seq1 = pF1KB7134.tfa, 960 bp
seq2 = pF1KB7134/gi568815587r_4581752.tfa (gi568815587r:4581752_4782711), 200960 bp

>pF1KB7134 960
>gi568815587r:4581752_4782711 (Chr11)

(complement)

1-960  (100001-100960)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGTTCCTGCAACTTCACACATGCCACCTTTGTGCTTATTGGTATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGTTCCTGCAACTTCACACATGCCACCTTTGTGCTTATTGGTATCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGGATTAGAGAAAGCCCATTTCTGGGTTGGCTTCCCCCTCCTTTCCATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGGATTAGAGAAAGCCCATTTCTGGGTTGGCTTCCCCCTCCTTTCCATGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGTAGTGGCAATGTTTGGAAACTGCATCGTGGTCTTCATCGTAAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGTAGTGGCAATGTTTGGAAACTGCATCGTGGTCTTCATCGTAAGGACG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAACGCAGCCTGCACGCTCCGATGTACCTCTTTCTCTGCATGCTTGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAACGCAGCCTGCACGCTCCGATGTACCTCTTTCTCTGCATGCTTGCAGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTGACCTGGCCTTATCCACATCCACCATGCCTAAGATCCTTGCCCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTGACCTGGCCTTATCCACATCCACCATGCCTAAGATCCTTGCCCTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTGGTTTGATTCCCGAGAGATTAGCTTTGAGGCCTGTCTTACCCAGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCTGGTTTGATTCCCGAGAGATTAGCTTTGAGGCCTGTCTTACCCAGATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCTTTATTCATGCCCTCTCAGCCATTGAATCCACCATCCTGCTGGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCTTTATTCATGCCCTCTCAGCCATTGAATCCACCATCCTGCTGGCCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGCCTTTGACCGTTATGTGGCCATCTGCCACCCACTGCGCCATGCTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGCCTTTGACCGTTATGTGGCCATCTGCCACCCACTGCGCCATGCTGCAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTCAACAATACAGTAACAGCCCAGATTGGCATCGTGGCTGTGGTCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTCAACAATACAGTAACAGCCCAGATTGGCATCGTGGCTGTGGTCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GGATCCCTCTTTTTTTTCCCACTGCCTCTGCTGATCAAGCGGCTGGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GGATCCCTCTTTTTTTTCCCACTGCCTCTGCTGATCAAGCGGCTGGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CTGCCACTCCAATGTCCTCTCGCACTCCTATTGTGTCCACCAGGATGTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CTGCCACTCCAATGTCCTCTCGCACTCCTATTGTGTCCACCAGGATGTAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TGAAGTTGGCCTATGCAGACACTTTGCCCAATGTGGTATATGGTCTTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TGAAGTTGGCCTATGCAGACACTTTGCCCAATGTGGTATATGGTCTTACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCATTCTGCTGGTCATGGGCGTGGACGTAATGTTCATCTCCTTGTCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCATTCTGCTGGTCATGGGCGTGGACGTAATGTTCATCTCCTTGTCCTA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TTTTCTGATAATACGAACGGTTCTGCAACTGCCTTCCAAGTCAGAGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TTTTCTGATAATACGAACGGTTCTGCAACTGCCTTCCAAGTCAGAGCGGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAAGGCCTTTGGAACCTGTGTGTCACACATTGGTGTGGTACTCGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAAGGCCTTTGGAACCTGTGTGTCACACATTGGTGTGGTACTCGCCTTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGTGCCACTTATTGGCCTCTCAGTTGTACACCGCTTTGGAAACAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
 100751 TATGTGCCACTTATTGGCCTCTCAGTGGTACACCGCTTTGGAAACAGCCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 TCATCCCATTGTGCGTGTTGTCATGGGTGACATCTACCTGCTGCTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 TCATCCCATTGTGCGTGTTGTCATGGGTGACATCTACCTGCTGCTGCCTC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGTCATCAATCCCATCATCTATGGTGCCAAAACCAAACAGATCAGAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGTCATCAATCCCATCATCTATGGTGCCAAAACCAAACAGATCAGAACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGGGTGCTGGCTATGTTCAAGATCAGCTGTGACAAGGACTTGCAGGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGGGTGCTGGCTATGTTCAAGATCAGCTGTGACAAGGACTTGCAGGCTGT

    950     .    :
    951 GGGAGGCAAG
        ||||||||||
 100951 GGGAGGCAAG