seq1 = pF1KB7166.tfa, 1188 bp
seq2 = pF1KB7166/gi568815581r_44704630.tfa (gi568815581r:44704630_44905817), 201188 bp

>pF1KB7166 1188
>gi568815581r:44704630_44905817 (Chr17)

(complement)

1-1188  (100001-101188)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTGGAGCTTCCTGACTCGCCTGCTAGAGGAGATTCACAACCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTGGAGCTTCCTGACTCGCCTGCTAGAGGAGATTCACAACCATTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACATTTGTGGGGAAGATCTGGCTCACTGTTCTGATTGTCTTCCGGATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACATTTGTGGGGAAGATCTGGCTCACTGTTCTGATTGTCTTCCGGATCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCCTTACAGCTGTAGGAGGAGAATCCATCTATTACGATGAGCAAAGCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCCTTACAGCTGTAGGAGGAGAATCCATCTATTACGATGAGCAAAGCAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTTGTGTGCAACACAGAACAGCCGGGCTGTGAGAATGTCTGTTATGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTTGTGTGCAACACAGAACAGCCGGGCTGTGAGAATGTCTGTTATGATGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTTGCACCTCTCTCCCATGTACGCTTCTGGGTGTTCCAGATCATCCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTTGCACCTCTCTCCCATGTACGCTTCTGGGTGTTCCAGATCATCCTGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGCAACTCCCTCTGTGATGTACCTGGGCTATGCTATCCACAAGATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGCAACTCCCTCTGTGATGTACCTGGGCTATGCTATCCACAAGATTGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AAAATGGAGCACGGTGAAGCAGACAAGAAGGCAGCTCGGAGCAAGCCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AAAATGGAGCACGGTGAAGCAGACAAGAAGGCAGCTCGGAGCAAGCCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGCAATGCGCTGGAAACAACACCGGGCTCTGGAAGAAACGGAGGAGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGCAATGCGCTGGAAACAACACCGGGCTCTGGAAGAAACGGAGGAGGACA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 ACGAAGAGGATCCTATGATGTATCCAGAGATGGAGTTAGAAAGTGATAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 ACGAAGAGGATCCTATGATGTATCCAGAGATGGAGTTAGAAAGTGATAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GAAAATAAAGAGCAGAGCCAACCCAAACCTAAGCATGATGGCCGACGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GAAAATAAAGAGCAGAGCCAACCCAAACCTAAGCATGATGGCCGACGACG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GATTCGGGAAGATGGGCTCATGAAAATCTATGTGCTGCAGTTGCTGGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GATTCGGGAAGATGGGCTCATGAAAATCTATGTGCTGCAGTTGCTGGCAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGACCGTGTTTGAGGTGGGTTTTCTGATAGGGCAGTATTTTCTGTATGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGACCGTGTTTGAGGTGGGTTTTCTGATAGGGCAGTATTTTCTGTATGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTCCAAGTCCACCCGTTTTATGTGTGCAGCAGACTTCCTTGTCCTCATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTCCAAGTCCACCCGTTTTATGTGTGCAGCAGACTTCCTTGTCCTCATAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GATAGACTGCTTTATTTCTAGACCCACTGAAAAGACCATCTTCCTTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GATAGACTGCTTTATTTCTAGACCCACTGAAAAGACCATCTTCCTTCTGA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TAATGTATGGTGTTACAGGCCTTTGCCTCTTGCTTAACATTTGGGAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TAATGTATGGTGTTACAGGCCTTTGCCTCTTGCTTAACATTTGGGAGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CTTCATTTAGGGTTTGGGACCATTCGAGACTCACTAAACAGTAAAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CTTCATTTAGGGTTTGGGACCATTCGAGACTCACTAAACAGTAAAAGGAG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGAACTTGAGGATCCGGGTGCTTATAATTATCCTTTCACTTGGAATACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGAACTTGAGGATCCGGGTGCTTATAATTATCCTTTCACTTGGAATACAC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CATCTGCTCCCCCTGGCTATAACATTGCTGTCAAACCAGATCAAATCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CATCTGCTCCCCCTGGCTATAACATTGCTGTCAAACCAGATCAAATCCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TACACCGAACTGTCCAATGCTAAGATCGCCTACAAGCAAAACAAGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TACACCGAACTGTCCAATGCTAAGATCGCCTACAAGCAAAACAAGGCCAA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACAGCCCAGGAACAGCAGTATGGCAGCCATGAGGAGAACCTCCCAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACAGCCCAGGAACAGCAGTATGGCAGCCATGAGGAGAACCTCCCAGCTG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 ACCTGGAGGCTCTGCAGCGGGAGATCAGGATGGCTCAGGAACGCTTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 ACCTGGAGGCTCTGCAGCGGGAGATCAGGATGGCTCAGGAACGCTTGGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CTGGCAGTTCAGGCCTACAGTCACCAAAACAACCCTCATGGTCCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CTGGCAGTTCAGGCCTACAGTCACCAAAACAACCCTCATGGTCCCCGGGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 GAAGAAGGCCAAAGTGGGGTCCAAAGCTGGGTCCAACAAAAGCACTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 GAAGAAGGCCAAAGTGGGGTCCAAAGCTGGGTCCAACAAAAGCACTGCCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .
   1151 GTAGCAAATCAGGGGATGGGAAGACCTCCGTCTGGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 GTAGCAAATCAGGGGATGGGAAGACCTCCGTCTGGATT