seq1 = pF1KB7096.tfa, 579 bp
seq2 = pF1KB7096/gi568815593r_42939468.tfa (gi568815593r:42939468_43140046), 200579 bp

>pF1KB7096 579
>gi568815593r:42939468_43140046 (Chr5)

(complement)

1-579  (100001-100579)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCAACATTTTCTTGGCTGTGTGAAGCGGGCTTGGGATTCCGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCAACATTTTCTTGGCTGTGTGAAGCGGGCTTGGGATTCCGCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGGCGCCAGAGCCCCAGCCTCCACCTATTGTGAGTTCAGAAGATCGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGGCGCCAGAGCCCCAGCCTCCACCTATTGTGAGTTCAGAAGATCGTG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GGCCGTGGCCTCTTCCTTTGTATCCAGTACTAGGAGAGTACTCACTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GGCCGTGGCCTCTTCCTTTGTATCCAGTACTAGGAGAGTACTCACTGGAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCTGTGATTTGGGACTGCTTTCCAGCCCTTGCTGGCGGCTGCCCGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCTGTGATTTGGGACTGCTTTCCAGCCCTTGCTGGCGGCTGCCCGGAGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTACTGGCAAAACGGACTCTCTCCTGGAGTCCAGAGCACCTTGGAACCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTACTGGCAAAACGGACTCTCTCCTGGAGTCCAGAGCACCTTGGAACCAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GTACAGCGAAGCCCACTGAGTTCAGTTGGCCGGGGACACAGAAGCAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GTACAGCGAAGCCCACTGAGTTCAGTTGGCCGGGGACACAGAAGCAGCAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGCACCCGTAGAAGAGGTGGGGCAGGCAGAGGAACCCGACAGACTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGCACCCGTAGAAGAGGTGGGGCAGGCAGAGGAACCCGACAGACTCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCCAGCAGCTTCCCTGGAGCAGTCCTCTCCATCCCTGGGACAGACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCCAGCAGCTTCCCTGGAGCAGTCCTCTCCATCCCTGGGACAGACAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGACACCGAGGTCTGTGACAGCGGGTGCCTTTTGGAACGCCGCCATCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGACACCGAGGTCTGTGACAGCGGGTGCCTTTTGGAACGCCGCCATCCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCTGCCCTCCAGCCGTGGCGCCACCTCCCGGGTTTCTCAGACTGCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCTGCCCTCCAGCCGTGGCGCCACCTCCCGGGTTTCTCAGACTGCCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GTGGATTCTTCGCGTTGGTTTTGCCGCGTTCTCTGTACTCTGGGCGTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GTGGATTCTTCGCGTTGGTTTTGCCGCGTTCTCTGTACTCTGGGCGTGCT

    550     .    :    .    :    .
    551 GTTCACGGATCTGTGGAGCTAAGCAGCCT
        |||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GTTCACGGATCTGTGGAGCTAAGCAGCCT