGGAGGCTCTGGGGCAGACCCTCACCGTGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103598 CTGGAGGCAGCTGCTGGGGAGGCTCTGGGGCAGACCCTCACCGTGGCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCTGGACGTGTGCAGTGATGAGTCGGTGGCCCAGTGTCTCAGCTGTATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103648 GCTGGACGTGTGCAGTGATGAGTCGGTGGCCCAGTGTCTCAGCTGTATCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGGGAGAAGTGGACGTGCTGG         TGAATAATGCTGGAATGGGC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 103698 AGGGAGAAGTGGACGTGCTGGGTG...TAGTGAATAATGCTGGAATGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGGTGGGGCCCCTGGAGGGGCTCAGCCTTGCTGCCATGCAGAATGTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105254 CTGGTGGGGCCCCTGGAGGGGCTCAGCCTTGCTGCCATGCAGAATGTCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TGACACCAACTTTTTCGGAGCTGTCCGTCTCGTCAAAGCTGTGCTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105304 TGACACCAACTTTTTCGGAGCTGTCCGTCTCGTCAAAGCTGTGCTTCCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GCATGAAGAGGAGGCGGCAGGGCCACATCGTGGTGATCAGCAGTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105354 GCATGAAGAGGAGGCGGCAGGGCCACATCGTGGTGATCAGCAGTGTCATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCCTGCAGG         GTGTCATCTTCAACGATGTCTATGCAGCTTC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 105404 GGCCTGCAGGGTG...CAGGTGTCATCTTCAACGATGTCTATGCAGCTTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CAAGTTCGCCCTGGAGGGATTCTTCGAAAGCCTCGCTATCCAGCTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107243 CAAGTTCGCCCTGGAGGGATTCTTCGAAAGCCTCGCTATCCAGCTGCTGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 AGTTCAACATCTT         CATCTCCCTGGTGGAGCCAGGCCCCGTG
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 107293 AGTTCAACATCTTGTG...CAGCATCTCCCTGGTGGAGCCAGGCCCCGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GTCACCGAGTTTGAGGGGAAGCTTCTGGCGCAGGTTTCTATGGCTGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107786 GTCACCGAGTTTGAGGGGAAGCTTCTGGCGCAGGTTTCTATGGCTGAGTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CCCAGGCACTGACCCTGAGACCCTGCACTACTTCCGGGACCTCTATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107836 CCCAGGCACTGACCCTGAGACCCTGCACTACTTCCGGGACCTCTATCTCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 CAGCCTCCAGGAAGCTGTTTTGCTCCGTGGGACAGAACCCACAGGACGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107886 CAGCCTCCAGGAAGCTGTTTTGCTCCGTGGGACAGAACCCACAGGACGTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 GTTCAG         GCCATTGTCAACGTCATCAGCTCGACTCGACCACC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107936 GTTCAGGTG...CAGGCCATTGTCAACGTCATCAGCTCGACTCGACCACC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CCTGCGCCGACAGACCAACATCCGCTACTCGCCGCTGACCACGCTCAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108072 CCTGCGCCGACAGACCAACATCCGCTACTCGCCGCTGACCACGCTCAAAA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCGTGGATTCCTCTGGCAGCCTGTATGTGCGAACGACCCACCGCCTCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108122 CCGTGGATTCCTCTGGCAGCCTGTATGTGCGAACGACCCACCGCCTCCTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TTCCGCTGTCCACGCCTCCTCAACCTTGGCCTTCAATGTCTGTCCTGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108172 TTCCGCTGTCCACGCCTCCTCAACCTTGGCCTTCAATGTCTGTCCTGCGG

    950     .    :    .    :    .
    906 CTGCCTCCCAACGCGGGTGCGGCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||
 108222 CTGCCTCCCAACGCGGGTGCGGCCAAGA