seq1 = pF1KB7161.tfa, 1119 bp
seq2 = pF1KB7161/gi568815575r_142102869.tfa (gi568815575r:142102869_142303987), 201119 bp

>pF1KB7161 1119
>gi568815575r:142102869_142303987 (ChrX)

(complement)

1-1119  (100001-101119)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTCCCGTTCCAGGCGTTCCATTCCGCAACGTTGACAACGACTCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTCCCGTTCCAGGCGTTCCATTCCGCAACGTTGACAACGACTCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GACCTCAGTTGAGTTAGAAGACTGGGTAGATGCACAGCATCCCACAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GACCTCAGTTGAGTTAGAAGACTGGGTAGATGCACAGCATCCCACAGATG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGAAGAGGAGGAAGCCTCCTCCGCCTCTTCCACTTTGTACTTAGTATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGGAAGAGGAGGAAGCCTCCTCCGCCTCTTCCACTTTGTACTTAGTATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCCCCCTCTTCTTTCTCCACATCCTCTTCTCTGATTCTTGGTGGTCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCCCCCTCTTCTTTCTCCACATCCTCTTCTCTGATTCTTGGTGGTCCTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGAGGAGGAGGTGCCCTCTGGTGTGATACCAAATCTTACCGAGAGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGAGGAGGAGGTGCCCTCTGGTGTGATACCAAATCTTACCGAGAGCATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CCAGTAGTCCTCCACAGGGTCCTCCACAGGGTCCTTCCCAGAGTCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CCAGTAGTCCTCCACAGGGTCCTCCACAGGGTCCTTCCCAGAGTCCTCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 AGCTCCTGCTGCTCCTCTTTTTCATGGAGCTCATTCAGTGAGGAGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 AGCTCCTGCTGCTCCTCTTTTTCATGGAGCTCATTCAGTGAGGAGTCCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CAGCCAGAAAGGGGAGGATACAGGCACCTGTCAGGGCCTGCCAGACAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CAGCCAGAAAGGGGAGGATACAGGCACCTGTCAGGGCCTGCCAGACAGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGTCCTCTTTCACATATACACTAGATGAAAAGGTGGCCGAGTTAGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGTCCTCTTTCACATATACACTAGATGAAAAGGTGGCCGAGTTAGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTCCTGCTCCTCAAATACGAAGCAGAGGAGCCTGTAACAGAGGCAGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTCCTGCTCCTCAAATACGAAGCAGAGGAGCCTGTAACAGAGGCAGAGAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GCTGATGATTGTCATCAAGTACAAAGATTACTTTCCTGTGATACTCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GCTGATGATTGTCATCAAGTACAAAGATTACTTTCCTGTGATACTCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGCCCGTGAGTTCATGGAGCTTCTTTTTGGCCTTGCCCTGATAGAAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGCCCGTGAGTTCATGGAGCTTCTTTTTGGCCTTGCCCTGATAGAAGTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GGCCCTGACCACTTCTGTGTGTTTGCAAACACAGTAGGCCTCACCGATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GGCCCTGACCACTTCTGTGTGTTTGCAAACACAGTAGGCCTCACCGATGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGTAGTGATGATGAGGGCATGCCCGAGAACAGCCTCCTGATTATTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGTAGTGATGATGAGGGCATGCCCGAGAACAGCCTCCTGATTATTATTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGAGTGTGATCTTCATAAAGGGCAACTGTGCCTCTGAGGAGGTCATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGAGTGTGATCTTCATAAAGGGCAACTGTGCCTCTGAGGAGGTCATCTGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GAAGTGCTGAATGCAGTAGGGGTATATGCTGGGAGGGAGCACTTCGTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GAAGTGCTGAATGCAGTAGGGGTATATGCTGGGAGGGAGCACTTCGTCTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TGGGGAGCCTAGGGAGCTCCTCACTAAAGTTTGGGTGCAGGGACATTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TGGGGAGCCTAGGGAGCTCCTCACTAAAGTTTGGGTGCAGGGACATTACC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TGGAGTATCGGGAGGTGCCCCACAGTTCTCCTCCATATTATGAATTCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TGGAGTATCGGGAGGTGCCCCACAGTTCTCCTCCATATTATGAATTCCTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TGGGGTCCAAGAGCCCATTCAGAAAGCATCAAGAAGAAAGTACTAGAGTT
        |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TGGGGTCCGAGAGCCCATTCAGAAAGCATCAAGAAGAAAGTACTAGAGTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TTTAGCCAAGCTGAACAACACTGTTCCTAGTTCCTTTCCATCCTGGTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TTTAGCCAAGCTGAACAACACTGTTCCTAGTTCCTTTCCATCCTGGTACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 AGGATGCTTTGAAAGATGTGGAAGAGAGAGTCCAGGCCACAATTGATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 AGGATGCTTTGAAAGATGTGGAAGAGAGAGTCCAGGCCACAATTGATACC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GCAGATGATGCCACTGTCATGGCCAGTGAAAGCCTCAGTGTCATGTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GCAGATGATGCCACTGTCATGGCCAGTGAAAGCCTCAGTGTCATGTCCAG

   1100     .    :    .
   1101 CAACGTCTCCTTTTCTGAG
        |||||||||||||||||||
 101101 CAACGTCTCCTTTTCTGAG